RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576635.6

SPNS2-208, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 3

Gene SPNS2, Length 901 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-208ENST00000576635 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS2-208ENST00000576635 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.81■■□□□ 1.08
SPNS2-208ENST00000576635 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.81■■□□□ 1.08
SPNS2-208ENST00000576635 NSD2O96028 1365 aa21.81■■□□□ 1.08
SPNS2-208ENST00000576635 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SPNS2-208ENST00000576635 AMPHP49418 695 aa21.79■■□□□ 1.08
SPNS2-208ENST00000576635 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.79■■□□□ 1.08
SPNS2-208ENST00000576635 KLHL34Q8N239 644 aa21.78■■□□□ 1.08
SPNS2-208ENST00000576635 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SPNS2-208ENST00000576635 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS2-208ENST00000576635 RTL1A6NKG5 1358 aa21.76■■□□□ 1.07
SPNS2-208ENST00000576635 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.76■■□□□ 1.07
SPNS2-208ENST00000576635 POLD1P28340 1107 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS2-208ENST00000576635 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SPNS2-208ENST00000576635 GPR162Q16538 588 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS2-208ENST00000576635 C5P01031 1676 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS2-208ENST00000576635 NBPF6Q5VWK0 638 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS2-208ENST00000576635 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS2-208ENST00000576635 NBPF4Q96M43 638 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS2-208ENST00000576635 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.72■■□□□ 1.07
SPNS2-208ENST00000576635 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.72■■□□□ 1.07
SPNS2-208ENST00000576635 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SPNS2-208ENST00000576635 FYB1O15117 783 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS2-208ENST00000576635 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
SPNS2-208ENST00000576635 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SPNS2-208ENST00000576635 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS2-208ENST00000576635 USP47Q96K76 1375 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS2-208ENST00000576635 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SPNS2-208ENST00000576635 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS2-208ENST00000576635 ITGB4P16144 1822 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS2-208ENST00000576635 SLC24A1O60721 1099 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS2-208ENST00000576635 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.68■■□□□ 1.06
SPNS2-208ENST00000576635 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
SPNS2-208ENST00000576635 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS2-208ENST00000576635 MSH5O43196 834 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS2-208ENST00000576635 C1QTNF8P60827 252 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS2-208ENST00000576635 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS2-208ENST00000576635 INSRP06213 1382 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS2-208ENST00000576635 TMF1P82094 1093 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS2-208ENST00000576635 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS2-208ENST00000576635 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS2-208ENST00000576635 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SPNS2-208ENST00000576635 FLT4P35916 1363 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS2-208ENST00000576635 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS2-208ENST00000576635 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS2-208ENST00000576635 MSL1Q68DK7 614 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS2-208ENST00000576635 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
SPNS2-208ENST00000576635 C4BP0C0L5 1744 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS2-208ENST00000576635 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS2-208ENST00000576635 PALLDQ8WX93 1383 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS2-208ENST00000576635 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS2-208ENST00000576635 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS2-208ENST00000576635 CYP27B1O15528 508 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS2-208ENST00000576635 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS2-208ENST00000576635 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
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SPNS2-208ENST00000576635 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.58■■□□□ 1.05
SPNS2-208ENST00000576635 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS2-208ENST00000576635 NCAPD2Q15021 1401 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS2-208ENST00000576635 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS2-208ENST00000576635 GRIN3BO60391 1043 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-208ENST00000576635 CDCA8Q53HL2 280 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-208ENST00000576635 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-208ENST00000576635 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-208ENST00000576635 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-208ENST00000576635 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-208ENST00000576635 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SPNS2-208ENST00000576635 SMIM5Q71RC9 77 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS2-208ENST00000576635 PIGBQ92521 554 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS2-208ENST00000576635 AK7Q96M32 723 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS2-208ENST00000576635 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SPNS2-208ENST00000576635 ATP10DQ9P241 1426 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS2-208ENST00000576635 PHF14O94880 888 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS2-208ENST00000576635 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SPNS2-208ENST00000576635 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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SPNS2-208ENST00000576635 SPG7Q9UQ90 795 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS2-208ENST00000576635 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS2-208ENST00000576635 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.46■■□□□ 1.03
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SPNS2-208ENST00000576635 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.46■■□□□ 1.03
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SPNS2-208ENST00000576635 ADCY9O60503 1353 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS2-208ENST00000576635 SSFA2P28290 1259 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS2-208ENST00000576635 ITPK1Q13572 414 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS2-208ENST00000576635 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
SPNS2-208ENST00000576635 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS2-208ENST00000576635 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS2-208ENST00000576635 PHKG2P15735 406 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS2-208ENST00000576635 CEP350Q5VT06 3117 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS2-208ENST00000576635 POLKQ9UBT6 870 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS2-208ENST00000576635 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS2-208ENST00000576635 GNPATO15228 680 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS2-208ENST00000576635 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS2-208ENST00000576635 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS2-208ENST00000576635 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS2-208ENST00000576635 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SPNS2-208ENST00000576635 ATP6V1AP38606 617 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS2-208ENST00000576635 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
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