RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572010.5

SLC12A4-208, Transcript of solute carrier family 12 member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC12A4, Length 1,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4-208ENST00000572010 PAPPAQ13219 1627 aa29.65■■■□□ 2.34
SLC12A4-208ENST00000572010 NBPF6Q5VWK0 638 aa29.65■■■□□ 2.34
SLC12A4-208ENST00000572010 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa29.65■■■□□ 2.34
SLC12A4-208ENST00000572010 NBPF4Q96M43 638 aa29.65■■■□□ 2.34
SLC12A4-208ENST00000572010 POLD1P28340 1107 aa29.64■■■□□ 2.34
SLC12A4-208ENST00000572010 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.64■■■□□ 2.34
SLC12A4-208ENST00000572010 USP47Q96K76 1375 aa29.64■■■□□ 2.33
SLC12A4-208ENST00000572010 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
SLC12A4-208ENST00000572010 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
SLC12A4-208ENST00000572010 KCNQ4P56696 695 aa29.62■■■□□ 2.33
SLC12A4-208ENST00000572010 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.61■■■□□ 2.33
SLC12A4-208ENST00000572010 TATP17735 454 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
SLC12A4-208ENST00000572010 KLHL34Q8N239 644 aa29.59■■■□□ 2.33
SLC12A4-208ENST00000572010 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
SLC12A4-208ENST00000572010 MEGF6O75095 1541 aa29.59■■■□□ 2.33
SLC12A4-208ENST00000572010 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa29.58■■■□□ 2.33
SLC12A4-208ENST00000572010 MAP3K5Q99683 1374 aa29.58■■■□□ 2.33
SLC12A4-208ENST00000572010 GPR162Q16538 588 aa29.57■■■□□ 2.32
SLC12A4-208ENST00000572010 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.57■■■□□ 2.32
SLC12A4-208ENST00000572010 MSH5O43196 834 aa29.55■■■□□ 2.32
SLC12A4-208ENST00000572010 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
SLC12A4-208ENST00000572010 NSD2O96028 1365 aa29.54■■■□□ 2.32
SLC12A4-208ENST00000572010 INSRP06213 1382 aa29.54■■■□□ 2.32
SLC12A4-208ENST00000572010 RGPD2P0DJD1 1756 aa29.54■■■□□ 2.32
SLC12A4-208ENST00000572010 FLT4P35916 1363 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC12A4-208ENST00000572010 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC12A4-208ENST00000572010 DOT1LQ8TEK3 1739 aa29.51■■■□□ 2.32
SLC12A4-208ENST00000572010 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa29.51■■■□□ 2.32
SLC12A4-208ENST00000572010 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.51■■■□□ 2.32
SLC12A4-208ENST00000572010 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
SLC12A4-208ENST00000572010 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
SLC12A4-208ENST00000572010 CARD14Q9BXL6 1004 aa29.48■■■□□ 2.31
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SLC12A4-208ENST00000572010 QSER1Q2KHR3 1735 aa29.47■■■□□ 2.31
SLC12A4-208ENST00000572010 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.46■■■□□ 2.31
SLC12A4-208ENST00000572010 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
SLC12A4-208ENST00000572010 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.46■■■□□ 2.31
SLC12A4-208ENST00000572010 LY75O60449 1722 aa29.45■■■□□ 2.31
SLC12A4-208ENST00000572010 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.45■■■□□ 2.31
SLC12A4-208ENST00000572010 NSD3Q9BZ95 1437 aa29.43■■■□□ 2.3
SLC12A4-208ENST00000572010 CYP27B1O15528 508 aa29.42■■■□□ 2.3
SLC12A4-208ENST00000572010 FLAD1Q8NFF5 587 aa29.42■■■□□ 2.3
SLC12A4-208ENST00000572010 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
SLC12A4-208ENST00000572010 KIF20BQ96Q89 1820 aa29.41■■■□□ 2.3
SLC12A4-208ENST00000572010 SPG7Q9UQ90 795 aa29.4■■■□□ 2.3
SLC12A4-208ENST00000572010 PALLDQ8WX93 1383 aa29.39■■■□□ 2.3
SLC12A4-208ENST00000572010 NLGN2Q8NFZ4 835 aa29.39■■■□□ 2.3
SLC12A4-208ENST00000572010 CHD4Q14839 1912 aa29.39■■■□□ 2.3
