RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558086.1

TMC3-AS1-201, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMC3-AS1, Length 658 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
TMC3-AS1-201ENST00000558086 COG3Q96JB2 828 aa19.01■□□□□ 0.63
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CGNL1Q0VF96 1302 aa19■□□□□ 0.63
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa18.98■□□□□ 0.63
TMC3-AS1-201ENST00000558086 POLD1P28340 1107 aa18.98■□□□□ 0.63
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 AMPHP49418 695 aa18.96■□□□□ 0.63
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa18.96■□□□□ 0.63
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 FBLN1P23142 703 aa18.95■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-201ENST00000558086 C1QTNF8P60827 252 aa18.95■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NBPF6Q5VWK0 638 aa18.95■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NBPF4Q96M43 638 aa18.95■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FYB1O15117 783 aa18.94■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KCNQ4P56696 695 aa18.94■□□□□ 0.62
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 TAF1LQ8IZX4 1826 aa18.93■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NCAPD2Q15021 1401 aa18.93■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GPR162Q16538 588 aa18.93■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KIF20BQ96Q89 1820 aa18.93■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-201ENST00000558086 USP47Q96K76 1375 aa18.93■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NLGN2Q8NFZ4 835 aa18.92■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PKD1L3Q7Z443 1732 aa18.91■□□□□ 0.62
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa18.91■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-201ENST00000558086 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa18.9■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa18.9■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa18.9■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FLT4P35916 1363 aa18.9■□□□□ 0.62
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa18.88■□□□□ 0.61
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GGNBP2Q9H3C7 697 aa18.88■□□□□ 0.61
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
TMC3-AS1-201ENST00000558086 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP18.87■□□□□ 0.61
TMC3-AS1-201ENST00000558086 USHBP1Q8N6Y0 703 aa18.87■□□□□ 0.61
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PALLDQ8WX93 1383 aa18.87■□□□□ 0.61
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ITGB4P16144 1822 aa18.86■□□□□ 0.61
TMC3-AS1-201ENST00000558086 C4BP0C0L5 1744 aa18.86■□□□□ 0.61
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.86■□□□□ 0.61
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GRIN3BO60391 1043 aa18.86■□□□□ 0.61
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TATP17735 454 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TMF1P82094 1093 aa18.86■□□□□ 0.61
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FLAD1Q8NFF5 587 aa18.86■□□□□ 0.61
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 KLHL34Q8N239 644 aa18.85■□□□□ 0.61
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CD2APQ9Y5K6 639 aa18.85■□□□□ 0.61
TMC3-AS1-201ENST00000558086 UBR3Q6ZT12 1888 aa18.85■□□□□ 0.61
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ADCY9O60503 1353 aa18.82■□□□□ 0.6
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NSD3Q9BZ95 1437 aa18.82■□□□□ 0.6
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa18.81■□□□□ 0.6
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CDCA8Q53HL2 280 aa18.81■□□□□ 0.6
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CARD14Q9BXL6 1004 aa18.8■□□□□ 0.6
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MSL1Q68DK7 614 aa18.79■□□□□ 0.6
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ATP10DQ9P241 1426 aa18.78■□□□□ 0.6
TMC3-AS1-201ENST00000558086 AMIGO3Q86WK7 504 aa18.78■□□□□ 0.6
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP18.78■□□□□ 0.6
TMC3-AS1-201ENST00000558086 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa18.78■□□□□ 0.6
TMC3-AS1-201ENST00000558086 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.77■□□□□ 0.6
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MSH5O43196 834 aa18.77■□□□□ 0.6
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa18.77■□□□□ 0.6
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PIGBQ92521 554 aa18.77■□□□□ 0.6
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SSFA2P28290 1259 aa18.75■□□□□ 0.59
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZNF831Q5JPB2 1677 aa18.75■□□□□ 0.59
TMC3-AS1-201ENST00000558086 AK7Q96M32 723 aa18.74■□□□□ 0.59
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KIF13BQ9NQT8 1826 aa18.73■□□□□ 0.59
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SPG7Q9UQ90 795 aa18.73■□□□□ 0.59
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa18.72■□□□□ 0.59
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SIK1P57059 783 aa18.72■□□□□ 0.59
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LINC00116Q8NCU8 138 aa18.72■□□□□ 0.59
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa18.71■□□□□ 0.59
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KDRP35968 1356 aa18.71■□□□□ 0.59
TMC3-AS1-201ENST00000558086 EYA1Q99502 592 aa18.71■□□□□ 0.59
TMC3-AS1-201ENST00000558086 IGSF1Q8N6C5 1336 aa18.7■□□□□ 0.58
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PHKG2P15735 406 aa18.69■□□□□ 0.58
TMC3-AS1-201ENST00000558086 POLKQ9UBT6 870 aa18.69■□□□□ 0.58
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ITPK1Q13572 414 aa18.68■□□□□ 0.58
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TMOD3Q9NYL9 352 aa18.68■□□□□ 0.58
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.68■□□□□ 0.58
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CEP350Q5VT06 3117 aa18.68■□□□□ 0.58
TMC3-AS1-201ENST00000558086 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
TMC3-AS1-201ENST00000558086 IFNL2Q8IZJ0 200 aa18.67■□□□□ 0.58
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ASAP1Q9ULH1 1129 aa18.67■□□□□ 0.58
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PHF14O94880 888 aa18.66■□□□□ 0.58
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SMIM5Q71RC9 77 aa18.66■□□□□ 0.58
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