RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
TMOD3-211ENST00000561438 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
TMOD3-211ENST00000561438 TERF2IPQ9NYB0 399 aa11.42□□□□□ -0.58
TMOD3-211ENST00000561438 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa11.42□□□□□ -0.58
TMOD3-211ENST00000561438 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa11.41□□□□□ -0.58
TMOD3-211ENST00000561438 USP19O94966 1318 aa11.41□□□□□ -0.58
TMOD3-211ENST00000561438 SEC24BO95487 1268 aa11.41□□□□□ -0.58
TMOD3-211ENST00000561438 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
TMOD3-211ENST00000561438 MICALL2Q8IY33 904 aa11.41□□□□□ -0.58
TMOD3-211ENST00000561438 CABLES1Q8TDN4 633 aa11.41□□□□□ -0.58
TMOD3-211ENST00000561438 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
TMOD3-211ENST00000561438 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
TMOD3-211ENST00000561438 TOM1O60784 492 aa11.4□□□□□ -0.58
TMOD3-211ENST00000561438 HSPA1LP34931 641 aa11.4□□□□□ -0.58
TMOD3-211ENST00000561438 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
TMOD3-211ENST00000561438 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
TMOD3-211ENST00000561438 PSME1Q06323 249 aa11.39□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 SLC39A7Q92504 469 aa11.39□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.39□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 TTC21AQ8NDW8 1320 aa11.38□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 SHANK3Q9BYB0 1731 aa11.38□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.38□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 NSD2O96028 1365 aa11.38□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 NWD2Q9ULI1 1742 aa11.38□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 CGNL1Q0VF96 1302 aa11.37□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 DLG5Q8TDM6 1919 aa11.37□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 C7P10643 843 aa11.36□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 ABTB2Q8N961 1025 aa11.36□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 TMC2Q8TDI7 906 aa11.36□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 KNSTRNQ9Y448 316 aa11.36□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 ARHGEF10O15013 1369 aa11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 PPP2R1AP30153 589 aa11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-211ENST00000561438 AATKQ6ZMQ8 1374 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 ABCC6O95255 1503 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 MAP3K19Q56UN5 1328 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 KIAA0232Q92628 1395 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 CAMK2BQ13554 666 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 POLKQ9UBT6 870 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 GCP02774 474 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 MORC1Q86VD1 984 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 COG3Q96JB2 828 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 EP400Q96L91 3159 aa11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 CPDO75976 1380 aa11.3□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 JCADQ9P266 1359 aa11.3□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 FBXO41Q8TF61 875 aa11.3□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 BRWD3Q6RI45 1802 aa11.3□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 PKD1L3Q7Z443 1732 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 POTEIP0CG38 1075 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 CHRNA2Q15822 529 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 ARHGEF25Q86VW2 580 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 METRNQ9UJH8 293 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 SLIT2O94813 1529 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 GLI3P10071 1580 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 MTHFSP49914 203 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 DSG2Q14126 1118 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 NLRP13Q86W25 1043 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 NCAPD2Q15021 1401 aa11.27□□□□□ -0.6
TMOD3-211ENST00000561438 FOXK1P85037 733 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD3-211ENST00000561438 LRRC37A3O60309 1634 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD3-211ENST00000561438 INSRP06213 1382 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD3-211ENST00000561438 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
TMOD3-211ENST00000561438 BCL9LQ86UU0 1499 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD3-211ENST00000561438 FAM83GA6ND36 823 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD3-211ENST00000561438 HOXC9P31274 260 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD3-211ENST00000561438 RALBP1Q15311 655 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD3-211ENST00000561438 RTL1A6NKG5 1358 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD3-211ENST00000561438 FLT4P35916 1363 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD3-211ENST00000561438 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD3-211ENST00000561438 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa11.25□□□□□ -0.61
TMOD3-211ENST00000561438 POTEFA5A3E0 1075 aa11.25□□□□□ -0.61
TMOD3-211ENST00000561438 C2orf72A6NCS6 295 aa11.25□□□□□ -0.61
TMOD3-211ENST00000561438 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TMOD3-211ENST00000561438 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TMOD3-211ENST00000561438 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TMOD3-211ENST00000561438 ANP32CO43423 234 aa11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms