RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563386.5

USP10-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-208ENST00000563386 EYA1Q99502 592 aa25.74■■□□□ 1.71
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USP10-208ENST00000563386 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
USP10-208ENST00000563386 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.69■■□□□ 1.7
USP10-208ENST00000563386 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.69■■□□□ 1.7
USP10-208ENST00000563386 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
USP10-208ENST00000563386 MTHFSP49914 203 aa25.66■■□□□ 1.7
USP10-208ENST00000563386 NHSQ6T4R5 1651 aa25.66■■□□□ 1.7
USP10-208ENST00000563386 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.66■■□□□ 1.7
USP10-208ENST00000563386 PLSCR1O15162 318 aa25.65■■□□□ 1.7
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USP10-208ENST00000563386 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.64■■□□□ 1.7
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USP10-208ENST00000563386 RREB1Q92766 1687 aa25.63■■□□□ 1.69
USP10-208ENST00000563386 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.62■■□□□ 1.69
USP10-208ENST00000563386 NBPF14Q5TI25 921 aa25.62■■□□□ 1.69
USP10-208ENST00000563386 SPG7Q9UQ90 795 aa25.62■■□□□ 1.69
USP10-208ENST00000563386 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.61■■□□□ 1.69
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USP10-208ENST00000563386 CYP27B1O15528 508 aa25.6■■□□□ 1.69
USP10-208ENST00000563386 BTAF1O14981 1849 aa25.6■■□□□ 1.69
USP10-208ENST00000563386 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.6■■□□□ 1.69
USP10-208ENST00000563386 TXNRD1Q16881 649 aa25.58■■□□□ 1.69
USP10-208ENST00000563386 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.58■■□□□ 1.69
USP10-208ENST00000563386 PROM2Q8N271 834 aa25.58■■□□□ 1.69
USP10-208ENST00000563386 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
USP10-208ENST00000563386 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.58■■□□□ 1.69
USP10-208ENST00000563386 IL13P35225 146 aa25.57■■□□□ 1.68
USP10-208ENST00000563386 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.57■■□□□ 1.68
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USP10-208ENST00000563386 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
USP10-208ENST00000563386 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
USP10-208ENST00000563386 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.54■■□□□ 1.688e-13■□□□□ 10
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USP10-208ENST00000563386 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.51■■□□□ 1.67
USP10-208ENST00000563386 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
USP10-208ENST00000563386 HMOX1P09601 288 aa25.5■■□□□ 1.67
USP10-208ENST00000563386 PHKG2P15735 406 aa25.5■■□□□ 1.67
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USP10-208ENST00000563386 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
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USP10-208ENST00000563386 STK32BQ9NY57 414 aa25.48■■□□□ 1.67
USP10-208ENST00000563386 PPP2R1AP30153 589 aa25.47■■□□□ 1.67
USP10-208ENST00000563386 KCNQ4P56696 695 aa25.47■■□□□ 1.67
USP10-208ENST00000563386 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
USP10-208ENST00000563386 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.47■■□□□ 1.67
USP10-208ENST00000563386 CFAP53Q96M91 514 aa25.47■■□□□ 1.67
USP10-208ENST00000563386 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.46■■□□□ 1.67
USP10-208ENST00000563386 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.45■■□□□ 1.66
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USP10-208ENST00000563386 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.44■■□□□ 1.66
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USP10-208ENST00000563386 PALLDQ8WX93 1383 aa25.39■■□□□ 1.65
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USP10-208ENST00000563386 ZNF827Q17R98 1081 aa25.37■■□□□ 1.65
USP10-208ENST00000563386 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
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USP10-208ENST00000563386 CABP4P57796 275 aa25.35■■□□□ 1.65
USP10-208ENST00000563386 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.35■■□□□ 1.65
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USP10-208ENST00000563386 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.65
USP10-208ENST00000563386 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
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USP10-208ENST00000563386 SPON1Q9HCB6 807 aa25.32■■□□□ 1.64
USP10-208ENST00000563386 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.32■■□□□ 1.64
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USP10-208ENST00000563386 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
USP10-208ENST00000563386 RALBP1Q15311 655 aa25.28■■□□□ 1.64
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USP10-208ENST00000563386 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.27■■□□□ 1.64
USP10-208ENST00000563386 SIK1P57059 783 aa25.27■■□□□ 1.64
USP10-208ENST00000563386 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
USP10-208ENST00000563386 C5P01031 1676 aa25.26■■□□□ 1.63
USP10-208ENST00000563386 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.26■■□□□ 1.63
USP10-208ENST00000563386 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
USP10-208ENST00000563386 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
USP10-208ENST00000563386 MSH5O43196 834 aa25.25■■□□□ 1.63
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