RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557694.1

LGMN-218, Transcript of legumain, humanhuman

TSL 2

Gene LGMN, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMN-218ENST00000557694 RTL1A6NKG5 1358 aa21.49■■□□□ 1.03
LGMN-218ENST00000557694 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LGMN-218ENST00000557694 SLC15A2Q16348 729 aa21.49■■□□□ 1.03
LGMN-218ENST00000557694 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
LGMN-218ENST00000557694 INSRP06213 1382 aa21.48■■□□□ 1.03
LGMN-218ENST00000557694 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.47■■□□□ 1.03
LGMN-218ENST00000557694 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
LGMN-218ENST00000557694 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
LGMN-218ENST00000557694 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.47■■□□□ 1.03
LGMN-218ENST00000557694 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.46■■□□□ 1.03
LGMN-218ENST00000557694 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
LGMN-218ENST00000557694 SLC24A1O60721 1099 aa21.46■■□□□ 1.03
LGMN-218ENST00000557694 SPON1Q9HCB6 807 aa21.46■■□□□ 1.03
LGMN-218ENST00000557694 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.45■■□□□ 1.02
LGMN-218ENST00000557694 CYP27B1O15528 508 aa21.44■■□□□ 1.02
LGMN-218ENST00000557694 POLKQ9UBT6 870 aa21.44■■□□□ 1.02
LGMN-218ENST00000557694 FLT4P35916 1363 aa21.44■■□□□ 1.02
LGMN-218ENST00000557694 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
LGMN-218ENST00000557694 CDCA8Q53HL2 280 aa21.43■■□□□ 1.02
LGMN-218ENST00000557694 NCAPD2Q15021 1401 aa21.43■■□□□ 1.02
LGMN-218ENST00000557694 LY75O60449 1722 aa21.43■■□□□ 1.02
LGMN-218ENST00000557694 AKT1S1Q96B36 256 aa21.42■■□□□ 1.02
LGMN-218ENST00000557694 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
LGMN-218ENST00000557694 STK32BQ9NY57 414 aa21.42■■□□□ 1.02
LGMN-218ENST00000557694 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
LGMN-218ENST00000557694 PANK3Q9H999 370 aa21.41■■□□□ 1.02
LGMN-218ENST00000557694 EYA1Q99502 592 aa21.4■■□□□ 1.02
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LGMN-218ENST00000557694 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.35■■□□□ 1.01
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LGMN-218ENST00000557694 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.31■■□□□ 1
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LGMN-218ENST00000557694 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.29■■□□□ 1
LGMN-218ENST00000557694 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.29■■□□□ 1
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LGMN-218ENST00000557694 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
LGMN-218ENST00000557694 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.28■■□□□ 1
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LGMN-218ENST00000557694 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.23■□□□□ 0.99
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LGMN-218ENST00000557694 ITPK1Q13572 414 aa21.21■□□□□ 0.99
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LGMN-218ENST00000557694 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.14■□□□□ 0.97
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LGMN-218ENST00000557694 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
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