RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 NSD2O96028 1365 aa21.79■■□□□ 1.08
NME3-211ENST00000568561 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.79■■□□□ 1.08
NME3-211ENST00000568561 RTL1A6NKG5 1358 aa21.78■■□□□ 1.08
NME3-211ENST00000568561 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
NME3-211ENST00000568561 AKT1S1Q96B36 256 aa21.78■■□□□ 1.08
NME3-211ENST00000568561 ARXQ96QS3 562 aa21.78■■□□□ 1.08
NME3-211ENST00000568561 FYB1O15117 783 aa21.76■■□□□ 1.07
NME3-211ENST00000568561 TMF1P82094 1093 aa21.76■■□□□ 1.07
NME3-211ENST00000568561 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
NME3-211ENST00000568561 CHD4Q14839 1912 aa21.76■■□□□ 1.07
NME3-211ENST00000568561 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.75■■□□□ 1.07
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NME3-211ENST00000568561 NBPF4Q96M43 638 aa21.75■■□□□ 1.07
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NME3-211ENST00000568561 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.74■■□□□ 1.07
NME3-211ENST00000568561 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
NME3-211ENST00000568561 SLC24A1O60721 1099 aa21.73■■□□□ 1.07
NME3-211ENST00000568561 KLHL34Q8N239 644 aa21.73■■□□□ 1.07
NME3-211ENST00000568561 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.71■■□□□ 1.07
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NME3-211ENST00000568561 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.69■■□□□ 1.06
NME3-211ENST00000568561 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
NME3-211ENST00000568561 INSRP06213 1382 aa21.68■■□□□ 1.06
NME3-211ENST00000568561 FLT4P35916 1363 aa21.68■■□□□ 1.06
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NME3-211ENST00000568561 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
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NME3-211ENST00000568561 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
NME3-211ENST00000568561 POLD1P28340 1107 aa21.66■■□□□ 1.06
NME3-211ENST00000568561 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.66■■□□□ 1.06
NME3-211ENST00000568561 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.66■■□□□ 1.06
NME3-211ENST00000568561 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.66■■□□□ 1.06
NME3-211ENST00000568561 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.66■■□□□ 1.06
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NME3-211ENST00000568561 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.65■■□□□ 1.06
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NME3-211ENST00000568561 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
NME3-211ENST00000568561 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.63■■□□□ 1.05
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NME3-211ENST00000568561 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
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NME3-211ENST00000568561 C4BP0C0L5 1744 aa21.58■■□□□ 1.05
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NME3-211ENST00000568561 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.56■■□□□ 1.04
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NME3-211ENST00000568561 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.52■■□□□ 1.04
NME3-211ENST00000568561 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
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NME3-211ENST00000568561 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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NME3-211ENST00000568561 PHF14O94880 888 aa21.49■■□□□ 1.03
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NME3-211ENST00000568561 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.49■■□□□ 1.03
NME3-211ENST00000568561 SPG7Q9UQ90 795 aa21.49■■□□□ 1.03
NME3-211ENST00000568561 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
NME3-211ENST00000568561 POLKQ9UBT6 870 aa21.48■■□□□ 1.03
NME3-211ENST00000568561 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
NME3-211ENST00000568561 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.45■■□□□ 1.02
NME3-211ENST00000568561 C1QTNF8P60827 252 aa21.45■■□□□ 1.02
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NME3-211ENST00000568561 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.45■■□□□ 1.02
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NME3-211ENST00000568561 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.45■■□□□ 1.02
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NME3-211ENST00000568561 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.44■■□□□ 1.02
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NME3-211ENST00000568561 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.43■■□□□ 1.02
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NME3-211ENST00000568561 SIK1P57059 783 aa21.43■■□□□ 1.02
NME3-211ENST00000568561 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.43■■□□□ 1.02
NME3-211ENST00000568561 ITPK1Q13572 414 aa21.42■■□□□ 1.02
NME3-211ENST00000568561 GRIN3BO60391 1043 aa21.41■■□□□ 1.02
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NME3-211ENST00000568561 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
NME3-211ENST00000568561 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.41■■□□□ 1.02
NME3-211ENST00000568561 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
NME3-211ENST00000568561 GNPATO15228 680 aa21.39■■□□□ 1.01
NME3-211ENST00000568561 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
NME3-211ENST00000568561 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.38■■□□□ 1.01
NME3-211ENST00000568561 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.38■■□□□ 1.01
NME3-211ENST00000568561 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
NME3-211ENST00000568561 SSFA2P28290 1259 aa21.38■■□□□ 1.01
NME3-211ENST00000568561 ATP6V1AP38606 617 aa21.38■■□□□ 1.01
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