RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-211ENST00000568829 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-211ENST00000568829 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SPNS1-211ENST00000568829 MTFR1LQ9H019 292 aa22.87■■□□□ 1.25
SPNS1-211ENST00000568829 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-211ENST00000568829 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-211ENST00000568829 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-211ENST00000568829 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-211ENST00000568829 ZBTB7AO95365 584 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-211ENST00000568829 MEGF6O75095 1541 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-211ENST00000568829 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-211ENST00000568829 MYOM1P52179 1685 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-211ENST00000568829 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SPNS1-211ENST00000568829 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.83■■□□□ 1.25
SPNS1-211ENST00000568829 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-211ENST00000568829 BTAF1O14981 1849 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-211ENST00000568829 SPG7Q9UQ90 795 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-211ENST00000568829 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-211ENST00000568829 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS1-211ENST00000568829 CASZ1Q86V15 1759 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS1-211ENST00000568829 NSD2O96028 1365 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS1-211ENST00000568829 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS1-211ENST00000568829 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SPNS1-211ENST00000568829 PANK3Q9H999 370 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS1-211ENST00000568829 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS1-211ENST00000568829 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SPNS1-211ENST00000568829 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-211ENST00000568829 PTGER2P43116 358 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-211ENST00000568829 AKT1S1Q96B36 256 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-211ENST00000568829 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-211ENST00000568829 POLKQ9UBT6 870 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-211ENST00000568829 POLD1P28340 1107 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS1-211ENST00000568829 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SPNS1-211ENST00000568829 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF827Q17R98 1081 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-211ENST00000568829 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-211ENST00000568829 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-211ENST00000568829 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-211ENST00000568829 PAPPAQ13219 1627 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS1-211ENST00000568829 ARXQ96QS3 562 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS1-211ENST00000568829 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-211ENST00000568829 EYA1Q99502 592 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-211ENST00000568829 CYP27B1O15528 508 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS1-211ENST00000568829 MORC1Q86VD1 984 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS1-211ENST00000568829 NCAPD2Q15021 1401 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS1-211ENST00000568829 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SPNS1-211ENST00000568829 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.7■■□□□ 1.22
SPNS1-211ENST00000568829 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.7■■□□□ 1.22
SPNS1-211ENST00000568829 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS1-211ENST00000568829 YY1P25490 414 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS1-211ENST00000568829 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS1-211ENST00000568829 SYT17Q9BSW7 474 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS1-211ENST00000568829 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SPNS1-211ENST00000568829 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-211ENST00000568829 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-211ENST00000568829 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SPNS1-211ENST00000568829 PALLDQ8WX93 1383 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-211ENST00000568829 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-211ENST00000568829 MSH5O43196 834 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS1-211ENST00000568829 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SPNS1-211ENST00000568829 LY75O60449 1722 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-211ENST00000568829 KCNQ4P56696 695 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-211ENST00000568829 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-211ENST00000568829 MAP3K5Q99683 1374 aa22.64■■□□□ 1.22
SPNS1-211ENST00000568829 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.64■■□□□ 1.21
SPNS1-211ENST00000568829 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-211ENST00000568829 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-211ENST00000568829 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-211ENST00000568829 PHKG2P15735 406 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS1-211ENST00000568829 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.61■■□□□ 1.21
SPNS1-211ENST00000568829 PIGBQ92521 554 aa22.61■■□□□ 1.21
SPNS1-211ENST00000568829 AK7Q96M32 723 aa22.61■■□□□ 1.21
SPNS1-211ENST00000568829 KLHL34Q8N239 644 aa22.59■■□□□ 1.21
SPNS1-211ENST00000568829 DCAF5Q96JK2 942 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-211ENST00000568829 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-211ENST00000568829 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-211ENST00000568829 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-211ENST00000568829 SIK1P57059 783 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-211ENST00000568829 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-211ENST00000568829 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-211ENST00000568829 GPR162Q16538 588 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-211ENST00000568829 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-211ENST00000568829 C5P01031 1676 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-211ENST00000568829 SSFA2P28290 1259 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-211ENST00000568829 ATP6V1AP38606 617 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-211ENST00000568829 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-211ENST00000568829 MTHFSP49914 203 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 CABP4P57796 275 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 ITGB4P16144 1822 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 IL13P35225 146 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 ATG3Q9NT62 314 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 PHF14O94880 888 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 C4BP0C0L5 1744 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 MSL1Q68DK7 614 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
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