RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.72■■□□□ 1.55
SPNS1-210ENST00000568388 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
SPNS1-210ENST00000568388 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SPNS1-210ENST00000568388 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.72■■□□□ 1.55
SPNS1-210ENST00000568388 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SPNS1-210ENST00000568388 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.71■■□□□ 1.55
SPNS1-210ENST00000568388 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.71■■□□□ 1.55
SPNS1-210ENST00000568388 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.71■■□□□ 1.55
SPNS1-210ENST00000568388 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SPNS1-210ENST00000568388 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
SPNS1-210ENST00000568388 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
SPNS1-210ENST00000568388 NFE2L2Q16236 605 aa24.69■■□□□ 1.54
SPNS1-210ENST00000568388 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.69■■□□□ 1.54
SPNS1-210ENST00000568388 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.69■■□□□ 1.54
SPNS1-210ENST00000568388 MEGF6O75095 1541 aa24.68■■□□□ 1.54
SPNS1-210ENST00000568388 IL2RBP14784 551 aa24.68■■□□□ 1.54
SPNS1-210ENST00000568388 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SPNS1-210ENST00000568388 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.68■■□□□ 1.54
SPNS1-210ENST00000568388 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.67■■□□□ 1.54
SPNS1-210ENST00000568388 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SPNS1-210ENST00000568388 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.67■■□□□ 1.54
SPNS1-210ENST00000568388 DISP2A7MBM2 1401 aa24.67■■□□□ 1.54
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC27Q2M243 656 aa24.66■■□□□ 1.54
SPNS1-210ENST00000568388 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SPNS1-210ENST00000568388 BARGINQ6ZT62 677 aa24.66■■□□□ 1.54
SPNS1-210ENST00000568388 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
SPNS1-210ENST00000568388 USP35Q9P2H5 1018 aa24.65■■□□□ 1.54
SPNS1-210ENST00000568388 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.64■■□□□ 1.54
SPNS1-210ENST00000568388 RIPK4P57078 832 aa24.64■■□□□ 1.54
SPNS1-210ENST00000568388 SPG7Q9UQ90 795 aa24.63■■□□□ 1.53
SPNS1-210ENST00000568388 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SPNS1-210ENST00000568388 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SPNS1-210ENST00000568388 NEUROD2Q15784 382 aa24.61■■□□□ 1.53
SPNS1-210ENST00000568388 EP400Q96L91 3159 aa24.61■■□□□ 1.53
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF521Q96K83 1311 aa24.61■■□□□ 1.53
SPNS1-210ENST00000568388 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.6■■□□□ 1.53
SPNS1-210ENST00000568388 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SPNS1-210ENST00000568388 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.6■■□□□ 1.53
SPNS1-210ENST00000568388 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.6■■□□□ 1.53
SPNS1-210ENST00000568388 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.59■■□□□ 1.53
SPNS1-210ENST00000568388 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SPNS1-210ENST00000568388 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.58■■□□□ 1.53
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SPNS1-210ENST00000568388 WWC1Q8IX03 1113 aa24.58■■□□□ 1.53
SPNS1-210ENST00000568388 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SPNS1-210ENST00000568388 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.57■■□□□ 1.52
SPNS1-210ENST00000568388 MAP3K5Q99683 1374 aa24.56■■□□□ 1.52
SPNS1-210ENST00000568388 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SPNS1-210ENST00000568388 EXOC5O00471 708 aa24.55■■□□□ 1.52
SPNS1-210ENST00000568388 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.55■■□□□ 1.52
SPNS1-210ENST00000568388 WDR63Q8IWG1 891 aa24.55■■□□□ 1.52
SPNS1-210ENST00000568388 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.55■■□□□ 1.52
SPNS1-210ENST00000568388 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.55■■□□□ 1.52
SPNS1-210ENST00000568388 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.55■■□□□ 1.52
SPNS1-210ENST00000568388 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.55■■□□□ 1.52
SPNS1-210ENST00000568388 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.55■■□□□ 1.52
SPNS1-210ENST00000568388 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.54■■□□□ 1.52
SPNS1-210ENST00000568388 PHKG2P15735 406 aa24.54■■□□□ 1.52
SPNS1-210ENST00000568388 PDE3BQ13370 1112 aa24.54■■□□□ 1.52
SPNS1-210ENST00000568388 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.53■■□□□ 1.52
SPNS1-210ENST00000568388 CYP27B1O15528 508 aa24.53■■□□□ 1.52
SPNS1-210ENST00000568388 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SPNS1-210ENST00000568388 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SPNS1-210ENST00000568388 LRRC37A3O60309 1634 aa24.53■■□□□ 1.52
SPNS1-210ENST00000568388 TNS2Q63HR2 1409 aa24.52■■□□□ 1.52
SPNS1-210ENST00000568388 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SPNS1-210ENST00000568388 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
SPNS1-210ENST00000568388 DDB1Q16531 1140 aa24.51■■□□□ 1.51
SPNS1-210ENST00000568388 IL16Q14005 1332 aa24.51■■□□□ 1.51
SPNS1-210ENST00000568388 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SPNS1-210ENST00000568388 GOLGA2Q08379 1002 aa24.5■■□□□ 1.51
SPNS1-210ENST00000568388 IL17REQ8NFR9 667 aa24.49■■□□□ 1.51
SPNS1-210ENST00000568388 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.49■■□□□ 1.51
SPNS1-210ENST00000568388 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SPNS1-210ENST00000568388 DCTN1Q14203 1278 aa24.47■■□□□ 1.51
SPNS1-210ENST00000568388 MCM10Q7L590 875 aa24.47■■□□□ 1.51
SPNS1-210ENST00000568388 DCAF5Q96JK2 942 aa24.47■■□□□ 1.51
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC125Q86Z20 511 aa24.46■■□□□ 1.51
SPNS1-210ENST00000568388 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SPNS1-210ENST00000568388 LGR6Q9HBX8 967 aa24.46■■□□□ 1.51
SPNS1-210ENST00000568388 SLFN5Q08AF3 891 aa24.45■■□□□ 1.5
SPNS1-210ENST00000568388 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.45■■□□□ 1.5
SPNS1-210ENST00000568388 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.45■■□□□ 1.5
SPNS1-210ENST00000568388 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SPNS1-210ENST00000568388 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SPNS1-210ENST00000568388 A0A0G2JS52 829 aa24.44■■□□□ 1.5
SPNS1-210ENST00000568388 MYT1Q01538 1121 aa24.44■■□□□ 1.5
SPNS1-210ENST00000568388 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SPNS1-210ENST00000568388 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SPNS1-210ENST00000568388 E9PSI1 815 aa24.43■■□□□ 1.5
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF853P0CG23 659 aa24.43■■□□□ 1.5
SPNS1-210ENST00000568388 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.42■■□□□ 1.5
SPNS1-210ENST00000568388 IFT57Q9NWB7 429 aa24.42■■□□□ 1.5
SPNS1-210ENST00000568388 GNAI1P63096 354 aa24.41■■□□□ 1.5
SPNS1-210ENST00000568388 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SPNS1-210ENST00000568388 CFAP44Q96MT7 982 aa24.41■■□□□ 1.5
SPNS1-210ENST00000568388 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SPNS1-210ENST00000568388 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.41■■□□□ 1.5
SPNS1-210ENST00000568388 MRC1P22897 1456 aa24.4■■□□□ 1.5
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