RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	30	■■■□□ 2.39
PPP4C-205	ENST00000563200	POLK	Q9UBT6	870 aa		30	■■■□□ 2.39
PPP4C-205	ENST00000563200	BTAF1	O14981	1849 aa		30	■■■□□ 2.39
PPP4C-205	ENST00000563200	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		30	■■■□□ 2.39
PPP4C-205	ENST00000563200	TXNRD1	Q16881	649 aa		29.97	■■■□□ 2.39
PPP4C-205	ENST00000563200	NCAPD2	Q15021	1401 aa		29.97	■■■□□ 2.39
PPP4C-205	ENST00000563200	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	29.96	■■■□□ 2.39
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		29.96	■■■□□ 2.39
PPP4C-205	ENST00000563200	NSD2	O96028	1365 aa		29.96	■■■□□ 2.39
PPP4C-205	ENST00000563200	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	29.96	■■■□□ 2.39
PPP4C-205	ENST00000563200	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		29.95	■■■□□ 2.38
PPP4C-205	ENST00000563200	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	29.92	■■■□□ 2.38
PPP4C-205	ENST00000563200	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		29.92	■■■□□ 2.38
PPP4C-205	ENST00000563200	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	29.91	■■■□□ 2.38
PPP4C-205	ENST00000563200	EYA1	Q99502	592 aa		29.88	■■■□□ 2.37
PPP4C-205	ENST00000563200	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		29.88	■■■□□ 2.37
PPP4C-205	ENST00000563200	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	29.88	■■■□□ 2.37
PPP4C-205	ENST00000563200	PAPPA	Q13219	1627 aa		29.87	■■■□□ 2.37
PPP4C-205	ENST00000563200	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		29.87	■■■□□ 2.37
PPP4C-205	ENST00000563200	CASZ1	Q86V15	1759 aa		29.87	■■■□□ 2.37
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		29.85	■■■□□ 2.37
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		29.85	■■■□□ 2.37
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	29.85	■■■□□ 2.37
PPP4C-205	ENST00000563200	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	29.85	■■■□□ 2.37
PPP4C-205	ENST00000563200	MORC1	Q86VD1	984 aa		29.83	■■■□□ 2.37
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP27B1	O15528	508 aa		29.82	■■■□□ 2.36
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC15A2	Q16348	729 aa		29.82	■■■□□ 2.36
PPP4C-205	ENST00000563200	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	29.82	■■■□□ 2.36
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		29.82	■■■□□ 2.36
PPP4C-205	ENST00000563200	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	29.81	■■■□□ 2.36
PPP4C-205	ENST00000563200	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	29.81	■■■□□ 2.36
PPP4C-205	ENST00000563200	LY75	O60449	1722 aa		29.81	■■■□□ 2.36
PPP4C-205	ENST00000563200	STK32B	Q9NY57	414 aa		29.8	■■■□□ 2.36
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PPP4C-205	ENST00000563200	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	29.78	■■■□□ 2.36
PPP4C-205	ENST00000563200	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP4C-205	ENST00000563200	SPON1	Q9HCB6	807 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP4C-205	ENST00000563200	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP4C-205	ENST00000563200	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PPP4C-205	ENST00000563200	SPG7	Q9UQ90	795 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PPP4C-205	ENST00000563200	ITGB4	P16144	1822 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF827	Q17R98	1081 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP4C-205	ENST00000563200	AKT1S1	Q96B36	256 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNQ4	P56696	695 aa		29.7	■■■□□ 2.34
PPP4C-205	ENST00000563200	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBTB7A	O95365	584 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PPP4C-205	ENST00000563200	PHKG2	P15735	406 aa		29.67	■■■□□ 2.34
PPP4C-205	ENST00000563200	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		29.67	■■■□□ 2.34
PPP4C-205	ENST00000563200	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		29.67	■■■□□ 2.34
PPP4C-205	ENST00000563200	IL13	P35225	146 aa		29.65	■■■□□ 2.34
PPP4C-205	ENST00000563200	PTGER2	P43116	358 aa		29.65	■■■□□ 2.34
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		29.65	■■■□□ 2.34
PPP4C-205	ENST00000563200	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	29.65	■■■□□ 2.34
PPP4C-205	ENST00000563200	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	29.64	■■■□□ 2.34
PPP4C-205	ENST00000563200	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		29.64	■■■□□ 2.34
PPP4C-205	ENST00000563200	KDR	P35968	1356 aa		29.63	■■■□□ 2.33
PPP4C-205	ENST00000563200	MTHFS	P49914	203 aa		29.62	■■■□□ 2.33
PPP4C-205	ENST00000563200	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		29.62	■■■□□ 2.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PIGB	Q92521	554 aa		29.62	■■■□□ 2.33
PPP4C-205	ENST00000563200	MTFR1L	Q9H019	292 aa		29.62	■■■□□ 2.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PALLD	Q8WX93	1383 aa		29.62	■■■□□ 2.33
PPP4C-205	ENST00000563200	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	29.62	■■■□□ 2.33
PPP4C-205	ENST00000563200	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		29.61	■■■□□ 2.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	29.6	■■■□□ 2.33
PPP4C-205	ENST00000563200	C5	P01031	1676 aa		29.59	■■■□□ 2.33
PPP4C-205	ENST00000563200	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		29.59	■■■□□ 2.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		29.59	■■■□□ 2.33
PPP4C-205	ENST00000563200	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		29.58	■■■□□ 2.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	29.57	■■■□□ 2.32
PPP4C-205	ENST00000563200	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	29.57	■■■□□ 2.32
PPP4C-205	ENST00000563200	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		29.57	■■■□□ 2.32
PPP4C-205	ENST00000563200	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		29.56	■■■□□ 2.32
PPP4C-205	ENST00000563200	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		29.55	■■■□□ 2.32
PPP4C-205	ENST00000563200	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		29.55	■■■□□ 2.32
PPP4C-205	ENST00000563200	UTRN	P46939	3433 aa		29.54	■■■□□ 2.32
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		29.54	■■■□□ 2.32
PPP4C-205	ENST00000563200	DCAF5	Q96JK2	942 aa		29.53	■■■□□ 2.32
PPP4C-205	ENST00000563200	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	29.52	■■■□□ 2.32
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	29.52	■■■□□ 2.32
PPP4C-205	ENST00000563200	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	29.52	■■■□□ 2.32
PPP4C-205	ENST00000563200	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		29.51	■■■□□ 2.31
PPP4C-205	ENST00000563200	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		29.51	■■■□□ 2.31
PPP4C-205	ENST00000563200	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	29.51	■■■□□ 2.31
PPP4C-205	ENST00000563200	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	29.49	■■■□□ 2.31
PPP4C-205	ENST00000563200	C4B	P0C0L5	1744 aa		29.49	■■■□□ 2.31
PPP4C-205	ENST00000563200	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	29.48	■■■□□ 2.31
PPP4C-205	ENST00000563200	ATG3	Q9NT62	314 aa		29.48	■■■□□ 2.31
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		29.47	■■■□□ 2.31
PPP4C-205	ENST00000563200	SIK1	P57059	783 aa		29.47	■■■□□ 2.31
PPP4C-205	ENST00000563200	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	29.46	■■■□□ 2.31
PPP4C-205	ENST00000563200	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	29.46	■■■□□ 2.31
PPP4C-205	ENST00000563200	ARX	Q96QS3	562 aa		29.45	■■■□□ 2.3
PPP4C-205	ENST00000563200	HMOX1	P09601	288 aa		29.44	■■■□□ 2.3
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		29.44	■■■□□ 2.3
PPP4C-205	ENST00000563200	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		29.44	■■■□□ 2.3
PPP4C-205	ENST00000563200	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		29.43	■■■□□ 2.3
PPP4C-205	ENST00000563200	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	29.43	■■■□□ 2.3
PPP4C-205	ENST00000563200	SYT17	Q9BSW7	474 aa		29.42	■■■□□ 2.3
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		29.42	■■■□□ 2.3

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