RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SPNS1-208ENST00000566059 KDRP35968 1356 aa24.05■■□□□ 1.44
SPNS1-208ENST00000566059 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SPNS1-208ENST00000566059 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.04■■□□□ 1.44
SPNS1-208ENST00000566059 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.441e-9■■■■□ 21.7
SPNS1-208ENST00000566059 HMOX1P09601 288 aa24.03■■□□□ 1.44
SPNS1-208ENST00000566059 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SPNS1-208ENST00000566059 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SPNS1-208ENST00000566059 NUDCQ9Y266 331 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS1-208ENST00000566059 ANP32CO43423 234 aa24■■□□□ 1.43
SPNS1-208ENST00000566059 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.43
SPNS1-208ENST00000566059 SPG7Q9UQ90 795 aa23.99■■□□□ 1.43
SPNS1-208ENST00000566059 BCL9O00512 1426 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS1-208ENST00000566059 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS1-208ENST00000566059 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS1-208ENST00000566059 CYP27B1O15528 508 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS1-208ENST00000566059 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.97■■□□□ 1.43
SPNS1-208ENST00000566059 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.97■■□□□ 1.43
SPNS1-208ENST00000566059 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SPNS1-208ENST00000566059 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.43
SPNS1-208ENST00000566059 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.97■■□□□ 1.43
SPNS1-208ENST00000566059 TRIM37O94972 964 aa23.95■■□□□ 1.43
SPNS1-208ENST00000566059 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.43
SPNS1-208ENST00000566059 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.95■■□□□ 1.42
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC125Q86Z20 511 aa23.95■■□□□ 1.42
SPNS1-208ENST00000566059 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.94■■□□□ 1.42
SPNS1-208ENST00000566059 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-208ENST00000566059 FCHSD2O94868 740 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-208ENST00000566059 PHKG2P15735 406 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-208ENST00000566059 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-208ENST00000566059 PRKAR2BP31323 418 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS1-208ENST00000566059 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS1-208ENST00000566059 KCNQ2O43526 872 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-208ENST00000566059 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC184Q52MB2 194 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-208ENST00000566059 SBF2Q86WG5 1849 aa23.89■■□□□ 1.41
SPNS1-208ENST00000566059 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SPNS1-208ENST00000566059 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.88■■□□□ 1.41
SPNS1-208ENST00000566059 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SPNS1-208ENST00000566059 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SPNS1-208ENST00000566059 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-208ENST00000566059 APBA3O96018 575 aa23.85■■□□□ 1.41
SPNS1-208ENST00000566059 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.85■■□□□ 1.41
SPNS1-208ENST00000566059 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.85■■□□□ 1.41
SPNS1-208ENST00000566059 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SPNS1-208ENST00000566059 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SPNS1-208ENST00000566059 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.84■■□□□ 1.41
SPNS1-208ENST00000566059 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.84■■□□□ 1.41
SPNS1-208ENST00000566059 NHSQ6T4R5 1651 aa23.83■■□□□ 1.41
SPNS1-208ENST00000566059 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.83■■□□□ 1.41
SPNS1-208ENST00000566059 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
SPNS1-208ENST00000566059 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
SPNS1-208ENST00000566059 DCAF5Q96JK2 942 aa23.82■■□□□ 1.4
SPNS1-208ENST00000566059 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.82■■□□□ 1.4
SPNS1-208ENST00000566059 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.82■■□□□ 1.4
SPNS1-208ENST00000566059 BAG6P46379 1132 aa23.81■■□□□ 1.4
SPNS1-208ENST00000566059 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.81■■□□□ 1.4
SPNS1-208ENST00000566059 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
SPNS1-208ENST00000566059 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.81■■□□□ 1.4
SPNS1-208ENST00000566059 MRS2Q9HD23 443 aa23.81■■□□□ 1.4
SPNS1-208ENST00000566059 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.8■■□□□ 1.4
SPNS1-208ENST00000566059 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
SPNS1-208ENST00000566059 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.79■■□□□ 1.4
SPNS1-208ENST00000566059 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SPNS1-208ENST00000566059 PLSCR1O15162 318 aa23.77■■□□□ 1.4
SPNS1-208ENST00000566059 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.77■■□□□ 1.4
SPNS1-208ENST00000566059 LGR6Q9HBX8 967 aa23.77■■□□□ 1.4
SPNS1-208ENST00000566059 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.77■■□□□ 1.4
SPNS1-208ENST00000566059 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SPNS1-208ENST00000566059 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-208ENST00000566059 NEFMP07197 916 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-208ENST00000566059 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-208ENST00000566059 PIGBQ92521 554 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-208ENST00000566059 MAP3K5Q99683 1374 aa23.75■■□□□ 1.39
SPNS1-208ENST00000566059 BTAF1O14981 1849 aa23.75■■□□□ 1.39
SPNS1-208ENST00000566059 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-208ENST00000566059 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-208ENST00000566059 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-208ENST00000566059 IL17REQ8NFR9 667 aa23.73■■□□□ 1.39
SPNS1-208ENST00000566059 ITGB4P16144 1822 aa23.72■■□□□ 1.39
SPNS1-208ENST00000566059 PROM2Q8N271 834 aa23.72■■□□□ 1.39
SPNS1-208ENST00000566059 RUNDC1Q96C34 613 aa23.72■■□□□ 1.39
SPNS1-208ENST00000566059 CABP4P57796 275 aa23.71■■□□□ 1.39
SPNS1-208ENST00000566059 NFE2L2Q16236 605 aa23.71■■□□□ 1.39
SPNS1-208ENST00000566059 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.71■■□□□ 1.39
SPNS1-208ENST00000566059 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-208ENST00000566059 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-208ENST00000566059 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.69■■□□□ 1.38
SPNS1-208ENST00000566059 TXNRD1Q16881 649 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-208ENST00000566059 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-208ENST00000566059 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-208ENST00000566059 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-208ENST00000566059 MCM10Q7L590 875 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-208ENST00000566059 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-208ENST00000566059 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-208ENST00000566059 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-208ENST00000566059 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-208ENST00000566059 DCTN1Q14203 1278 aa23.66■■□□□ 1.38
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