RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570070.1

WDR59-222, Transcript of WD repeat domain 59, human

TSL 4

Gene WDR59, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
WDR59-222	ENST00000570070	CASZ1	Q86V15	1759 aa		14.91	□□□□□ -0.02
WDR59-222	ENST00000570070	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
WDR59-222	ENST00000570070	FLT4	P35916	1363 aa		14.9	□□□□□ -0.02
WDR59-222	ENST00000570070	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
WDR59-222	ENST00000570070	STK32B	Q9NY57	414 aa		14.9	□□□□□ -0.02
WDR59-222	ENST00000570070	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
WDR59-222	ENST00000570070	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
WDR59-222	ENST00000570070	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		14.89	□□□□□ -0.03
WDR59-222	ENST00000570070	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		14.89	□□□□□ -0.03
WDR59-222	ENST00000570070	INSR	P06213	1382 aa		14.88	□□□□□ -0.03
WDR59-222	ENST00000570070	ZBTB7A	O95365	584 aa		14.88	□□□□□ -0.03
WDR59-222	ENST00000570070	SPON1	Q9HCB6	807 aa		14.88	□□□□□ -0.03
WDR59-222	ENST00000570070	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
WDR59-222	ENST00000570070	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
WDR59-222	ENST00000570070	KCNQ4	P56696	695 aa		14.86	□□□□□ -0.03
WDR59-222	ENST00000570070	SLC15A2	Q16348	729 aa		14.86	□□□□□ -0.03
WDR59-222	ENST00000570070	PANK3	Q9H999	370 aa		14.86	□□□□□ -0.03
WDR59-222	ENST00000570070	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
WDR59-222	ENST00000570070	PAPPA	Q13219	1627 aa		14.84	□□□□□ -0.03
WDR59-222	ENST00000570070	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		14.84	□□□□□ -0.03
WDR59-222	ENST00000570070	LY75	O60449	1722 aa		14.83	□□□□□ -0.03
WDR59-222	ENST00000570070	ITGB4	P16144	1822 aa		14.83	□□□□□ -0.04
WDR59-222	ENST00000570070	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		14.83	□□□□□ -0.04
WDR59-222	ENST00000570070	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		14.83	□□□□□ -0.04
WDR59-222	ENST00000570070	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		14.83	□□□□□ -0.04
WDR59-222	ENST00000570070	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		14.83	□□□□□ -0.04
WDR59-222	ENST00000570070	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		14.83	□□□□□ -0.04
WDR59-222	ENST00000570070	ZNF827	Q17R98	1081 aa		14.82	□□□□□ -0.04
WDR59-222	ENST00000570070	POLK	Q9UBT6	870 aa		14.81	□□□□□ -0.04
WDR59-222	ENST00000570070	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		14.81	□□□□□ -0.04
WDR59-222	ENST00000570070	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		14.81	□□□□□ -0.04
WDR59-222	ENST00000570070	NSD2	O96028	1365 aa		14.81	□□□□□ -0.04
WDR59-222	ENST00000570070	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		14.8	□□□□□ -0.04
WDR59-222	ENST00000570070	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
WDR59-222	ENST00000570070	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		14.79	□□□□□ -0.04
WDR59-222	ENST00000570070	MORC1	Q86VD1	984 aa		14.79	□□□□□ -0.04
WDR59-222	ENST00000570070	EYA1	Q99502	592 aa		14.79	□□□□□ -0.04
WDR59-222	ENST00000570070	CYP27B1	O15528	508 aa		14.78	□□□□□ -0.04
WDR59-222	ENST00000570070	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
WDR59-222	ENST00000570070	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		14.78	□□□□□ -0.04
WDR59-222	ENST00000570070	C5	P01031	1676 aa		14.77	□□□□□ -0.04
WDR59-222	ENST00000570070	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		14.77	□□□□□ -0.04
WDR59-222	ENST00000570070	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
WDR59-222	ENST00000570070	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		14.77	□□□□□ -0.05
WDR59-222	ENST00000570070	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		14.77	□□□□□ -0.05
WDR59-222	ENST00000570070	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		14.76	□□□□□ -0.05
WDR59-222	ENST00000570070	MSH5	O43196	834 aa		14.76	□□□□□ -0.05
WDR59-222	ENST00000570070	PTGER2	P43116	358 aa		14.76	□□□□□ -0.05
WDR59-222	ENST00000570070	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		14.76	□□□□□ -0.05
WDR59-222	ENST00000570070	KLHL34	Q8N239	644 aa		14.76	□□□□□ -0.05
WDR59-222	ENST00000570070	SPG7	Q9UQ90	795 aa		14.76	□□□□□ -0.05
WDR59-222	ENST00000570070	AKT1S1	Q96B36	256 aa		14.75	□□□□□ -0.05
WDR59-222	ENST00000570070	MTFR1L	Q9H019	292 aa		14.75	□□□□□ -0.05
WDR59-222	ENST00000570070	NCAPD2	Q15021	1401 aa		14.75	□□□□□ -0.05
WDR59-222	ENST00000570070	PALLD	Q8WX93	1383 aa		14.73	□□□□□ -0.05
WDR59-222	ENST00000570070	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		14.73	□□□□□ -0.05
WDR59-222	ENST00000570070	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		14.73	□□□□□ -0.05
WDR59-222	ENST00000570070	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
WDR59-222	ENST00000570070	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
WDR59-222	ENST00000570070	C4B	P0C0L5	1744 aa		14.7	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	PHKG2	P15735	406 aa		14.7	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		14.7	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		14.7	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	PIGB	Q92521	554 aa		14.7	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	ARX	Q96QS3	562 aa		14.7	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		14.7	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		14.69	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	MSL1	Q68DK7	614 aa		14.69	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		14.69	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	POLD1	P28340	1107 aa		14.68	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	SYT17	Q9BSW7	474 aa		14.68	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	PHF14	O94880	888 aa		14.67	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		14.67	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	SMIM5	Q71RC9	77 aa		14.67	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		14.67	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		14.66	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		14.66	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	YY1	P25490	414 aa		14.66	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		14.66	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	AK7	Q96M32	723 aa		14.66	□□□□□ -0.06
WDR59-222	ENST00000570070	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	14.66	□□□□□ -0.06	3e-18	■■□□□ 12
WDR59-222	ENST00000570070	HMOX1	P09601	288 aa		14.64	□□□□□ -0.07
WDR59-222	ENST00000570070	ATP6V1A	P38606	617 aa		14.64	□□□□□ -0.07
WDR59-222	ENST00000570070	MTHFS	P49914	203 aa		14.64	□□□□□ -0.07
WDR59-222	ENST00000570070	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		14.64	□□□□□ -0.07
WDR59-222	ENST00000570070	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
WDR59-222	ENST00000570070	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		14.63	□□□□□ -0.07
WDR59-222	ENST00000570070	IL13	P35225	146 aa		14.63	□□□□□ -0.07
WDR59-222	ENST00000570070	SIK1	P57059	783 aa		14.63	□□□□□ -0.07
WDR59-222	ENST00000570070	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		14.63	□□□□□ -0.07
WDR59-222	ENST00000570070	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		14.62	□□□□□ -0.07
WDR59-222	ENST00000570070	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07

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