RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 AEBP1Q8IUX7 1158 aa44.4■■■■■ 4.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM182BQ5T319 152 aa44.38■■■■■ 4.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 SHANK3Q9BYB0 1731 aa44.37■■■■■ 4.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 PKD1L3Q7Z443 1732 aa44.36■■■■■ 4.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP44.36■■■■■ 4.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 HMOX1P09601 288 aa44.34■■■■■ 4.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM196AQ6ZSG2 479 aa44.33■■■■■ 4.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP44.33■■■■■ 4.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPG7Q9UQ90 795 aa44.29■■■■■ 4.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP44.29■■■■■ 4.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa44.28■■■■■ 4.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa44.28■■■■■ 4.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 BCL9O00512 1426 aa44.28■■■■■ 4.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP44.27■■■■■ 4.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP44.27■■■■■ 4.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 SOCS7O14512 581 aa44.25■■■■■ 4.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 AMOTQ4VCS5 1084 aa44.24■■■■■ 4.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP44.22■■■■■ 4.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP44.2■■■■■ 4.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYP27B1O15528 508 aa44.19■■■■■ 4.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 SBF2Q86WG5 1849 aa44.19■■■■■ 4.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 RSPH6AQ9H0K4 717 aa44.19■■■■■ 4.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 FCHSD2O94868 740 aa44.18■■■■■ 4.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC125Q86Z20 511 aa44.15■■■■■ 4.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRKAR2BP31323 418 aa44.14■■■■■ 4.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFNL2Q8IZJ0 200 aa44.14■■■■■ 4.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM37O94972 964 aa44.11■■■■■ 4.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHKG2P15735 406 aa44.11■■■■■ 4.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 KAT6BQ8WYB5 2073 aa44.11■■■■■ 4.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP44.1■■■■■ 4.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP44.09■■■■■ 4.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP44.08■■■■■ 4.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 DOT1LQ8TEK3 1739 aa44.07■■■■■ 4.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP44.07■■■■■ 4.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 NHSQ6T4R5 1651 aa44.07■■■■■ 4.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC184Q52MB2 194 aa44.07■■■■■ 4.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf141Q5JVX7 400 aa44.06■■■■■ 4.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACSBG1Q96GR2 724 aa44.04■■■■■ 4.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP44.04■■■■■ 4.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP44.02■■■■■ 4.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHACTR3Q96KR7 559 aa44.02■■■■■ 4.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRS2Q9HD23 443 aa44.02■■■■■ 4.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAS2L2Q8NHY3 880 aa44.01■■■■■ 4.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 AKAP4Q5JQC9 854 aa44■■■■■ 4.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNQ2O43526 872 aa43.99■■■■■ 4.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEFMP07197 916 aa43.99■■■■■ 4.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa43.99■■■■■ 4.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLEKHF1Q96S99 279 aa43.99■■■■■ 4.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCAF5Q96JK2 942 aa43.97■■■■■ 4.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAMTS8Q9UP79 889 aa43.97■■■■■ 4.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTF1AQ7RTS3 328 aa43.96■■■■■ 4.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP43.95■■■■■ 4.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 APBA3O96018 575 aa43.93■■■■■ 4.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP43.93■■■■■ 4.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITGB4P16144 1822 aa43.92■■■■■ 4.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 BAG6P46379 1132 aa43.92■■■■■ 4.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa43.92■■■■■ 4.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 BTAF1O14981 1849 aa43.91■■■■■ 4.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCN11AQ9UI33 1791 aa43.89■■■■■ 4.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa43.89■■■■■ 4.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAP3K5Q99683 1374 aa43.89■■■■■ 4.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 GNAT3A8MTJ3 354 aa43.86■■■■■ 4.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERVV-2B6SEH9 535 aa43.86■■■■■ 4.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB132Q7Z7B7 95 aa43.86■■■■■ 4.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa43.85■■■■■ 4.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP43.83■■■■■ 4.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa43.83■■■■■ 4.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLSCR1O15162 318 aa43.83■■■■■ 4.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 RUNDC1Q96C34 613 aa43.83■■■■■ 4.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC146Q8IYE0 955 aa43.82■■■■■ 4.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMOD3Q9NYL9 352 aa43.82■■■■■ 4.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP43.81■■■■■ 4.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNMTO43148 476 aaKnown RBP43.8■■■■■ 4.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 LGR6Q9HBX8 967 aa43.8■■■■■ 4.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 DLG5Q8TDM6 1919 aa43.8■■■■■ 4.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 NFE2L2Q16236 605 aa43.79■■■■■ 4.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCER2I3L3R5 266 aa43.78■■■■■ 4.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 CABP4P57796 275 aa43.78■■■■■ 4.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIGBQ92521 554 aa43.78■■■■■ 4.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAMKK2Q96RR4 588 aa43.77■■■■■ 4.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRC1P22897 1456 aa43.75■■■■■ 4.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP43.75■■■■■ 4.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP43.74■■■■■ 4.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL17REQ8NFR9 667 aa43.73■■■■■ 4.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC52A2Q9HAB3 445 aa43.73■■■■■ 4.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 MIER1Q8N108 512 aa43.72■■■■■ 4.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa43.72■■■■■ 4.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMPOP42166 694 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa43.71■■■■■ 4.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 RREB1Q92766 1687 aa43.68■■■■■ 4.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms