RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565236.1

CLN3-215, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-215ENST00000565236 SPON1Q9HCB6 807 aa31.01■■■□□ 2.55
CLN3-215ENST00000565236 STK32BQ9NY57 414 aa31.01■■■□□ 2.55
CLN3-215ENST00000565236 MEGF6O75095 1541 aa30.99■■■□□ 2.55
CLN3-215ENST00000565236 TATP17735 454 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
CLN3-215ENST00000565236 BTAF1O14981 1849 aa30.98■■■□□ 2.55
CLN3-215ENST00000565236 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
CLN3-215ENST00000565236 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
CLN3-215ENST00000565236 SLC15A2Q16348 729 aa30.96■■■□□ 2.55
CLN3-215ENST00000565236 PANK3Q9H999 370 aa30.96■■■□□ 2.55
CLN3-215ENST00000565236 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
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CLN3-215ENST00000565236 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.92■■■□□ 2.54
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CLN3-215ENST00000565236 POLKQ9UBT6 870 aa30.91■■■□□ 2.54
CLN3-215ENST00000565236 SHANK3Q9BYB0 1731 aa30.89■■■□□ 2.54
CLN3-215ENST00000565236 LRRC4BQ9NT99 713 aa30.88■■■□□ 2.53
CLN3-215ENST00000565236 ZBTB7AO95365 584 aa30.87■■■□□ 2.53
CLN3-215ENST00000565236 SLC27A3Q5K4L6 730 aa30.87■■■□□ 2.53
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CLN3-215ENST00000565236 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa30.87■■■□□ 2.53
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CLN3-215ENST00000565236 DOT1LQ8TEK3 1739 aa30.85■■■□□ 2.53
CLN3-215ENST00000565236 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa30.85■■■□□ 2.53
CLN3-215ENST00000565236 EYA1Q99502 592 aa30.83■■■□□ 2.53
CLN3-215ENST00000565236 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
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CLN3-215ENST00000565236 CYP27B1O15528 508 aa30.8■■■□□ 2.52
CLN3-215ENST00000565236 ZNF827Q17R98 1081 aa30.8■■■□□ 2.52
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CLN3-215ENST00000565236 MORC1Q86VD1 984 aa30.79■■■□□ 2.52
CLN3-215ENST00000565236 MTFR1LQ9H019 292 aa30.79■■■□□ 2.52
CLN3-215ENST00000565236 SPG7Q9UQ90 795 aa30.79■■■□□ 2.52
CLN3-215ENST00000565236 PAPPAQ13219 1627 aa30.79■■■□□ 2.52
CLN3-215ENST00000565236 KCNQ4P56696 695 aa30.78■■■□□ 2.52
CLN3-215ENST00000565236 NCAPD2Q15021 1401 aa30.78■■■□□ 2.52
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CLN3-215ENST00000565236 AKT1S1Q96B36 256 aa30.77■■■□□ 2.52
CLN3-215ENST00000565236 PTGER2P43116 358 aa30.76■■■□□ 2.51
CLN3-215ENST00000565236 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
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CLN3-215ENST00000565236 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP30.74■■■□□ 2.51
CLN3-215ENST00000565236 KIF7Q2M1P5 1343 aa30.73■■■□□ 2.51
CLN3-215ENST00000565236 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa30.73■■■□□ 2.51
CLN3-215ENST00000565236 LY75O60449 1722 aa30.72■■■□□ 2.51
CLN3-215ENST00000565236 PKD1L3Q7Z443 1732 aa30.72■■■□□ 2.51
CLN3-215ENST00000565236 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
CLN3-215ENST00000565236 DCAF8L1A6NGE4 600 aa30.69■■■□□ 2.5
CLN3-215ENST00000565236 IFNL2Q8IZJ0 200 aa30.67■■■□□ 2.5
CLN3-215ENST00000565236 SLC16A10Q8TF71 515 aa30.67■■■□□ 2.5
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CLN3-215ENST00000565236 IGSF1Q8N6C5 1336 aa30.66■■■□□ 2.5
CLN3-215ENST00000565236 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
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CLN3-215ENST00000565236 PIGBQ92521 554 aa30.64■■■□□ 2.5
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CLN3-215ENST00000565236 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
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CLN3-215ENST00000565236 SYT17Q9BSW7 474 aa30.6■■■□□ 2.49
CLN3-215ENST00000565236 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa30.6■■■□□ 2.49
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CLN3-215ENST00000565236 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
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CLN3-215ENST00000565236 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
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CLN3-215ENST00000565236 AMOTQ4VCS5 1084 aa30.55■■■□□ 2.48
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CLN3-215ENST00000565236 SULT6B1Q6IMI4 303 aa30.53■■■□□ 2.48
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CLN3-215ENST00000565236 ASAP1Q9ULH1 1129 aa30.52■■■□□ 2.48
CLN3-215ENST00000565236 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa30.51■■■□□ 2.47
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CLN3-215ENST00000565236 DCAF5Q96JK2 942 aa30.51■■■□□ 2.47
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CLN3-215ENST00000565236 ERVV-2B6SEH9 535 aa30.5■■■□□ 2.47
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CLN3-215ENST00000565236 C1orf141Q5JVX7 400 aa30.48■■■□□ 2.47
CLN3-215ENST00000565236 MAP3K5Q99683 1374 aa30.47■■■□□ 2.47
CLN3-215ENST00000565236 YY1P25490 414 aa30.47■■■□□ 2.47
CLN3-215ENST00000565236 KLHL34Q8N239 644 aa30.47■■■□□ 2.47
CLN3-215ENST00000565236 ATG3Q9NT62 314 aa30.47■■■□□ 2.47
CLN3-215ENST00000565236 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
CLN3-215ENST00000565236 KDRP35968 1356 aa30.45■■■□□ 2.47
CLN3-215ENST00000565236 ATP6V1AP38606 617 aa30.45■■■□□ 2.47
CLN3-215ENST00000565236 C4BP0C0L5 1744 aa30.44■■■□□ 2.46
CLN3-215ENST00000565236 COL24A1Q17RW2 1714 aa30.44■■■□□ 2.46
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