RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567228.1

E2F4-209, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene E2F4, Length 757 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-209ENST00000567228 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.8■■□□□ 1.88
E2F4-209ENST00000567228 CASZ1Q86V15 1759 aa26.79■■□□□ 1.88
E2F4-209ENST00000567228 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
E2F4-209ENST00000567228 NSD2O96028 1365 aa26.78■■□□□ 1.88
E2F4-209ENST00000567228 BTAF1O14981 1849 aa26.77■■□□□ 1.88
E2F4-209ENST00000567228 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.76■■□□□ 1.88
E2F4-209ENST00000567228 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
E2F4-209ENST00000567228 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.76■■□□□ 1.87
E2F4-209ENST00000567228 PTGER2P43116 358 aa26.76■■□□□ 1.87
E2F4-209ENST00000567228 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.76■■□□□ 1.87
E2F4-209ENST00000567228 POLKQ9UBT6 870 aa26.76■■□□□ 1.87
E2F4-209ENST00000567228 NCAPD2Q15021 1401 aa26.75■■□□□ 1.87
E2F4-209ENST00000567228 PAPPAQ13219 1627 aa26.75■■□□□ 1.87
E2F4-209ENST00000567228 ZBTB7AO95365 584 aa26.74■■□□□ 1.87
E2F4-209ENST00000567228 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
E2F4-209ENST00000567228 ZNF827Q17R98 1081 aa26.73■■□□□ 1.87
E2F4-209ENST00000567228 AKT1S1Q96B36 256 aa26.73■■□□□ 1.87
E2F4-209ENST00000567228 PANK3Q9H999 370 aa26.73■■□□□ 1.87
E2F4-209ENST00000567228 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.72■■□□□ 1.87
E2F4-209ENST00000567228 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.72■■□□□ 1.87
E2F4-209ENST00000567228 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.72■■□□□ 1.87
E2F4-209ENST00000567228 CYP27B1O15528 508 aa26.7■■□□□ 1.86
E2F4-209ENST00000567228 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
E2F4-209ENST00000567228 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
E2F4-209ENST00000567228 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.69■■□□□ 1.86
E2F4-209ENST00000567228 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
E2F4-209ENST00000567228 EYA1Q99502 592 aa26.69■■□□□ 1.86
E2F4-209ENST00000567228 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.68■■□□□ 1.86
E2F4-209ENST00000567228 KCNQ4P56696 695 aa26.68■■□□□ 1.86
E2F4-209ENST00000567228 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
E2F4-209ENST00000567228 MTFR1LQ9H019 292 aa26.67■■□□□ 1.86
E2F4-209ENST00000567228 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.66■■□□□ 1.86
E2F4-209ENST00000567228 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.66■■□□□ 1.86
E2F4-209ENST00000567228 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
E2F4-209ENST00000567228 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.64■■□□□ 1.85
E2F4-209ENST00000567228 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
E2F4-209ENST00000567228 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
E2F4-209ENST00000567228 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.85
E2F4-209ENST00000567228 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
E2F4-209ENST00000567228 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa26.61■■□□□ 1.85
E2F4-209ENST00000567228 LY75O60449 1722 aa26.6■■□□□ 1.85
E2F4-209ENST00000567228 SLC16A10Q8TF71 515 aa26.58■■□□□ 1.85
E2F4-209ENST00000567228 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
E2F4-209ENST00000567228 SPG7Q9UQ90 795 aa26.57■■□□□ 1.84
E2F4-209ENST00000567228 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.56■■□□□ 1.84
E2F4-209ENST00000567228 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.56■■□□□ 1.84
E2F4-209ENST00000567228 SYT17Q9BSW7 474 aa26.56■■□□□ 1.84
E2F4-209ENST00000567228 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
E2F4-209ENST00000567228 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa26.55■■□□□ 1.84
E2F4-209ENST00000567228 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.55■■□□□ 1.84
E2F4-209ENST00000567228 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.55■■□□□ 1.84
E2F4-209ENST00000567228 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
E2F4-209ENST00000567228 PIGBQ92521 554 aa26.54■■□□□ 1.84
E2F4-209ENST00000567228 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.53■■□□□ 1.84
E2F4-209ENST00000567228 PHKG2P15735 406 aa26.52■■□□□ 1.84
E2F4-209ENST00000567228 MORC1Q86VD1 984 aa26.52■■□□□ 1.84
E2F4-209ENST00000567228 ARXQ96QS3 562 aa26.52■■□□□ 1.84
E2F4-209ENST00000567228 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.51■■□□□ 1.83
E2F4-209ENST00000567228 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.51■■□□□ 1.83
E2F4-209ENST00000567228 PALLDQ8WX93 1383 aa26.51■■□□□ 1.83
E2F4-209ENST00000567228 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
E2F4-209ENST00000567228 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.51■■□□□ 1.83
E2F4-209ENST00000567228 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.5■■□□□ 1.83
E2F4-209ENST00000567228 MAP3K5Q99683 1374 aa26.49■■□□□ 1.83
E2F4-209ENST00000567228 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
E2F4-209ENST00000567228 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
E2F4-209ENST00000567228 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.47■■□□□ 1.83
E2F4-209ENST00000567228 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.45■■□□□ 1.82
E2F4-209ENST00000567228 UTRNP46939 3433 aa26.45■■□□□ 1.82
E2F4-209ENST00000567228 ITGB4P16144 1822 aa26.44■■□□□ 1.82
E2F4-209ENST00000567228 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.44■■□□□ 1.82
E2F4-209ENST00000567228 IL13P35225 146 aa26.43■■□□□ 1.82
E2F4-209ENST00000567228 AMIGO3Q86WK7 504 aa26.43■■□□□ 1.82
E2F4-209ENST00000567228 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.43■■□□□ 1.82
E2F4-209ENST00000567228 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
E2F4-209ENST00000567228 DCAF8L1A6NGE4 600 aa26.41■■□□□ 1.82
E2F4-209ENST00000567228 ATG3Q9NT62 314 aa26.41■■□□□ 1.82
E2F4-209ENST00000567228 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.41■■□□□ 1.82
E2F4-209ENST00000567228 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.4■■□□□ 1.82
E2F4-209ENST00000567228 YY1P25490 414 aa26.4■■□□□ 1.82
E2F4-209ENST00000567228 SIK1P57059 783 aa26.4■■□□□ 1.82
E2F4-209ENST00000567228 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
E2F4-209ENST00000567228 KDRP35968 1356 aa26.4■■□□□ 1.82
E2F4-209ENST00000567228 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.39■■□□□ 1.82
E2F4-209ENST00000567228 POLD1P28340 1107 aa26.39■■□□□ 1.82
E2F4-209ENST00000567228 ITPK1Q13572 414 aa26.38■■□□□ 1.81
E2F4-209ENST00000567228 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.38■■□□□ 1.81
E2F4-209ENST00000567228 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.38■■□□□ 1.81
E2F4-209ENST00000567228 DCAF5Q96JK2 942 aa26.38■■□□□ 1.81
E2F4-209ENST00000567228 C5P01031 1676 aa26.38■■□□□ 1.81
E2F4-209ENST00000567228 MTHFSP49914 203 aa26.37■■□□□ 1.81
E2F4-209ENST00000567228 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.37■■□□□ 1.81
E2F4-209ENST00000567228 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.37■■□□□ 1.81
E2F4-209ENST00000567228 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.36■■□□□ 1.81
E2F4-209ENST00000567228 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
E2F4-209ENST00000567228 SMIM5Q71RC9 77 aa26.35■■□□□ 1.81
E2F4-209ENST00000567228 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.35■■□□□ 1.81
E2F4-209ENST00000567228 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
E2F4-209ENST00000567228 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
E2F4-209ENST00000567228 C4BP0C0L5 1744 aa26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms