RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559365.5

PSMA4-212, Transcript of proteasome subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSMA4, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4-212ENST00000559365 DOT1LQ8TEK3 1739 aa37.43■■■■□ 3.58
PSMA4-212ENST00000559365 USHBP1Q8N6Y0 703 aa37.42■■■■□ 3.58
PSMA4-212ENST00000559365 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa37.4■■■■□ 3.58
PSMA4-212ENST00000559365 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
PSMA4-212ENST00000559365 CGNL1Q0VF96 1302 aa37.38■■■■□ 3.58
PSMA4-212ENST00000559365 PAPPAQ13219 1627 aa37.38■■■■□ 3.57
PSMA4-212ENST00000559365 SPON1Q9HCB6 807 aa37.37■■■■□ 3.57
PSMA4-212ENST00000559365 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
PSMA4-212ENST00000559365 STK32BQ9NY57 414 aa37.36■■■■□ 3.57
PSMA4-212ENST00000559365 SLC15A2Q16348 729 aa37.34■■■■□ 3.57
PSMA4-212ENST00000559365 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa37.32■■■■□ 3.56
PSMA4-212ENST00000559365 TATP17735 454 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
PSMA4-212ENST00000559365 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
PSMA4-212ENST00000559365 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
PSMA4-212ENST00000559365 NSD2O96028 1365 aa37.28■■■■□ 3.56
PSMA4-212ENST00000559365 LY75O60449 1722 aa37.27■■■■□ 3.56
PSMA4-212ENST00000559365 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
PSMA4-212ENST00000559365 LRRC4BQ9NT99 713 aa37.27■■■■□ 3.56
PSMA4-212ENST00000559365 PKD1L3Q7Z443 1732 aa37.25■■■■□ 3.55
PSMA4-212ENST00000559365 PANK3Q9H999 370 aa37.25■■■■□ 3.55
PSMA4-212ENST00000559365 WASHC2AQ641Q2 1341 aa37.25■■■■□ 3.55
PSMA4-212ENST00000559365 NCAPD2Q15021 1401 aa37.25■■■■□ 3.55
PSMA4-212ENST00000559365 ZBTB7AO95365 584 aa37.24■■■■□ 3.55
PSMA4-212ENST00000559365 POLKQ9UBT6 870 aa37.24■■■■□ 3.55
PSMA4-212ENST00000559365 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
PSMA4-212ENST00000559365 ZNF827Q17R98 1081 aa37.2■■■■□ 3.55
PSMA4-212ENST00000559365 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa37.19■■■■□ 3.54
PSMA4-212ENST00000559365 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa37.19■■■■□ 3.54
PSMA4-212ENST00000559365 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
PSMA4-212ENST00000559365 QSER1Q2KHR3 1735 aa37.19■■■■□ 3.54
PSMA4-212ENST00000559365 SLC27A3Q5K4L6 730 aa37.18■■■■□ 3.54
PSMA4-212ENST00000559365 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa37.17■■■■□ 3.54
PSMA4-212ENST00000559365 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa37.17■■■■□ 3.54
PSMA4-212ENST00000559365 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
PSMA4-212ENST00000559365 ITGB4P16144 1822 aa37.17■■■■□ 3.54
PSMA4-212ENST00000559365 PTGER2P43116 358 aa37.16■■■■□ 3.54
PSMA4-212ENST00000559365 CYP27B1O15528 508 aa37.15■■■■□ 3.54
PSMA4-212ENST00000559365 EYA1Q99502 592 aa37.15■■■■□ 3.54
PSMA4-212ENST00000559365 AKT1S1Q96B36 256 aa37.14■■■■□ 3.54
PSMA4-212ENST00000559365 KCNQ4P56696 695 aa37.13■■■■□ 3.53
PSMA4-212ENST00000559365 MTFR1LQ9H019 292 aa37.12■■■■□ 3.53
PSMA4-212ENST00000559365 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
PSMA4-212ENST00000559365 SGIP1Q9BQI5 828 aa37.06■■■■□ 3.52
PSMA4-212ENST00000559365 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
PSMA4-212ENST00000559365 TAF1LQ8IZX4 1826 aa37.04■■■■□ 3.52
PSMA4-212ENST00000559365 SPG7Q9UQ90 795 aa37.04■■■■□ 3.52
PSMA4-212ENST00000559365 KIF7Q2M1P5 1343 aa37.04■■■■□ 3.52
PSMA4-212ENST00000559365 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa37.03■■■■□ 3.52
