RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555540.1

KRT18P6-201, Transcript of keratin 18 pseudogene 6, humanhuman

BASIC

Gene KRT18P6, Length 1,265 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P6-201ENST00000555540 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
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KRT18P6-201ENST00000555540 ARXQ96QS3 562 aa28.55■■■□□ 2.16
KRT18P6-201ENST00000555540 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.55■■■□□ 2.16
KRT18P6-201ENST00000555540 LY75O60449 1722 aa28.55■■■□□ 2.16
KRT18P6-201ENST00000555540 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
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KRT18P6-201ENST00000555540 NBPF4Q96M43 638 aa28.52■■■□□ 2.16
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KRT18P6-201ENST00000555540 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.49■■■□□ 2.15
KRT18P6-201ENST00000555540 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
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KRT18P6-201ENST00000555540 CDCA8Q53HL2 280 aa28.47■■■□□ 2.15
KRT18P6-201ENST00000555540 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa28.46■■■□□ 2.15
KRT18P6-201ENST00000555540 CHD4Q14839 1912 aa28.45■■■□□ 2.15
KRT18P6-201ENST00000555540 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.45■■■□□ 2.14
KRT18P6-201ENST00000555540 INSRP06213 1382 aa28.45■■■□□ 2.14
KRT18P6-201ENST00000555540 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.44■■■□□ 2.14
KRT18P6-201ENST00000555540 FLT4P35916 1363 aa28.44■■■□□ 2.14
KRT18P6-201ENST00000555540 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.44■■■□□ 2.14
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KRT18P6-201ENST00000555540 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
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KRT18P6-201ENST00000555540 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.39■■■□□ 2.13
KRT18P6-201ENST00000555540 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.38■■■□□ 2.13
KRT18P6-201ENST00000555540 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
KRT18P6-201ENST00000555540 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.37■■■□□ 2.13
KRT18P6-201ENST00000555540 KLHL34Q8N239 644 aa28.36■■■□□ 2.13
KRT18P6-201ENST00000555540 C5P01031 1676 aa28.35■■■□□ 2.13
KRT18P6-201ENST00000555540 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.35■■■□□ 2.13
KRT18P6-201ENST00000555540 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.34■■■□□ 2.13
KRT18P6-201ENST00000555540 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.33■■■□□ 2.13
KRT18P6-201ENST00000555540 GPR162Q16538 588 aa28.33■■■□□ 2.13
KRT18P6-201ENST00000555540 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.32■■■□□ 2.12
KRT18P6-201ENST00000555540 CYP27B1O15528 508 aa28.32■■■□□ 2.12
KRT18P6-201ENST00000555540 ITGB4P16144 1822 aa28.32■■■□□ 2.12
KRT18P6-201ENST00000555540 TAF1LQ8IZX4 1826 aa28.32■■■□□ 2.12
KRT18P6-201ENST00000555540 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
KRT18P6-201ENST00000555540 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.31■■■□□ 2.12
KRT18P6-201ENST00000555540 NCAPD2Q15021 1401 aa28.3■■■□□ 2.12
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KRT18P6-201ENST00000555540 MSH5O43196 834 aa28.29■■■□□ 2.12
KRT18P6-201ENST00000555540 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.29■■■□□ 2.12
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KRT18P6-201ENST00000555540 NLGN2Q8NFZ4 835 aa28.27■■■□□ 2.12
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KRT18P6-201ENST00000555540 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
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KRT18P6-201ENST00000555540 PIGBQ92521 554 aa28.2■■■□□ 2.1
KRT18P6-201ENST00000555540 EYA1Q99502 592 aa28.2■■■□□ 2.1
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KRT18P6-201ENST00000555540 AK7Q96M32 723 aa28.16■■■□□ 2.1
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KRT18P6-201ENST00000555540 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.15■■■□□ 2.1
KRT18P6-201ENST00000555540 GRIN3BO60391 1043 aa28.14■■■□□ 2.1
KRT18P6-201ENST00000555540 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.13■■■□□ 2.09
KRT18P6-201ENST00000555540 PHKG2P15735 406 aa28.12■■■□□ 2.09
KRT18P6-201ENST00000555540 C1QTNF8P60827 252 aa28.12■■■□□ 2.09
KRT18P6-201ENST00000555540 AMIGO3Q86WK7 504 aa28.12■■■□□ 2.09
KRT18P6-201ENST00000555540 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.12■■■□□ 2.09
KRT18P6-201ENST00000555540 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.12■■■□□ 2.09
KRT18P6-201ENST00000555540 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.11■■■□□ 2.09
KRT18P6-201ENST00000555540 SIK1P57059 783 aa28.11■■■□□ 2.09
KRT18P6-201ENST00000555540 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
KRT18P6-201ENST00000555540 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.11■■■□□ 2.09
KRT18P6-201ENST00000555540 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
KRT18P6-201ENST00000555540 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.1■■■□□ 2.09
KRT18P6-201ENST00000555540 PHF14O94880 888 aa28.09■■■□□ 2.09
KRT18P6-201ENST00000555540 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.09■■■□□ 2.09
KRT18P6-201ENST00000555540 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
KRT18P6-201ENST00000555540 SSFA2P28290 1259 aa28.08■■■□□ 2.09
KRT18P6-201ENST00000555540 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.08■■■□□ 2.09
KRT18P6-201ENST00000555540 SMIM5Q71RC9 77 aa28.07■■■□□ 2.08
KRT18P6-201ENST00000555540 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
KRT18P6-201ENST00000555540 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.05■■■□□ 2.08
KRT18P6-201ENST00000555540 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.04■■■□□ 2.08
KRT18P6-201ENST00000555540 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.04■■■□□ 2.08
KRT18P6-201ENST00000555540 ATP6V1AP38606 617 aa28.04■■■□□ 2.08
KRT18P6-201ENST00000555540 ITPK1Q13572 414 aa28.04■■■□□ 2.08
KRT18P6-201ENST00000555540 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
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