RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		33.43	■■■□□ 2.94
GPS1-223	ENST00000584229	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		33.43	■■■□□ 2.94
GPS1-223	ENST00000584229	NUDC	Q9Y266	331 aa		33.43	■■■□□ 2.94
GPS1-223	ENST00000584229	HMOX1	P09601	288 aa		33.42	■■■□□ 2.94
GPS1-223	ENST00000584229	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
GPS1-223	ENST00000584229	SBF2	Q86WG5	1849 aa		33.4	■■■□□ 2.94
GPS1-223	ENST00000584229	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
GPS1-223	ENST00000584229	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
GPS1-223	ENST00000584229	KDR	P35968	1356 aa		33.35	■■■□□ 2.93
GPS1-223	ENST00000584229	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93
GPS1-223	ENST00000584229	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	33.35	■■■□□ 2.93
GPS1-223	ENST00000584229	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		33.35	■■■□□ 2.93
GPS1-223	ENST00000584229	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		33.35	■■■□□ 2.93
GPS1-223	ENST00000584229	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		33.34	■■■□□ 2.93
GPS1-223	ENST00000584229	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		33.34	■■■□□ 2.93
GPS1-223	ENST00000584229	SPG7	Q9UQ90	795 aa		33.34	■■■□□ 2.93
GPS1-223	ENST00000584229	SOCS7	O14512	581 aa		33.32	■■■□□ 2.92
GPS1-223	ENST00000584229	EP400	Q96L91	3159 aa		33.31	■■■□□ 2.92
GPS1-223	ENST00000584229	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
GPS1-223	ENST00000584229	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
GPS1-223	ENST00000584229	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
GPS1-223	ENST00000584229	NHS	Q6T4R5	1651 aa		33.27	■■■□□ 2.92
GPS1-223	ENST00000584229	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	33.27	■■■□□ 2.92
GPS1-223	ENST00000584229	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
GPS1-223	ENST00000584229	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		33.25	■■■□□ 2.91
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM37	O94972	964 aa		33.25	■■■□□ 2.91
GPS1-223	ENST00000584229	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		33.25	■■■□□ 2.91
GPS1-223	ENST00000584229	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		33.24	■■■□□ 2.91
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
GPS1-223	ENST00000584229	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	33.24	■■■□□ 2.91
GPS1-223	ENST00000584229	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		33.23	■■■□□ 2.91
GPS1-223	ENST00000584229	PRKAR2B	P31323	418 aa		33.23	■■■□□ 2.91
GPS1-223	ENST00000584229	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	33.23	■■■□□ 2.91
GPS1-223	ENST00000584229	CYP27B1	O15528	508 aa		33.22	■■■□□ 2.91
GPS1-223	ENST00000584229	ITGB4	P16144	1822 aa		33.21	■■■□□ 2.91
GPS1-223	ENST00000584229	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		33.21	■■■□□ 2.91
GPS1-223	ENST00000584229	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		33.21	■■■□□ 2.91
GPS1-223	ENST00000584229	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		33.2	■■■□□ 2.91
GPS1-223	ENST00000584229	BTAF1	O14981	1849 aa		33.2	■■■□□ 2.91
GPS1-223	ENST00000584229	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
GPS1-223	ENST00000584229	BCL9	O00512	1426 aa		33.19	■■■□□ 2.9
GPS1-223	ENST00000584229	NEFM	P07197	916 aa		33.18	■■■□□ 2.9
GPS1-223	ENST00000584229	PHKG2	P15735	406 aa		33.18	■■■□□ 2.9
GPS1-223	ENST00000584229	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
GPS1-223	ENST00000584229	FCHSD2	O94868	740 aa		33.17	■■■□□ 2.9
GPS1-223	ENST00000584229	MRS2	Q9HD23	443 aa		33.16	■■■□□ 2.9
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC184	Q52MB2	194 aa		33.15	■■■□□ 2.9
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC125	Q86Z20	511 aa		33.15	■■■□□ 2.9
GPS1-223	ENST00000584229	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		33.15	■■■□□ 2.9
GPS1-223	ENST00000584229	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
GPS1-223	ENST00000584229	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		33.14	■■■□□ 2.9
GPS1-223	ENST00000584229	KCNQ2	O43526	872 aa		33.13	■■■□□ 2.89
GPS1-223	ENST00000584229	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		33.12	■■■□□ 2.89
GPS1-223	ENST00000584229	APBA3	O96018	575 aa		33.12	■■■□□ 2.89
GPS1-223	ENST00000584229	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
GPS1-223	ENST00000584229	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
GPS1-223	ENST00000584229	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		33.11	■■■□□ 2.89
GPS1-223	ENST00000584229	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
GPS1-223	ENST00000584229	BAG6	P46379	1132 aa		33.1	■■■□□ 2.89
GPS1-223	ENST00000584229	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		33.1	■■■□□ 2.89
GPS1-223	ENST00000584229	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		33.1	■■■□□ 2.89
GPS1-223	ENST00000584229	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
GPS1-223	ENST00000584229	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		33.09	■■■□□ 2.89
GPS1-223	ENST00000584229	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
GPS1-223	ENST00000584229	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		33.07	■■■□□ 2.88
GPS1-223	ENST00000584229	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		33.07	■■■□□ 2.88
GPS1-223	ENST00000584229	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		33.06	■■■□□ 2.88
GPS1-223	ENST00000584229	DCAF5	Q96JK2	942 aa		33.06	■■■□□ 2.88
GPS1-223	ENST00000584229	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		33.05	■■■□□ 2.88
GPS1-223	ENST00000584229	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
GPS1-223	ENST00000584229	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		33.05	■■■□□ 2.88
GPS1-223	ENST00000584229	MAP3K5	Q99683	1374 aa		33.05	■■■□□ 2.88
GPS1-223	ENST00000584229	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
GPS1-223	ENST00000584229	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		33.02	■■■□□ 2.88
GPS1-223	ENST00000584229	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		33.01	■■■□□ 2.87
GPS1-223	ENST00000584229	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		33	■■■□□ 2.87
GPS1-223	ENST00000584229	RREB1	Q92766	1687 aa		32.99	■■■□□ 2.87
GPS1-223	ENST00000584229	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		32.99	■■■□□ 2.87
GPS1-223	ENST00000584229	CABP4	P57796	275 aa		32.98	■■■□□ 2.87
GPS1-223	ENST00000584229	RUNDC1	Q96C34	613 aa		32.97	■■■□□ 2.87
GPS1-223	ENST00000584229	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.96	■■■□□ 2.87
GPS1-223	ENST00000584229	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
GPS1-223	ENST00000584229	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
GPS1-223	ENST00000584229	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
GPS1-223	ENST00000584229	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.96	■■■□□ 2.87
GPS1-223	ENST00000584229	LY75	O60449	1722 aa		32.96	■■■□□ 2.87
GPS1-223	ENST00000584229	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		32.95	■■■□□ 2.87
GPS1-223	ENST00000584229	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.95	■■■□□ 2.87
GPS1-223	ENST00000584229	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
GPS1-223	ENST00000584229	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
GPS1-223	ENST00000584229	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		32.93	■■■□□ 2.86
GPS1-223	ENST00000584229	PIGB	Q92521	554 aa		32.93	■■■□□ 2.86
GPS1-223	ENST00000584229	MRC1	P22897	1456 aa		32.92	■■■□□ 2.86
GPS1-223	ENST00000584229	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
GPS1-223	ENST00000584229	PLSCR1	O15162	318 aa		32.9	■■■□□ 2.86
GPS1-223	ENST00000584229	NEUROD2	Q15784	382 aa		32.9	■■■□□ 2.86
GPS1-223	ENST00000584229	MIER1	Q8N108	512 aa		32.9	■■■□□ 2.86
GPS1-223	ENST00000584229	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		32.9	■■■□□ 2.86
GPS1-223	ENST00000584229	TEF	Q10587	303 aa		32.89	■■■□□ 2.86

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