PSMA4-212ENST00000559365 C5P01031 1676 aa37.02■■■■□ 3.52
PSMA4-212ENST00000559365 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa37.02■■■■□ 3.52
PSMA4-212ENST00000559365 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP37.01■■■■□ 3.52
PSMA4-212ENST00000559365 MORC1Q86VD1 984 aa37.01■■■■□ 3.52
PSMA4-212ENST00000559365 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP37.01■■■■□ 3.522e-8■□□□□ 9.8
PSMA4-212ENST00000559365 KNSTRNQ9Y448 316 aa37.01■■■■□ 3.52
PSMA4-212ENST00000559365 COL24A1Q17RW2 1714 aa37.01■■■■□ 3.51
PSMA4-212ENST00000559365 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa36.99■■■■□ 3.51
PSMA4-212ENST00000559365 IGSF1Q8N6C5 1336 aa36.98■■■■□ 3.51
PSMA4-212ENST00000559365 PALLDQ8WX93 1383 aa36.97■■■■□ 3.51
PSMA4-212ENST00000559365 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
PSMA4-212ENST00000559365 SLC16A10Q8TF71 515 aa36.94■■■■□ 3.5
PSMA4-212ENST00000559365 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
PSMA4-212ENST00000559365 PHKG2P15735 406 aa36.93■■■■□ 3.5
PSMA4-212ENST00000559365 PIGBQ92521 554 aa36.93■■■■□ 3.5
PSMA4-212ENST00000559365 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa36.92■■■■□ 3.5
PSMA4-212ENST00000559365 IFNL2Q8IZJ0 200 aa36.92■■■■□ 3.5
PSMA4-212ENST00000559365 ARXQ96QS3 562 aa36.91■■■■□ 3.5
PSMA4-212ENST00000559365 SYT17Q9BSW7 474 aa36.9■■■■□ 3.5
PSMA4-212ENST00000559365 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP36.89■■■■□ 3.5
PSMA4-212ENST00000559365 C4BP0C0L5 1744 aa36.87■■■■□ 3.49
PSMA4-212ENST00000559365 DCAF8L1A6NGE4 600 aa36.86■■■■□ 3.49
PSMA4-212ENST00000559365 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP36.84■■■■□ 3.49
PSMA4-212ENST00000559365 TMOD3Q9NYL9 352 aa36.84■■■■□ 3.49
PSMA4-212ENST00000559365 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
PSMA4-212ENST00000559365 AEBP1Q8IUX7 1158 aa36.83■■■■□ 3.49
PSMA4-212ENST00000559365 UBR3Q6ZT12 1888 aa36.82■■■■□ 3.49
PSMA4-212ENST00000559365 MAP3K5Q99683 1374 aa36.82■■■■□ 3.49
PSMA4-212ENST00000559365 POLD1P28340 1107 aa36.8■■■■□ 3.48
PSMA4-212ENST00000559365 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
PSMA4-212ENST00000559365 MSH5O43196 834 aa36.79■■■■□ 3.48
PSMA4-212ENST00000559365 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
PSMA4-212ENST00000559365 IL13P35225 146 aa36.79■■■■□ 3.48
PSMA4-212ENST00000559365 ASAP1Q9ULH1 1129 aa36.79■■■■□ 3.48
PSMA4-212ENST00000559365 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa36.76■■■■□ 3.48
PSMA4-212ENST00000559365 SIK1P57059 783 aa36.76■■■■□ 3.48
PSMA4-212ENST00000559365 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
PSMA4-212ENST00000559365 KDRP35968 1356 aa36.76■■■■□ 3.47
PSMA4-212ENST00000559365 YY1P25490 414 aa36.75■■■■□ 3.47
PSMA4-212ENST00000559365 AMOTQ4VCS5 1084 aa36.75■■■■□ 3.47
PSMA4-212ENST00000559365 SULT6B1Q6IMI4 303 aa36.75■■■■□ 3.47
PSMA4-212ENST00000559365 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
PSMA4-212ENST00000559365 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
PSMA4-212ENST00000559365 ATG3Q9NT62 314 aa36.74■■■■□ 3.47
PSMA4-212ENST00000559365 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
PSMA4-212ENST00000559365 MTHFSP49914 203 aa36.73■■■■□ 3.47
PSMA4-212ENST00000559365 DCAF5Q96JK2 942 aa36.73■■■■□ 3.47
PSMA4-212ENST00000559365 ERVV-2B6SEH9 535 aa36.72■■■■□ 3.47
PSMA4-212ENST00000559365 AMIGO3Q86WK7 504 aa36.72■■■■□ 3.47
PSMA4-212ENST00000559365 FLAD1Q8NFF5 587 aa36.72■■■■□ 3.47
PSMA4-212ENST00000559365 AK7Q96M32 723 aa36.72■■■■□ 3.47
PSMA4-212ENST00000559365 LINC00116Q8NCU8 138 aa36.71■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms