RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560622.5

USP3-AS1-207, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 508 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-207ENST00000560622 USP47Q96K76 1375 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-207ENST00000560622 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-207ENST00000560622 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
USP3-AS1-207ENST00000560622 SYT17Q9BSW7 474 aa22.79■■□□□ 1.24
USP3-AS1-207ENST00000560622 ITGB4P16144 1822 aa22.79■■□□□ 1.24
USP3-AS1-207ENST00000560622 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
USP3-AS1-207ENST00000560622 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.77■■□□□ 1.24
USP3-AS1-207ENST00000560622 NBPF4Q96M43 638 aa22.77■■□□□ 1.24
USP3-AS1-207ENST00000560622 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.77■■□□□ 1.23
USP3-AS1-207ENST00000560622 MAP3K5Q99683 1374 aa22.76■■□□□ 1.23
USP3-AS1-207ENST00000560622 KCNQ4P56696 695 aa22.76■■□□□ 1.23
USP3-AS1-207ENST00000560622 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.76■■□□□ 1.23
USP3-AS1-207ENST00000560622 C5P01031 1676 aa22.75■■□□□ 1.23
USP3-AS1-207ENST00000560622 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.75■■□□□ 1.23
USP3-AS1-207ENST00000560622 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
USP3-AS1-207ENST00000560622 AMPHP49418 695 aa22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-207ENST00000560622 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
USP3-AS1-207ENST00000560622 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-207ENST00000560622 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.73■■□□□ 1.23
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
USP3-AS1-207ENST00000560622 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.72■■□□□ 1.23
USP3-AS1-207ENST00000560622 SLC24A1O60721 1099 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-207ENST00000560622 ARXQ96QS3 562 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-207ENST00000560622 INSRP06213 1382 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-207ENST00000560622 NCAPD2Q15021 1401 aa22.71■■□□□ 1.23
USP3-AS1-207ENST00000560622 TMF1P82094 1093 aa22.7■■□□□ 1.22
USP3-AS1-207ENST00000560622 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.7■■□□□ 1.22
USP3-AS1-207ENST00000560622 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-207ENST00000560622 FLT4P35916 1363 aa22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-207ENST00000560622 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-207ENST00000560622 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
USP3-AS1-207ENST00000560622 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-207ENST00000560622 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-207ENST00000560622 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.65■■□□□ 1.22
USP3-AS1-207ENST00000560622 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.64■■□□□ 1.22
USP3-AS1-207ENST00000560622 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.64■■□□□ 1.21
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
USP3-AS1-207ENST00000560622 CYP27B1O15528 508 aa22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-207ENST00000560622 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-207ENST00000560622 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
USP3-AS1-207ENST00000560622 C4BP0C0L5 1744 aa22.62■■□□□ 1.21
USP3-AS1-207ENST00000560622 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
USP3-AS1-207ENST00000560622 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.6■■□□□ 1.21
USP3-AS1-207ENST00000560622 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
USP3-AS1-207ENST00000560622 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.59■■□□□ 1.21
USP3-AS1-207ENST00000560622 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.59■■□□□ 1.21
USP3-AS1-207ENST00000560622 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
USP3-AS1-207ENST00000560622 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.57■■□□□ 1.2
USP3-AS1-207ENST00000560622 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.57■■□□□ 1.2
USP3-AS1-207ENST00000560622 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.57■■□□□ 1.2
USP3-AS1-207ENST00000560622 CDCA8Q53HL2 280 aa22.56■■□□□ 1.2
USP3-AS1-207ENST00000560622 PALLDQ8WX93 1383 aa22.55■■□□□ 1.2
USP3-AS1-207ENST00000560622 CEP350Q5VT06 3117 aa22.54■■□□□ 1.2
USP3-AS1-207ENST00000560622 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.54■■□□□ 1.2
USP3-AS1-207ENST00000560622 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
USP3-AS1-207ENST00000560622 POLD1P28340 1107 aa22.52■■□□□ 1.2
USP3-AS1-207ENST00000560622 EYA1Q99502 592 aa22.51■■□□□ 1.19
USP3-AS1-207ENST00000560622 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
USP3-AS1-207ENST00000560622 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.5■■□□□ 1.19
USP3-AS1-207ENST00000560622 PIGBQ92521 554 aa22.5■■□□□ 1.19
USP3-AS1-207ENST00000560622 POLKQ9UBT6 870 aa22.5■■□□□ 1.19
USP3-AS1-207ENST00000560622 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.5■■□□□ 1.19
USP3-AS1-207ENST00000560622 MSL1Q68DK7 614 aa22.49■■□□□ 1.19
USP3-AS1-207ENST00000560622 GPR162Q16538 588 aa22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-207ENST00000560622 SMIM5Q71RC9 77 aa22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-207ENST00000560622 KLHL34Q8N239 644 aa22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-207ENST00000560622 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-207ENST00000560622 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-207ENST00000560622 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.45■■□□□ 1.18
USP3-AS1-207ENST00000560622 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
USP3-AS1-207ENST00000560622 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-207ENST00000560622 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-207ENST00000560622 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-207ENST00000560622 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.43■■□□□ 1.18
USP3-AS1-207ENST00000560622 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
USP3-AS1-207ENST00000560622 MSH5O43196 834 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-207ENST00000560622 PHKG2P15735 406 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-207ENST00000560622 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-207ENST00000560622 KDRP35968 1356 aa22.41■■□□□ 1.18
USP3-AS1-207ENST00000560622 ITPK1Q13572 414 aa22.41■■□□□ 1.18
USP3-AS1-207ENST00000560622 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
USP3-AS1-207ENST00000560622 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.41■■□□□ 1.18
USP3-AS1-207ENST00000560622 SPG7Q9UQ90 795 aa22.41■■□□□ 1.18
USP3-AS1-207ENST00000560622 C4AP0C0L4 1744 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-207ENST00000560622 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.39■■□□□ 1.18
USP3-AS1-207ENST00000560622 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.39■■□□□ 1.18
USP3-AS1-207ENST00000560622 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-207ENST00000560622 SIK1P57059 783 aa22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-207ENST00000560622 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-207ENST00000560622 C1QTNF8P60827 252 aa22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-207ENST00000560622 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-207ENST00000560622 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-207ENST00000560622 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
USP3-AS1-207ENST00000560622 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
USP3-AS1-207ENST00000560622 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
USP3-AS1-207ENST00000560622 ATG3Q9NT62 314 aa22.37■■□□□ 1.17
USP3-AS1-207ENST00000560622 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.37■■□□□ 1.17
USP3-AS1-207ENST00000560622 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
USP3-AS1-207ENST00000560622 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.37■■□□□ 1.17
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