RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557569.1

CKB-217, Transcript of creatine kinase B, humanhuman

TSL 2

Gene CKB, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKB-217ENST00000557569 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.56
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CKB-217ENST00000557569 HOXC9P31274 260 aa37.24■■■■□ 3.55
CKB-217ENST00000557569 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
CKB-217ENST00000557569 MEGF6O75095 1541 aa37.22■■■■□ 3.55
CKB-217ENST00000557569 DOT1LQ8TEK3 1739 aa37.22■■■■□ 3.55
CKB-217ENST00000557569 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
CKB-217ENST00000557569 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
CKB-217ENST00000557569 TESK2Q96S53 571 aa37.19■■■■□ 3.54
CKB-217ENST00000557569 LY75O60449 1722 aa37.19■■■■□ 3.54
CKB-217ENST00000557569 SHANK3Q9BYB0 1731 aa37.19■■■■□ 3.54
CKB-217ENST00000557569 COG3Q96JB2 828 aa37.18■■■■□ 3.54
CKB-217ENST00000557569 AMPHP49418 695 aa37.17■■■■□ 3.54
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CKB-217ENST00000557569 RGPD2P0DJD1 1756 aa37.14■■■■□ 3.54
CKB-217ENST00000557569 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP37.13■■■■□ 3.535e-10■■□□□ 11.6
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CKB-217ENST00000557569 NBPF4Q96M43 638 aa37.11■■■■□ 3.53
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CKB-217ENST00000557569 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa37.09■■■■□ 3.53
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CKB-217ENST00000557569 USP47Q96K76 1375 aa37.06■■■■□ 3.52
CKB-217ENST00000557569 MSH5O43196 834 aa37.06■■■■□ 3.52
CKB-217ENST00000557569 MSL1Q68DK7 614 aa37.06■■■■□ 3.52
CKB-217ENST00000557569 TONSLQ96HA7 1378 aa37.05■■■■□ 3.52
CKB-217ENST00000557569 CEP350Q5VT06 3117 aa37.01■■■■□ 3.52
CKB-217ENST00000557569 FYB1O15117 783 aa37■■■■□ 3.51
CKB-217ENST00000557569 GRIN3BO60391 1043 aa37■■■■□ 3.51
CKB-217ENST00000557569 GGNBP2Q9H3C7 697 aa37■■■■□ 3.51
CKB-217ENST00000557569 CGNL1Q0VF96 1302 aa37■■■■□ 3.51
CKB-217ENST00000557569 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa36.98■■■■□ 3.51
CKB-217ENST00000557569 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa36.95■■■■□ 3.51
CKB-217ENST00000557569 TATP17735 454 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
CKB-217ENST00000557569 C5P01031 1676 aa36.93■■■■□ 3.5
CKB-217ENST00000557569 PALLDQ8WX93 1383 aa36.92■■■■□ 3.5
CKB-217ENST00000557569 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
CKB-217ENST00000557569 AMIGO3Q86WK7 504 aa36.91■■■■□ 3.5
CKB-217ENST00000557569 INSRP06213 1382 aa36.91■■■■□ 3.5
CKB-217ENST00000557569 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa36.9■■■■□ 3.5
CKB-217ENST00000557569 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa36.9■■■■□ 3.5
CKB-217ENST00000557569 CD2APQ9Y5K6 639 aa36.9■■■■□ 3.5
CKB-217ENST00000557569 ATP10DQ9P241 1426 aa36.9■■■■□ 3.5
CKB-217ENST00000557569 CYP27B1O15528 508 aa36.89■■■■□ 3.5
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CKB-217ENST00000557569 SLC24A1O60721 1099 aa36.87■■■■□ 3.49
CKB-217ENST00000557569 SMIM5Q71RC9 77 aa36.85■■■■□ 3.49
CKB-217ENST00000557569 FLAD1Q8NFF5 587 aa36.85■■■■□ 3.49
CKB-217ENST00000557569 FLT4P35916 1363 aa36.84■■■■□ 3.49
CKB-217ENST00000557569 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa36.84■■■■□ 3.49
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CKB-217ENST00000557569 C4BP0C0L5 1744 aa36.81■■■■□ 3.48
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CKB-217ENST00000557569 KIF24Q5T7B8 1368 aa36.78■■■■□ 3.48
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CKB-217ENST00000557569 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
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CKB-217ENST00000557569 WWC3Q9ULE0 1092 aa36.74■■■■□ 3.47
CKB-217ENST00000557569 NCAPD2Q15021 1401 aa36.74■■■■□ 3.47
CKB-217ENST00000557569 ITGB4P16144 1822 aa36.73■■■■□ 3.47
CKB-217ENST00000557569 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
CKB-217ENST00000557569 PKD1L3Q7Z443 1732 aa36.73■■■■□ 3.47
CKB-217ENST00000557569 KIF20BQ96Q89 1820 aa36.73■■■■□ 3.47
CKB-217ENST00000557569 IGSF1Q8N6C5 1336 aa36.72■■■■□ 3.47
CKB-217ENST00000557569 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
CKB-217ENST00000557569 LINC00116Q8NCU8 138 aa36.71■■■■□ 3.47
CKB-217ENST00000557569 UBR3Q6ZT12 1888 aa36.71■■■■□ 3.47
CKB-217ENST00000557569 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa36.68■■■■□ 3.46
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CKB-217ENST00000557569 ITPK1Q13572 414 aa36.65■■■■□ 3.46
CKB-217ENST00000557569 NSD3Q9BZ95 1437 aa36.65■■■■□ 3.46
CKB-217ENST00000557569 ASAP1Q9ULH1 1129 aa36.64■■■■□ 3.46
CKB-217ENST00000557569 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
CKB-217ENST00000557569 SPG7Q9UQ90 795 aa36.63■■■■□ 3.45
CKB-217ENST00000557569 HSPA6P17066 643 aa36.62■■■■□ 3.45
CKB-217ENST00000557569 EYA1Q99502 592 aa36.62■■■■□ 3.45
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CKB-217ENST00000557569 TMOD3Q9NYL9 352 aa36.59■■■■□ 3.45
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CKB-217ENST00000557569 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP36.57■■■■□ 3.44
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CKB-217ENST00000557569 KIF3CO14782 793 aa36.54■■■■□ 3.44
CKB-217ENST00000557569 MMP10P09238 476 aa36.53■■■■□ 3.44
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