SLC12A4-208ENST00000572010 MSL1Q68DK7 614 aa29.37■■■□□ 2.29
SLC12A4-208ENST00000572010 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.37■■■□□ 2.29
SLC12A4-208ENST00000572010 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.37■■■□□ 2.29
SLC12A4-208ENST00000572010 UTRNP46939 3433 aa29.37■■■□□ 2.29
SLC12A4-208ENST00000572010 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa29.36■■■□□ 2.29
SLC12A4-208ENST00000572010 COL24A1Q17RW2 1714 aa29.35■■■□□ 2.29
SLC12A4-208ENST00000572010 GRIN3BO60391 1043 aa29.34■■■□□ 2.29
SLC12A4-208ENST00000572010 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
SLC12A4-208ENST00000572010 AK7Q96M32 723 aa29.34■■■□□ 2.29
SLC12A4-208ENST00000572010 PIGBQ92521 554 aa29.33■■■□□ 2.29
SLC12A4-208ENST00000572010 EYA1Q99502 592 aa29.32■■■□□ 2.28
SLC12A4-208ENST00000572010 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP29.32■■■□□ 2.28
SLC12A4-208ENST00000572010 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.31■■■□□ 2.28
SLC12A4-208ENST00000572010 POLKQ9UBT6 870 aa29.3■■■□□ 2.28
SLC12A4-208ENST00000572010 CD2APQ9Y5K6 639 aa29.3■■■□□ 2.28
SLC12A4-208ENST00000572010 C1QTNF8P60827 252 aa29.29■■■□□ 2.28
SLC12A4-208ENST00000572010 TMOD3Q9NYL9 352 aa29.29■■■□□ 2.28
SLC12A4-208ENST00000572010 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.28■■■□□ 2.28
SLC12A4-208ENST00000572010 IFNL2Q8IZJ0 200 aa29.28■■■□□ 2.28
SLC12A4-208ENST00000572010 C5P01031 1676 aa29.28■■■□□ 2.28
SLC12A4-208ENST00000572010 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
SLC12A4-208ENST00000572010 PHF14O94880 888 aa29.26■■■□□ 2.27
SLC12A4-208ENST00000572010 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP29.26■■■□□ 2.27
SLC12A4-208ENST00000572010 NCAPD2Q15021 1401 aa29.26■■■□□ 2.27
SLC12A4-208ENST00000572010 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa29.25■■■□□ 2.27
SLC12A4-208ENST00000572010 SIK1P57059 783 aa29.25■■■□□ 2.27
SLC12A4-208ENST00000572010 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.23■■■□□ 2.27
SLC12A4-208ENST00000572010 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
SLC12A4-208ENST00000572010 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
SLC12A4-208ENST00000572010 PHKG2P15735 406 aa29.23■■■□□ 2.27
SLC12A4-208ENST00000572010 PKD1L3Q7Z443 1732 aa29.23■■■□□ 2.27
SLC12A4-208ENST00000572010 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
SLC12A4-208ENST00000572010 SSFA2P28290 1259 aa29.21■■■□□ 2.27
SLC12A4-208ENST00000572010 ATP6V1AP38606 617 aa29.21■■■□□ 2.27
SLC12A4-208ENST00000572010 ASAP1Q9ULH1 1129 aa29.21■■■□□ 2.27
SLC12A4-208ENST00000572010 ITGB4P16144 1822 aa29.21■■■□□ 2.27
SLC12A4-208ENST00000572010 C4BP0C0L5 1744 aa29.2■■■□□ 2.27
SLC12A4-208ENST00000572010 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
SLC12A4-208ENST00000572010 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.2■■■□□ 2.269e-7■■■■■ 27.1
SLC12A4-208ENST00000572010 TAF1LQ8IZX4 1826 aa29.2■■■□□ 2.26
SLC12A4-208ENST00000572010 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa29.2■■■□□ 2.26
SLC12A4-208ENST00000572010 LINC00116Q8NCU8 138 aa29.19■■■□□ 2.26
SLC12A4-208ENST00000572010 SMIM5Q71RC9 77 aa29.18■■■□□ 2.26
SLC12A4-208ENST00000572010 AMIGO3Q86WK7 504 aa29.18■■■□□ 2.26
SLC12A4-208ENST00000572010 PANK3Q9H999 370 aa29.17■■■□□ 2.26
SLC12A4-208ENST00000572010 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa29.17■■■□□ 2.26
SLC12A4-208ENST00000572010 GNPATO15228 680 aa29.16■■■□□ 2.26
SLC12A4-208ENST00000572010 ATG3Q9NT62 314 aa29.16■■■□□ 2.26
SLC12A4-208ENST00000572010 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
SLC12A4-208ENST00000572010 ITPK1Q13572 414 aa29.14■■■□□ 2.26
SLC12A4-208ENST00000572010 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
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