RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560163.1

RABGGTA-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-214ENST00000560163 NEUROD1Q13562 356 aa28.16■■■□□ 2.1
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RABGGTA-214ENST00000560163 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.14■■■□□ 2.1
RABGGTA-214ENST00000560163 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP28.13■■■□□ 2.09
RABGGTA-214ENST00000560163 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
RABGGTA-214ENST00000560163 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
RABGGTA-214ENST00000560163 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.13■■■□□ 2.09
RABGGTA-214ENST00000560163 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
RABGGTA-214ENST00000560163 IFFO2Q5TF58 517 aa28.1■■■□□ 2.09
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RABGGTA-214ENST00000560163 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.1■■■□□ 2.09
RABGGTA-214ENST00000560163 GRIN3BO60391 1043 aa28.09■■■□□ 2.09
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RABGGTA-214ENST00000560163 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
RABGGTA-214ENST00000560163 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.08■■■□□ 2.09
RABGGTA-214ENST00000560163 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.08■■■□□ 2.09
RABGGTA-214ENST00000560163 MEGF6O75095 1541 aa28.07■■■□□ 2.08
RABGGTA-214ENST00000560163 FBLN1P23142 703 aa28.06■■■□□ 2.08
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RABGGTA-214ENST00000560163 USP47Q96K76 1375 aa28.01■■■□□ 2.07
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RABGGTA-214ENST00000560163 AMPHP49418 695 aa28■■■□□ 2.07
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RABGGTA-214ENST00000560163 NBPF4Q96M43 638 aa28■■■□□ 2.07
RABGGTA-214ENST00000560163 MSL1Q68DK7 614 aa27.98■■■□□ 2.07
RABGGTA-214ENST00000560163 CD2APQ9Y5K6 639 aa27.98■■■□□ 2.07
RABGGTA-214ENST00000560163 ATP10DQ9P241 1426 aa27.98■■■□□ 2.07
RABGGTA-214ENST00000560163 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.97■■■□□ 2.07
RABGGTA-214ENST00000560163 TESK2Q96S53 571 aa27.97■■■□□ 2.07
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RABGGTA-214ENST00000560163 RTL1A6NKG5 1358 aa27.95■■■□□ 2.06
RABGGTA-214ENST00000560163 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.93■■■□□ 2.06
RABGGTA-214ENST00000560163 ADCY9O60503 1353 aa27.93■■■□□ 2.06
RABGGTA-214ENST00000560163 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.92■■■□□ 2.06
RABGGTA-214ENST00000560163 FLAD1Q8NFF5 587 aa27.92■■■□□ 2.06
RABGGTA-214ENST00000560163 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
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RABGGTA-214ENST00000560163 FYB1O15117 783 aa27.89■■■□□ 2.06
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RABGGTA-214ENST00000560163 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
RABGGTA-214ENST00000560163 PALLDQ8WX93 1383 aa27.88■■■□□ 2.05
RABGGTA-214ENST00000560163 AMIGO3Q86WK7 504 aa27.88■■■□□ 2.05
RABGGTA-214ENST00000560163 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.87■■■□□ 2.05
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RABGGTA-214ENST00000560163 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa27.86■■■□□ 2.05
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RABGGTA-214ENST00000560163 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.85■■■□□ 2.05
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RABGGTA-214ENST00000560163 CYP27B1O15528 508 aa27.84■■■□□ 2.05
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RABGGTA-214ENST00000560163 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.84■■■□□ 2.05
RABGGTA-214ENST00000560163 INSRP06213 1382 aa27.84■■■□□ 2.05
RABGGTA-214ENST00000560163 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
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RABGGTA-214ENST00000560163 UBR3Q6ZT12 1888 aa27.82■■■□□ 2.04
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RABGGTA-214ENST00000560163 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
RABGGTA-214ENST00000560163 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.78■■■□□ 2.04
RABGGTA-214ENST00000560163 TONSLQ96HA7 1378 aa27.78■■■□□ 2.04
RABGGTA-214ENST00000560163 AK7Q96M32 723 aa27.78■■■□□ 2.04
RABGGTA-214ENST00000560163 FLT4P35916 1363 aa27.77■■■□□ 2.04
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RABGGTA-214ENST00000560163 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
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RABGGTA-214ENST00000560163 PKD1L3Q7Z443 1732 aa27.76■■■□□ 2.03
RABGGTA-214ENST00000560163 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
RABGGTA-214ENST00000560163 KIF3CO14782 793 aa27.74■■■□□ 2.03
RABGGTA-214ENST00000560163 PHF14O94880 888 aa27.74■■■□□ 2.03
RABGGTA-214ENST00000560163 SSFA2P28290 1259 aa27.74■■■□□ 2.03
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RABGGTA-214ENST00000560163 NSD3Q9BZ95 1437 aa27.74■■■□□ 2.03
RABGGTA-214ENST00000560163 WWC3Q9ULE0 1092 aa27.73■■■□□ 2.03
RABGGTA-214ENST00000560163 LINC00116Q8NCU8 138 aa27.72■■■□□ 2.03
RABGGTA-214ENST00000560163 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.7■■■□□ 2.02
RABGGTA-214ENST00000560163 SIK1P57059 783 aa27.7■■■□□ 2.02
RABGGTA-214ENST00000560163 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
RABGGTA-214ENST00000560163 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.69■■■□□ 2.02
RABGGTA-214ENST00000560163 TMF1P82094 1093 aa27.67■■■□□ 2.02
RABGGTA-214ENST00000560163 ITPK1Q13572 414 aa27.67■■■□□ 2.02
RABGGTA-214ENST00000560163 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27.67■■■□□ 2.02
RABGGTA-214ENST00000560163 ASAP1Q9ULH1 1129 aa27.65■■■□□ 2.02
RABGGTA-214ENST00000560163 SPG7Q9UQ90 795 aa27.65■■■□□ 2.02
RABGGTA-214ENST00000560163 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.64■■■□□ 2.02
RABGGTA-214ENST00000560163 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa27.64■■■□□ 2.02
RABGGTA-214ENST00000560163 CARD14Q9BXL6 1004 aa27.64■■■□□ 2.02
RABGGTA-214ENST00000560163 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.022e-8■□□□□ 10.7
RABGGTA-214ENST00000560163 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.63■■■□□ 2.01
RABGGTA-214ENST00000560163 GNPATO15228 680 aa27.62■■■□□ 2.01
RABGGTA-214ENST00000560163 MMP10P09238 476 aa27.61■■■□□ 2.01
RABGGTA-214ENST00000560163 ATP6V1AP38606 617 aa27.61■■■□□ 2.01
RABGGTA-214ENST00000560163 TMOD3Q9NYL9 352 aa27.61■■■□□ 2.01
RABGGTA-214ENST00000560163 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa27.61■■■□□ 2.01
RABGGTA-214ENST00000560163 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa27.6■■■□□ 2.01
RABGGTA-214ENST00000560163 EYA1Q99502 592 aa27.6■■■□□ 2.01
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