RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561293.5

MEIS3-212, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,918 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-212ENST00000561293 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.32■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.32■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.31■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 PHACTR3Q96KR7 559 aa28.31■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28.31■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 LRRC37A3O60309 1634 aa28.3■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 KDRP35968 1356 aa28.3■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.3■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 EXOC5O00471 708 aa28.3■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.3■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.29■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.29■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 PDE3BQ13370 1112 aa28.28■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.28■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.28■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 TNS2Q63HR2 1409 aa28.24■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 CYP27B1O15528 508 aa28.24■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 FCHSD2O94868 740 aa28.2■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.2■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.2■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.2■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.19■■■□□ 2.1
MEIS3-212ENST00000561293 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
MEIS3-212ENST00000561293 SPG7Q9UQ90 795 aa28.18■■■□□ 2.1
MEIS3-212ENST00000561293 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
MEIS3-212ENST00000561293 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.16■■■□□ 2.1
MEIS3-212ENST00000561293 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.16■■■□□ 2.1
MEIS3-212ENST00000561293 NEUROD2Q15784 382 aa28.16■■■□□ 2.1
MEIS3-212ENST00000561293 PHKG2P15735 406 aa28.16■■■□□ 2.1
MEIS3-212ENST00000561293 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.15■■■□□ 2.1
MEIS3-212ENST00000561293 KCNQ2O43526 872 aa28.14■■■□□ 2.1
MEIS3-212ENST00000561293 CCER2I3L3R5 266 aa28.14■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.13■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.12■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 DCTN1Q14203 1278 aa28.12■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa28.11■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 TRIM37O94972 964 aa28.11■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.11■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.1■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.1■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 LGR6Q9HBX8 967 aa28.1■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 APAF1O14727 1248 aa28.08■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 RUNDC1Q96C34 613 aa28.08■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 MCM10Q7L590 875 aa28.07■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 NEFMP07197 916 aa28.06■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.06■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.05■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.05■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 RIPK4P57078 832 aa28.03■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 NFE2L2Q16236 605 aa28.03■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 MAP3K5Q99683 1374 aa28.02■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 IL17REQ8NFR9 667 aa28.02■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.02■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 GNAT3A8MTJ3 354 aa28.02■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.01■■■□□ 2.07
MEIS3-212ENST00000561293 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
MEIS3-212ENST00000561293 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
MEIS3-212ENST00000561293 RNMTO43148 476 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
MEIS3-212ENST00000561293 DCAF5Q96JK2 942 aa27.98■■■□□ 2.07
MEIS3-212ENST00000561293 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa27.98■■■□□ 2.07
MEIS3-212ENST00000561293 PIGBQ92521 554 aa27.96■■■□□ 2.07
MEIS3-212ENST00000561293 DEFB132Q7Z7B7 95 aa27.96■■■□□ 2.07
MEIS3-212ENST00000561293 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.95■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.94■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 CABP4P57796 275 aa27.94■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.94■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.94■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 SBF2Q86WG5 1849 aa27.94■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 KCNQ4P56696 695 aa27.93■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 APBA3O96018 575 aa27.92■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 TMOD3Q9NYL9 352 aa27.92■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 SLC39A6Q13433 755 aa27.92■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 ASAP1Q9ULH1 1129 aa27.91■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 BCL9O00512 1426 aa27.91■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 SLC52A2Q9HAB3 445 aa27.9■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 TEFQ10587 303 aa27.88■■■□□ 2.05
MEIS3-212ENST00000561293 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa27.88■■■□□ 2.05
MEIS3-212ENST00000561293 NHSQ6T4R5 1651 aa27.88■■■□□ 2.05
MEIS3-212ENST00000561293 ITGB4P16144 1822 aa27.87■■■□□ 2.05
MEIS3-212ENST00000561293 ERVV-2B6SEH9 535 aa27.87■■■□□ 2.05
MEIS3-212ENST00000561293 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67 ms