RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553686.5

ATXN3-223, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 869 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-223	ENST00000553686	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ATXN3-223	ENST00000553686	APBB1	O00213	710 aa		10.38	□□□□□ -0.75
ATXN3-223	ENST00000553686	ADH1C	P00326	375 aa		10.38	□□□□□ -0.75
ATXN3-223	ENST00000553686	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
ATXN3-223	ENST00000553686	ADAM32	Q8TC27	787 aa		10.38	□□□□□ -0.75
ATXN3-223	ENST00000553686	IGF1R	P08069	1367 aa		10.38	□□□□□ -0.75
ATXN3-223	ENST00000553686	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		10.37	□□□□□ -0.75
ATXN3-223	ENST00000553686	NR5A1	Q13285	461 aa		10.37	□□□□□ -0.75
ATXN3-223	ENST00000553686	NNT	Q13423	1086 aa		10.37	□□□□□ -0.75
ATXN3-223	ENST00000553686	DACH1	Q9UI36	760 aa		10.37	□□□□□ -0.75
ATXN3-223	ENST00000553686	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ATXN3-223	ENST00000553686	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ATXN3-223	ENST00000553686	ZBBX	A8MT70	800 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ATXN3-223	ENST00000553686	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ATXN3-223	ENST00000553686	RAPGEF3	O95398	923 aa		10.34	□□□□□ -0.75
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		10.34	□□□□□ -0.75
ATXN3-223	ENST00000553686	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		10.34	□□□□□ -0.75
ATXN3-223	ENST00000553686	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF787	Q6DD87	383 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	NR3C2	P08235	984 aa		10.32	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	FBXO45	P0C2W1	286 aa		10.32	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		10.32	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		10.32	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	FSHR	P23945	695 aa		10.31	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		10.31	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	POTEC	B2RU33	542 aa		10.3	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	KIF21B	O75037	1637 aa		10.29	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		10.29	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	GPR37L1	O60883	481 aa		10.29	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	NR1H3	Q13133	447 aa		10.29	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	MCM6	Q14566	821 aa		10.29	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		10.29	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		10.29	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		10.29	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	TIMP2	P16035	220 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ATXN3-223	ENST00000553686	KIF27	Q86VH2	1401 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	ITPKC	Q96DU7	683 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	CUL7	Q14999	1698 aa		10.26	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		10.26	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		10.26	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	ABL2	P42684	1182 aa		10.25	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	RAB15	P59190	212 aa		10.25	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		10.25	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	DISP1	Q96F81	1524 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	FLII	Q13045	1269 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	IRF5	Q13568	498 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	BMP1	P13497	986 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	ESPN	B1AK53	854 aa		10.22	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	MLEC	Q14165	292 aa		10.22	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	SENP2	Q9HC62	589 aa		10.22	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	PTPRT	O14522	1441 aa		10.22	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		10.22	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	MADD	Q8WXG6	1647 aa		10.22	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	COG6	Q9Y2V7	657 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ATXN3-223	ENST00000553686	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ATXN3-223	ENST00000553686	IQGAP2	Q13576	1575 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ATXN3-223	ENST00000553686	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF592	Q92610	1267 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ATXN3-223	ENST00000553686	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ATXN3-223	ENST00000553686	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ATXN3-223	ENST00000553686	NEO1	Q92859	1461 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ATXN3-223	ENST00000553686	AKNA	Q7Z591	1439 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ATXN3-223	ENST00000553686	VAC14	Q08AM6	782 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ATXN3-223	ENST00000553686	SCARF1	Q14162	830 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ATXN3-223	ENST00000553686	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ATXN3-223	ENST00000553686	POM121	Q96HA1	1249 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ATXN3-223	ENST00000553686	RAD21	O60216	631 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ATXN3-223	ENST00000553686	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ATXN3-223	ENST00000553686	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ATXN3-223	ENST00000553686	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ATXN3-223	ENST00000553686	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	10.18	□□□□□ -0.78
ATXN3-223	ENST00000553686	CBLB	Q13191	982 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ATXN3-223	ENST00000553686	WASHC4	Q2M389	1173 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ATXN3-223	ENST00000553686	KIFC2	Q96AC6	838 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ATXN3-223	ENST00000553686	TRIM47	Q96LD4	638 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ATXN3-223	ENST00000553686	ZFP42	Q96MM3	310 aa		10.18	□□□□□ -0.78

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