RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561293.5

MEIS3-212, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,918 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-212ENST00000561293 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.32■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.32■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.31■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 PHACTR3Q96KR7 559 aa28.31■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28.31■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 LRRC37A3O60309 1634 aa28.3■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 KDRP35968 1356 aa28.3■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.3■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 EXOC5O00471 708 aa28.3■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.3■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.29■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.29■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 PDE3BQ13370 1112 aa28.28■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.28■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.28■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
MEIS3-212ENST00000561293 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 TNS2Q63HR2 1409 aa28.24■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 CYP27B1O15528 508 aa28.24■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 FCHSD2O94868 740 aa28.2■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.2■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.2■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.2■■■□□ 2.11
MEIS3-212ENST00000561293 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.19■■■□□ 2.1
MEIS3-212ENST00000561293 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
MEIS3-212ENST00000561293 SPG7Q9UQ90 795 aa28.18■■■□□ 2.1
MEIS3-212ENST00000561293 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
MEIS3-212ENST00000561293 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.16■■■□□ 2.1
MEIS3-212ENST00000561293 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.16■■■□□ 2.1
MEIS3-212ENST00000561293 NEUROD2Q15784 382 aa28.16■■■□□ 2.1
MEIS3-212ENST00000561293 PHKG2P15735 406 aa28.16■■■□□ 2.1
MEIS3-212ENST00000561293 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.15■■■□□ 2.1
MEIS3-212ENST00000561293 KCNQ2O43526 872 aa28.14■■■□□ 2.1
MEIS3-212ENST00000561293 CCER2I3L3R5 266 aa28.14■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.13■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.12■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 DCTN1Q14203 1278 aa28.12■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa28.11■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 TRIM37O94972 964 aa28.11■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.11■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.1■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.1■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 LGR6Q9HBX8 967 aa28.1■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 APAF1O14727 1248 aa28.08■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 RUNDC1Q96C34 613 aa28.08■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
MEIS3-212ENST00000561293 MCM10Q7L590 875 aa28.07■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 NEFMP07197 916 aa28.06■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.06■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.05■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.05■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 RIPK4P57078 832 aa28.03■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 NFE2L2Q16236 605 aa28.03■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 MAP3K5Q99683 1374 aa28.02■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 IL17REQ8NFR9 667 aa28.02■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.02■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 GNAT3A8MTJ3 354 aa28.02■■■□□ 2.08
MEIS3-212ENST00000561293 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.01■■■□□ 2.07
MEIS3-212ENST00000561293 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
MEIS3-212ENST00000561293 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
MEIS3-212ENST00000561293 RNMTO43148 476 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
MEIS3-212ENST00000561293 DCAF5Q96JK2 942 aa27.98■■■□□ 2.07
MEIS3-212ENST00000561293 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa27.98■■■□□ 2.07
MEIS3-212ENST00000561293 PIGBQ92521 554 aa27.96■■■□□ 2.07
MEIS3-212ENST00000561293 DEFB132Q7Z7B7 95 aa27.96■■■□□ 2.07
MEIS3-212ENST00000561293 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.95■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.94■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 CABP4P57796 275 aa27.94■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.94■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.94■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 SBF2Q86WG5 1849 aa27.94■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 KCNQ4P56696 695 aa27.93■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 APBA3O96018 575 aa27.92■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 TMOD3Q9NYL9 352 aa27.92■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 SLC39A6Q13433 755 aa27.92■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 ASAP1Q9ULH1 1129 aa27.91■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 BCL9O00512 1426 aa27.91■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 SLC52A2Q9HAB3 445 aa27.9■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
MEIS3-212ENST00000561293 TEFQ10587 303 aa27.88■■■□□ 2.05
MEIS3-212ENST00000561293 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa27.88■■■□□ 2.05
MEIS3-212ENST00000561293 NHSQ6T4R5 1651 aa27.88■■■□□ 2.05
MEIS3-212ENST00000561293 ITGB4P16144 1822 aa27.87■■■□□ 2.05
MEIS3-212ENST00000561293 ERVV-2B6SEH9 535 aa27.87■■■□□ 2.05
MEIS3-212ENST00000561293 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms