RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 DOT1LQ8TEK3 1739 aa29■■■□□ 2.23
PPP4C-211ENST00000567642 FLT4P35916 1363 aa29■■■□□ 2.23
PPP4C-211ENST00000567642 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
PPP4C-211ENST00000567642 INSRP06213 1382 aa28.99■■■□□ 2.23
PPP4C-211ENST00000567642 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.97■■■□□ 2.23
PPP4C-211ENST00000567642 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
PPP4C-211ENST00000567642 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.96■■■□□ 2.23
PPP4C-211ENST00000567642 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PPP4C-211ENST00000567642 SLC15A2Q16348 729 aa28.96■■■□□ 2.23
PPP4C-211ENST00000567642 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.96■■■□□ 2.23
PPP4C-211ENST00000567642 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.96■■■□□ 2.23
PPP4C-211ENST00000567642 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
PPP4C-211ENST00000567642 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
PPP4C-211ENST00000567642 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4C-211ENST00000567642 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
PPP4C-211ENST00000567642 ZBTB7AO95365 584 aa28.92■■■□□ 2.22
PPP4C-211ENST00000567642 PAPPAQ13219 1627 aa28.9■■■□□ 2.22
PPP4C-211ENST00000567642 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
PPP4C-211ENST00000567642 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
PPP4C-211ENST00000567642 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.87■■■□□ 2.21
PPP4C-211ENST00000567642 PANK3Q9H999 370 aa28.86■■■□□ 2.21
PPP4C-211ENST00000567642 LY75O60449 1722 aa28.86■■■□□ 2.21
PPP4C-211ENST00000567642 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28.84■■■□□ 2.21
PPP4C-211ENST00000567642 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.84■■■□□ 2.21
PPP4C-211ENST00000567642 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.84■■■□□ 2.21
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF827Q17R98 1081 aa28.83■■■□□ 2.21
PPP4C-211ENST00000567642 POLKQ9UBT6 870 aa28.83■■■□□ 2.21
PPP4C-211ENST00000567642 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.83■■■□□ 2.21
PPP4C-211ENST00000567642 NSD2O96028 1365 aa28.82■■■□□ 2.2
PPP4C-211ENST00000567642 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.81■■■□□ 2.2
PPP4C-211ENST00000567642 KCNQ4P56696 695 aa28.81■■■□□ 2.2
PPP4C-211ENST00000567642 MTFR1LQ9H019 292 aa28.8■■■□□ 2.2
PPP4C-211ENST00000567642 ITGB4P16144 1822 aa28.79■■■□□ 2.2
PPP4C-211ENST00000567642 QSER1Q2KHR3 1735 aa28.79■■■□□ 2.2
PPP4C-211ENST00000567642 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa28.78■■■□□ 2.2
PPP4C-211ENST00000567642 PTGER2P43116 358 aa28.78■■■□□ 2.2
PPP4C-211ENST00000567642 EYA1Q99502 592 aa28.78■■■□□ 2.2
PPP4C-211ENST00000567642 AKT1S1Q96B36 256 aa28.77■■■□□ 2.2
PPP4C-211ENST00000567642 CYP27B1O15528 508 aa28.76■■■□□ 2.19
PPP4C-211ENST00000567642 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
PPP4C-211ENST00000567642 NCAPD2Q15021 1401 aa28.76■■■□□ 2.19
PPP4C-211ENST00000567642 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.75■■■□□ 2.19
PPP4C-211ENST00000567642 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.74■■■□□ 2.19
PPP4C-211ENST00000567642 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa28.74■■■□□ 2.19
PPP4C-211ENST00000567642 SPG7Q9UQ90 795 aa28.74■■■□□ 2.19
PPP4C-211ENST00000567642 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
PPP4C-211ENST00000567642 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.73■■■□□ 2.19
PPP4C-211ENST00000567642 MORC1Q86VD1 984 aa28.71■■■□□ 2.19
PPP4C-211ENST00000567642 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.7■■■□□ 2.18
PPP4C-211ENST00000567642 C5P01031 1676 aa28.69■■■□□ 2.18
PPP4C-211ENST00000567642 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa28.69■■■□□ 2.18
PPP4C-211ENST00000567642 SGIP1Q9BQI5 828 aa28.68■■■□□ 2.18
PPP4C-211ENST00000567642 TAF1LQ8IZX4 1826 aa28.68■■■□□ 2.18
PPP4C-211ENST00000567642 ARXQ96QS3 562 aa28.67■■■□□ 2.18
PPP4C-211ENST00000567642 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
PPP4C-211ENST00000567642 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.66■■■□□ 2.18
PPP4C-211ENST00000567642 PALLDQ8WX93 1383 aa28.65■■■□□ 2.18
PPP4C-211ENST00000567642 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
PPP4C-211ENST00000567642 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.65■■■□□ 2.18
PPP4C-211ENST00000567642 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.65■■■□□ 2.18
PPP4C-211ENST00000567642 MSH5O43196 834 aa28.64■■■□□ 2.18
PPP4C-211ENST00000567642 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.63■■■□□ 2.17
PPP4C-211ENST00000567642 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
PPP4C-211ENST00000567642 SYT17Q9BSW7 474 aa28.63■■■□□ 2.17
PPP4C-211ENST00000567642 PIGBQ92521 554 aa28.62■■■□□ 2.17
PPP4C-211ENST00000567642 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.62■■■□□ 2.17
PPP4C-211ENST00000567642 PHKG2P15735 406 aa28.61■■■□□ 2.17
PPP4C-211ENST00000567642 POLD1P28340 1107 aa28.61■■■□□ 2.17
PPP4C-211ENST00000567642 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.6■■■□□ 2.17
PPP4C-211ENST00000567642 YY1P25490 414 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP4C-211ENST00000567642 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
PPP4C-211ENST00000567642 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP4C-211ENST00000567642 KLHL34Q8N239 644 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP4C-211ENST00000567642 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
PPP4C-211ENST00000567642 C4BP0C0L5 1744 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP4C-211ENST00000567642 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
PPP4C-211ENST00000567642 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
PPP4C-211ENST00000567642 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.53■■■□□ 2.16
PPP4C-211ENST00000567642 AK7Q96M32 723 aa28.52■■■□□ 2.16
PPP4C-211ENST00000567642 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.52■■■□□ 2.16
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
PPP4C-211ENST00000567642 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.51■■■□□ 2.15
PPP4C-211ENST00000567642 UBR3Q6ZT12 1888 aa28.51■■■□□ 2.15
PPP4C-211ENST00000567642 MAP3K5Q99683 1374 aa28.5■■■□□ 2.15
PPP4C-211ENST00000567642 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.5■■■□□ 2.15
PPP4C-211ENST00000567642 SIK1P57059 783 aa28.5■■■□□ 2.15
PPP4C-211ENST00000567642 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.5■■■□□ 2.15
PPP4C-211ENST00000567642 MSL1Q68DK7 614 aa28.5■■■□□ 2.15
PPP4C-211ENST00000567642 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.5■■■□□ 2.15
PPP4C-211ENST00000567642 FLAD1Q8NFF5 587 aa28.5■■■□□ 2.15
PPP4C-211ENST00000567642 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
PPP4C-211ENST00000567642 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
PPP4C-211ENST00000567642 CHD4Q14839 1912 aa28.47■■■□□ 2.15
PPP4C-211ENST00000567642 IL13P35225 146 aa28.47■■■□□ 2.15
PPP4C-211ENST00000567642 DCAF5Q96JK2 942 aa28.47■■■□□ 2.15
PPP4C-211ENST00000567642 ATG3Q9NT62 314 aa28.47■■■□□ 2.15
PPP4C-211ENST00000567642 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
PPP4C-211ENST00000567642 PHF14O94880 888 aa28.46■■■□□ 2.15
PPP4C-211ENST00000567642 ATP6V1AP38606 617 aa28.46■■■□□ 2.15
PPP4C-211ENST00000567642 MTHFSP49914 203 aa28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 310.4 ms