RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AKT1S1Q96B36 256 aa27.07■■□□□ 1.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PAPPAQ13219 1627 aa27.07■■□□□ 1.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYOM1P52179 1685 aa27.07■■□□□ 1.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.06■■□□□ 1.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NBPF4Q96M43 638 aa27.06■■□□□ 1.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARXQ96QS3 562 aa27.06■■□□□ 1.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.05■■□□□ 1.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.04■■□□□ 1.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.01■■□□□ 1.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MEGF6O75095 1541 aa27■■□□□ 1.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UTRNP46939 3433 aa26.99■■□□□ 1.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.99■■□□□ 1.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa26.99■■□□□ 1.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 INSRP06213 1382 aa26.98■■□□□ 1.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.98■■□□□ 1.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NSD2O96028 1365 aa26.97■■□□□ 1.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.97■■□□□ 1.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAP3K5Q99683 1374 aa26.97■■□□□ 1.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNQ4P56696 695 aa26.97■■□□□ 1.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.97■■□□□ 1.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa26.96■■□□□ 1.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.96■■□□□ 1.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POLD1P28340 1107 aa26.95■■□□□ 1.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FLT4P35916 1363 aa26.95■■□□□ 1.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.92■■□□□ 1.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.92■■□□□ 1.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.9■■□□□ 1.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.9■■□□□ 1.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.9■■□□□ 1.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LY75O60449 1722 aa26.89■■□□□ 1.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.88■■□□□ 1.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.88■■□□□ 1.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.86■■□□□ 1.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYP27B1O15528 508 aa26.85■■□□□ 1.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPR162Q16538 588 aa26.85■■□□□ 1.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KLHL34Q8N239 644 aa26.85■■□□□ 1.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MSH5O43196 834 aa26.84■■□□□ 1.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.84■■□□□ 1.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.83■■□□□ 1.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.82■■□□□ 1.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.8■■□□□ 1.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPG7Q9UQ90 795 aa26.8■■□□□ 1.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.79■■□□□ 1.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PALLDQ8WX93 1383 aa26.79■■□□□ 1.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NCAPD2Q15021 1401 aa26.78■■□□□ 1.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EYA1Q99502 592 aa26.77■■□□□ 1.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POLKQ9UBT6 870 aa26.77■■□□□ 1.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHD4Q14839 1912 aa26.77■■□□□ 1.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.76■■□□□ 1.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PIGBQ92521 554 aa26.75■■□□□ 1.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.74■■□□□ 1.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MSL1Q68DK7 614 aa26.72■■□□□ 1.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AK7Q96M32 723 aa26.71■■□□□ 1.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.7■■□□□ 1.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C5P01031 1676 aa26.7■■□□□ 1.86
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GRIN3BO60391 1043 aa26.69■■□□□ 1.86
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.69■■□□□ 1.86
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.68■■□□□ 1.86
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.68■■□□□ 1.86
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.68■■□□□ 1.86
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.67■■□□□ 1.86
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PHKG2P15735 406 aa26.67■■□□□ 1.86
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SIK1P57059 783 aa26.67■■□□□ 1.86
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.67■■□□□ 1.86
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ITGB4P16144 1822 aa26.67■■□□□ 1.86
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.65■■□□□ 1.86
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.64■■□□□ 1.86
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PANK3Q9H999 370 aa26.64■■□□□ 1.86
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.64■■□□□ 1.86
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.63■■□□□ 1.85
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C4BP0C0L5 1744 aa26.63■■□□□ 1.85
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AMIGO3Q86WK7 504 aa26.63■■□□□ 1.85
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SSFA2P28290 1259 aa26.62■■□□□ 1.85
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C1QTNF8P60827 252 aa26.62■■□□□ 1.85
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.62■■□□□ 1.85
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PHF14O94880 888 aa26.61■■□□□ 1.85
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP6V1AP38606 617 aa26.6■■□□□ 1.85
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATG3Q9NT62 314 aa26.6■■□□□ 1.85
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.6■■□□□ 1.85
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMIM5Q71RC9 77 aa26.59■■□□□ 1.85
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms