RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 USP54Q70EL1 1684 aa11.34□□□□□ -0.59
GGA3-218ENST00000584243 POTECB2RU33 542 aa11.34□□□□□ -0.59
GGA3-218ENST00000584243 MPNDQ8N594 471 aa11.34□□□□□ -0.59
GGA3-218ENST00000584243 GCC1Q96CN9 775 aa11.34□□□□□ -0.59
GGA3-218ENST00000584243 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.59
GGA3-218ENST00000584243 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa11.33□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 MEGF6O75095 1541 aa11.32□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 ABCC6O95255 1503 aa11.32□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa11.32□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 RNF181Q9P0P0 153 aa11.32□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 ERBB3P21860 1342 aa11.32□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 LY75O60449 1722 aa11.32□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 LTBP1Q14766 1721 aa11.32□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 EXOC5O00471 708 aa11.31□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 SLC17A8Q8NDX2 589 aa11.31□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa11.31□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 KIF1BO60333 1816 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 KIF13BQ9NQT8 1826 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 AMIGO3Q86WK7 504 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 SIRT1Q96EB6 747 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 TSKSQ9UJT2 592 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 THSD7BQ9C0I4 1608 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 PASKQ96RG2 1323 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 TONSLQ96HA7 1378 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 A0A0G2JLW4 131 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 POTEIP0CG38 1075 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 POTEJP0CG39 1038 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 ITGAEP38570 1179 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 SBF1O95248 1867 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 WDR17Q8IZU2 1322 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 NUP155O75694 1391 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 KCNA4P22459 653 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-218ENST00000584243 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa11.27□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa11.27□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa11.26□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 GLTPD2A6NH11 291 aa11.26□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 GCP02774 474 aa11.26□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 NSD2O96028 1365 aa11.26□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 FCHSD2O94868 740 aa11.25□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 DGKZQ13574 1117 aa11.25□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 CHADLQ6NUI6 762 aa11.25□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa11.25□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 RASSF10A6NK89 507 aa11.24□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 KCNA3P22001 575 aa11.24□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 NEUROD1Q13562 356 aa11.24□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 PRAM1Q96QH2 718 aa11.24□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 CARD10Q9BWT7 1032 aa11.24□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa11.24□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 DPEP1P16444 411 aa11.23□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 MIER1Q8N108 512 aa11.23□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 TMEM88BA6NKF7 163 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 TGFB2P61812 414 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 DCAF5Q96JK2 942 aa11.22□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa11.21□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
GGA3-218ENST00000584243 ITSN1Q15811 1721 aa11.21□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 C5P01031 1676 aa11.2□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 KAT6BQ8WYB5 2073 aa11.2□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 ZBTB7CA1YPR0 619 aa11.2□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 CACNA1AO00555 2505 aa11.2□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 UNC80Q8N2C7 3258 aa11.2□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 PIK3C2GO75747 1445 aa11.19□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 CCER2I3L3R5 266 aa11.19□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 DEFB115Q30KQ5 88 aa11.19□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 ABTB2Q8N961 1025 aa11.19□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 VCANP13611 3396 aa11.19□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 RASSF7Q02833 373 aa11.18□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 NBPF15Q8N660 670 aa11.18□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 SLIT3O75094 1523 aa11.18□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 FLAD1Q8NFF5 587 aa11.17□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa11.17□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 RGPD5Q99666 1765 aa11.17□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 TIAM2Q8IVF5 1701 aa11.17□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 BRCA2P51587 3418 aa11.16□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 CCDC7Q96M83 1385 aa11.16□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 UBR3Q6ZT12 1888 aa11.15□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
GGA3-218ENST00000584243 TAF1LQ8IZX4 1826 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 WASLO00401 505 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 MMP10P09238 476 aa11.14□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GGA3-218ENST00000584243 DOT1LQ8TEK3 1739 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms