RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584616.1

MIR3180-3-201, Transcript of microRNA 3180-3, humanhuman

BASIC

Gene MIR3180-3, Length 94 nt, Biotype miRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR3180-3-201ENST00000584616 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
MIR3180-3-201ENST00000584616 CASZ1Q86V15 1759 aa25■■□□□ 1.59
MIR3180-3-201ENST00000584616 PANK3Q9H999 370 aa25■■□□□ 1.59
MIR3180-3-201ENST00000584616 NCAPD2Q15021 1401 aa24.99■■□□□ 1.59
MIR3180-3-201ENST00000584616 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
MIR3180-3-201ENST00000584616 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
MIR3180-3-201ENST00000584616 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.99■■□□□ 1.59
MIR3180-3-201ENST00000584616 POLKQ9UBT6 870 aa24.98■■□□□ 1.59
MIR3180-3-201ENST00000584616 PAPPAQ13219 1627 aa24.97■■□□□ 1.59
MIR3180-3-201ENST00000584616 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.97■■□□□ 1.59
MIR3180-3-201ENST00000584616 NSD2O96028 1365 aa24.94■■□□□ 1.58
MIR3180-3-201ENST00000584616 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
MIR3180-3-201ENST00000584616 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.92■■□□□ 1.58
MIR3180-3-201ENST00000584616 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.92■■□□□ 1.58
MIR3180-3-201ENST00000584616 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.92■■□□□ 1.58
MIR3180-3-201ENST00000584616 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
MIR3180-3-201ENST00000584616 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
MIR3180-3-201ENST00000584616 LY75O60449 1722 aa24.91■■□□□ 1.58
MIR3180-3-201ENST00000584616 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
MIR3180-3-201ENST00000584616 SLC15A2Q16348 729 aa24.9■■□□□ 1.58
MIR3180-3-201ENST00000584616 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.89■■□□□ 1.58
MIR3180-3-201ENST00000584616 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
MIR3180-3-201ENST00000584616 EYA1Q99502 592 aa24.89■■□□□ 1.58
MIR3180-3-201ENST00000584616 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.87■■□□□ 1.57
MIR3180-3-201ENST00000584616 CYP27B1O15528 508 aa24.87■■□□□ 1.57
MIR3180-3-201ENST00000584616 STK32BQ9NY57 414 aa24.87■■□□□ 1.57
MIR3180-3-201ENST00000584616 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
MIR3180-3-201ENST00000584616 SPON1Q9HCB6 807 aa24.86■■□□□ 1.57
MIR3180-3-201ENST00000584616 ITGB4P16144 1822 aa24.86■■□□□ 1.57
MIR3180-3-201ENST00000584616 ZNF827Q17R98 1081 aa24.85■■□□□ 1.57
MIR3180-3-201ENST00000584616 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.85■■□□□ 1.57
MIR3180-3-201ENST00000584616 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.85■■□□□ 1.57
MIR3180-3-201ENST00000584616 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
MIR3180-3-201ENST00000584616 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.84■■□□□ 1.57
MIR3180-3-201ENST00000584616 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
MIR3180-3-201ENST00000584616 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.82■■□□□ 1.56
MIR3180-3-201ENST00000584616 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.82■■□□□ 1.56
MIR3180-3-201ENST00000584616 AKT1S1Q96B36 256 aa24.82■■□□□ 1.56
MIR3180-3-201ENST00000584616 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
MIR3180-3-201ENST00000584616 ZBTB7AO95365 584 aa24.8■■□□□ 1.56
MIR3180-3-201ENST00000584616 PTGER2P43116 358 aa24.8■■□□□ 1.56
MIR3180-3-201ENST00000584616 KCNQ4P56696 695 aa24.8■■□□□ 1.56
MIR3180-3-201ENST00000584616 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
MIR3180-3-201ENST00000584616 MORC1Q86VD1 984 aa24.79■■□□□ 1.56
MIR3180-3-201ENST00000584616 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.79■■□□□ 1.56
MIR3180-3-201ENST00000584616 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.79■■□□□ 1.56
MIR3180-3-201ENST00000584616 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.56
MIR3180-3-201ENST00000584616 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.77■■□□□ 1.56
MIR3180-3-201ENST00000584616 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
MIR3180-3-201ENST00000584616 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.76■■□□□ 1.55
MIR3180-3-201ENST00000584616 SPG7Q9UQ90 795 aa24.74■■□□□ 1.55
MIR3180-3-201ENST00000584616 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.74■■□□□ 1.55
MIR3180-3-201ENST00000584616 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.73■■□□□ 1.55
MIR3180-3-201ENST00000584616 MTFR1LQ9H019 292 aa24.73■■□□□ 1.55
MIR3180-3-201ENST00000584616 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
MIR3180-3-201ENST00000584616 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.71■■□□□ 1.55
MIR3180-3-201ENST00000584616 PHKG2P15735 406 aa24.71■■□□□ 1.55
MIR3180-3-201ENST00000584616 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.71■■□□□ 1.55
MIR3180-3-201ENST00000584616 PIGBQ92521 554 aa24.71■■□□□ 1.55
MIR3180-3-201ENST00000584616 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
MIR3180-3-201ENST00000584616 C5P01031 1676 aa24.7■■□□□ 1.54
MIR3180-3-201ENST00000584616 IL13P35225 146 aa24.69■■□□□ 1.54
MIR3180-3-201ENST00000584616 PALLDQ8WX93 1383 aa24.68■■□□□ 1.54
MIR3180-3-201ENST00000584616 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.68■■□□□ 1.54
MIR3180-3-201ENST00000584616 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.68■■□□□ 1.54
MIR3180-3-201ENST00000584616 KDRP35968 1356 aa24.66■■□□□ 1.54
MIR3180-3-201ENST00000584616 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.65■■□□□ 1.54
MIR3180-3-201ENST00000584616 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.64■■□□□ 1.53
MIR3180-3-201ENST00000584616 MTHFSP49914 203 aa24.63■■□□□ 1.53
MIR3180-3-201ENST00000584616 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
MIR3180-3-201ENST00000584616 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.63■■□□□ 1.53
MIR3180-3-201ENST00000584616 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
MIR3180-3-201ENST00000584616 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.62■■□□□ 1.53
MIR3180-3-201ENST00000584616 C4BP0C0L5 1744 aa24.61■■□□□ 1.53
MIR3180-3-201ENST00000584616 UTRNP46939 3433 aa24.61■■□□□ 1.53
MIR3180-3-201ENST00000584616 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
MIR3180-3-201ENST00000584616 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.61■■□□□ 1.53
MIR3180-3-201ENST00000584616 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.61■■□□□ 1.53
MIR3180-3-201ENST00000584616 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
MIR3180-3-201ENST00000584616 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
MIR3180-3-201ENST00000584616 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
MIR3180-3-201ENST00000584616 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.6■■□□□ 1.53
MIR3180-3-201ENST00000584616 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.59■■□□□ 1.53
MIR3180-3-201ENST00000584616 ARXQ96QS3 562 aa24.59■■□□□ 1.53
MIR3180-3-201ENST00000584616 SYT17Q9BSW7 474 aa24.59■■□□□ 1.53
MIR3180-3-201ENST00000584616 ATG3Q9NT62 314 aa24.59■■□□□ 1.53
MIR3180-3-201ENST00000584616 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.58■■□□□ 1.53
MIR3180-3-201ENST00000584616 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
MIR3180-3-201ENST00000584616 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.57■■□□□ 1.52
MIR3180-3-201ENST00000584616 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.57■■□□□ 1.52
MIR3180-3-201ENST00000584616 SIK1P57059 783 aa24.57■■□□□ 1.52
MIR3180-3-201ENST00000584616 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
MIR3180-3-201ENST00000584616 MAP3K5Q99683 1374 aa24.56■■□□□ 1.52
MIR3180-3-201ENST00000584616 DCAF5Q96JK2 942 aa24.56■■□□□ 1.52
MIR3180-3-201ENST00000584616 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.56■■□□□ 1.52
MIR3180-3-201ENST00000584616 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
MIR3180-3-201ENST00000584616 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.55■■□□□ 1.52
MIR3180-3-201ENST00000584616 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.54■■□□□ 1.52
MIR3180-3-201ENST00000584616 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
MIR3180-3-201ENST00000584616 ITPK1Q13572 414 aa24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.1 ms