RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557478.5

NEDD1-212, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD1, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-212ENST00000557478 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.96■■□□□ 1.43
NEDD1-212ENST00000557478 POLKQ9UBT6 870 aa23.96■■□□□ 1.43
NEDD1-212ENST00000557478 NHSQ6T4R5 1651 aa23.95■■□□□ 1.43
NEDD1-212ENST00000557478 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.95■■□□□ 1.42
NEDD1-212ENST00000557478 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.95■■□□□ 1.42
NEDD1-212ENST00000557478 STK32BQ9NY57 414 aa23.95■■□□□ 1.42
NEDD1-212ENST00000557478 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.95■■□□□ 1.42
NEDD1-212ENST00000557478 PROM2Q8N271 834 aa23.93■■□□□ 1.42
NEDD1-212ENST00000557478 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.42
NEDD1-212ENST00000557478 MEGF6O75095 1541 aa23.93■■□□□ 1.42
NEDD1-212ENST00000557478 MORC1Q86VD1 984 aa23.92■■□□□ 1.42
NEDD1-212ENST00000557478 SPON1Q9HCB6 807 aa23.92■■□□□ 1.42
NEDD1-212ENST00000557478 SPG7Q9UQ90 795 aa23.92■■□□□ 1.42
NEDD1-212ENST00000557478 NCAPD2Q15021 1401 aa23.91■■□□□ 1.42
NEDD1-212ENST00000557478 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.9■■□□□ 1.42
NEDD1-212ENST00000557478 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.9■■□□□ 1.42
NEDD1-212ENST00000557478 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
NEDD1-212ENST00000557478 SLC15A2Q16348 729 aa23.89■■□□□ 1.41
NEDD1-212ENST00000557478 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
NEDD1-212ENST00000557478 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.89■■□□□ 1.41
NEDD1-212ENST00000557478 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
NEDD1-212ENST00000557478 EYA1Q99502 592 aa23.86■■□□□ 1.41
NEDD1-212ENST00000557478 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
NEDD1-212ENST00000557478 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
NEDD1-212ENST00000557478 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
NEDD1-212ENST00000557478 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
NEDD1-212ENST00000557478 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
NEDD1-212ENST00000557478 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
NEDD1-212ENST00000557478 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.81■■□□□ 1.4
NEDD1-212ENST00000557478 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.8■■□□□ 1.4
NEDD1-212ENST00000557478 BTAF1O14981 1849 aa23.8■■□□□ 1.4
NEDD1-212ENST00000557478 CYP27B1O15528 508 aa23.8■■□□□ 1.4
NEDD1-212ENST00000557478 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.8■■□□□ 1.4
NEDD1-212ENST00000557478 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
NEDD1-212ENST00000557478 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.79■■□□□ 1.4
NEDD1-212ENST00000557478 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.79■■□□□ 1.4
NEDD1-212ENST00000557478 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
NEDD1-212ENST00000557478 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.78■■□□□ 1.4
NEDD1-212ENST00000557478 MTFR1LQ9H019 292 aa23.78■■□□□ 1.4
NEDD1-212ENST00000557478 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
NEDD1-212ENST00000557478 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.77■■□□□ 1.4
NEDD1-212ENST00000557478 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.76■■□□□ 1.39
NEDD1-212ENST00000557478 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
NEDD1-212ENST00000557478 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
NEDD1-212ENST00000557478 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.76■■□□□ 1.39
NEDD1-212ENST00000557478 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.74■■□□□ 1.39
NEDD1-212ENST00000557478 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.74■■□□□ 1.39
NEDD1-212ENST00000557478 AKT1S1Q96B36 256 aa23.74■■□□□ 1.39
NEDD1-212ENST00000557478 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.73■■□□□ 1.39
NEDD1-212ENST00000557478 PHKG2P15735 406 aa23.73■■□□□ 1.39
NEDD1-212ENST00000557478 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.73■■□□□ 1.39
NEDD1-212ENST00000557478 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.73■■□□□ 1.39
NEDD1-212ENST00000557478 PAPPAQ13219 1627 aa23.72■■□□□ 1.39
NEDD1-212ENST00000557478 ZBTB7AO95365 584 aa23.71■■□□□ 1.39
NEDD1-212ENST00000557478 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.71■■□□□ 1.39
NEDD1-212ENST00000557478 PALLDQ8WX93 1383 aa23.7■■□□□ 1.38
NEDD1-212ENST00000557478 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.7■■□□□ 1.38
NEDD1-212ENST00000557478 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.7■■□□□ 1.38
NEDD1-212ENST00000557478 DCAF5Q96JK2 942 aa23.7■■□□□ 1.38
NEDD1-212ENST00000557478 CASZ1Q86V15 1759 aa23.7■■□□□ 1.38
NEDD1-212ENST00000557478 IL13P35225 146 aa23.69■■□□□ 1.38
NEDD1-212ENST00000557478 MTHFSP49914 203 aa23.69■■□□□ 1.38
NEDD1-212ENST00000557478 KDRP35968 1356 aa23.68■■□□□ 1.38
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF827Q17R98 1081 aa23.68■■□□□ 1.38
NEDD1-212ENST00000557478 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.67■■□□□ 1.38
NEDD1-212ENST00000557478 PIGBQ92521 554 aa23.67■■□□□ 1.38
NEDD1-212ENST00000557478 PTGER2P43116 358 aa23.66■■□□□ 1.38
NEDD1-212ENST00000557478 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
NEDD1-212ENST00000557478 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.66■■□□□ 1.38
NEDD1-212ENST00000557478 LY75O60449 1722 aa23.66■■□□□ 1.38
NEDD1-212ENST00000557478 POLD1P28340 1107 aa23.65■■□□□ 1.38
NEDD1-212ENST00000557478 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
NEDD1-212ENST00000557478 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
NEDD1-212ENST00000557478 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
NEDD1-212ENST00000557478 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.62■■□□□ 1.37
NEDD1-212ENST00000557478 ARXQ96QS3 562 aa23.62■■□□□ 1.37
NEDD1-212ENST00000557478 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.61■■□□□ 1.37
NEDD1-212ENST00000557478 SIK1P57059 783 aa23.61■■□□□ 1.37
NEDD1-212ENST00000557478 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.61■■□□□ 1.37
NEDD1-212ENST00000557478 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.6■■□□□ 1.37
NEDD1-212ENST00000557478 AK7Q96M32 723 aa23.6■■□□□ 1.37
NEDD1-212ENST00000557478 CFAP53Q96M91 514 aa23.6■■□□□ 1.37
NEDD1-212ENST00000557478 KCNQ4P56696 695 aa23.59■■□□□ 1.37
NEDD1-212ENST00000557478 MAP3K5Q99683 1374 aa23.59■■□□□ 1.37
NEDD1-212ENST00000557478 CABP4P57796 275 aa23.58■■□□□ 1.37
NEDD1-212ENST00000557478 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.58■■□□□ 1.37
NEDD1-212ENST00000557478 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.58■■□□□ 1.37
NEDD1-212ENST00000557478 MSH5O43196 834 aa23.56■■□□□ 1.36
NEDD1-212ENST00000557478 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.56■■□□□ 1.36
NEDD1-212ENST00000557478 ATG3Q9NT62 314 aa23.55■■□□□ 1.36
NEDD1-212ENST00000557478 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.54■■□□□ 1.36
NEDD1-212ENST00000557478 SSFA2P28290 1259 aa23.54■■□□□ 1.36
NEDD1-212ENST00000557478 ATP6V1AP38606 617 aa23.54■■□□□ 1.36
NEDD1-212ENST00000557478 SYT17Q9BSW7 474 aa23.54■■□□□ 1.36
NEDD1-212ENST00000557478 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
NEDD1-212ENST00000557478 NUDCQ9Y266 331 aa23.54■■□□□ 1.36
NEDD1-212ENST00000557478 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
NEDD1-212ENST00000557478 ITGB4P16144 1822 aa23.53■■□□□ 1.36
NEDD1-212ENST00000557478 C5P01031 1676 aa23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms