RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SHANK3Q9BYB0 1731 aa39.22■■■■□ 3.87
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FLT4P35916 1363 aa39.2■■■■□ 3.87
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF827Q17R98 1081 aa39.14■■■■□ 3.86
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa39.11■■■■□ 3.85
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SYT17Q9BSW7 474 aa38.96■■■■□ 3.83
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 COL24A1Q17RW2 1714 aa38.8■■■■□ 3.8
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa38.61■■■■□ 3.77
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LINC00116Q8NCU8 138 aa38.54■■■■□ 3.76
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SMIM5Q71RC9 77 aa38.52■■■■□ 3.76
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KIF7Q2M1P5 1343 aa38.52■■■■□ 3.76
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP38.51■■■■□ 3.76
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