RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551676.5

PPP1CC-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-208	ENST00000551676	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PPP1CC-208	ENST00000551676	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
PPP1CC-208	ENST00000551676	MAP3K5	Q99683	1374 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PPP1CC-208	ENST00000551676	MBIP	Q9NS73	344 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PPP1CC-208	ENST00000551676	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PPP1CC-208	ENST00000551676	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PPP1CC-208	ENST00000551676	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
PPP1CC-208	ENST00000551676	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
PPP1CC-208	ENST00000551676	CHL1	O00533	1208 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PPP1CC-208	ENST00000551676	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PPP1CC-208	ENST00000551676	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		33.27	■■■□□ 2.92
PPP1CC-208	ENST00000551676	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		33.26	■■■□□ 2.91
PPP1CC-208	ENST00000551676	LRRC37A3	O60309	1634 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PPP1CC-208	ENST00000551676	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF428	Q96B54	188 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PPP1CC-208	ENST00000551676	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PPP1CC-208	ENST00000551676	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PPP1CC-208	ENST00000551676	PHLPP1	O60346	1717 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PPP1CC-208	ENST00000551676	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
PPP1CC-208	ENST00000551676	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PPP1CC-208	ENST00000551676	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
PPP1CC-208	ENST00000551676	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PPP1CC-208	ENST00000551676	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PPP1CC-208	ENST00000551676	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PPP1CC-208	ENST00000551676	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PPP1CC-208	ENST00000551676	PIP4K2B	P78356	416 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PPP1CC-208	ENST00000551676	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	33.18	■■■□□ 2.9	2e-7	■□□□□ 10.3
PPP1CC-208	ENST00000551676	VAMP4	O75379	141 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PPP1CC-208	ENST00000551676	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PPP1CC-208	ENST00000551676	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PPP1CC-208	ENST00000551676	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
PPP1CC-208	ENST00000551676	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PPP1CC-208	ENST00000551676	PDE3A	Q14432	1141 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PPP1CC-208	ENST00000551676	MEGF6	O75095	1541 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PPP1CC-208	ENST00000551676	TSPYL6	Q8N831	410 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PPP1CC-208	ENST00000551676	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PPP1CC-208	ENST00000551676	CRBN	Q96SW2	442 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PPP1CC-208	ENST00000551676	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PPP1CC-208	ENST00000551676	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
PPP1CC-208	ENST00000551676	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
PPP1CC-208	ENST00000551676	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
PPP1CC-208	ENST00000551676	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PPP1CC-208	ENST00000551676	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PPP1CC-208	ENST00000551676	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PPP1CC-208	ENST00000551676	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PPP1CC-208	ENST00000551676	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
PPP1CC-208	ENST00000551676	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PPP1CC-208	ENST00000551676	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PPP1CC-208	ENST00000551676	CERK	Q8TCT0	537 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PPP1CC-208	ENST00000551676	LGR6	Q9HBX8	967 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PPP1CC-208	ENST00000551676	SPG7	Q9UQ90	795 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PPP1CC-208	ENST00000551676	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
PPP1CC-208	ENST00000551676	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PPP1CC-208	ENST00000551676	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
PPP1CC-208	ENST00000551676	EVA1C	P58658	441 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PPP1CC-208	ENST00000551676	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
PPP1CC-208	ENST00000551676	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PPP1CC-208	ENST00000551676	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
PPP1CC-208	ENST00000551676	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PPP1CC-208	ENST00000551676	BTG4	Q9NY30	223 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PPP1CC-208	ENST00000551676	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PPP1CC-208	ENST00000551676	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PPP1CC-208	ENST00000551676	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PPP1CC-208	ENST00000551676	STRN4	Q9NRL3	753 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PPP1CC-208	ENST00000551676	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
PPP1CC-208	ENST00000551676	KIF16B	Q96L93	1317 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PPP1CC-208	ENST00000551676	PHKG2	P15735	406 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PPP1CC-208	ENST00000551676	KRT24	Q2M2I5	525 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PPP1CC-208	ENST00000551676	MS4A1	P11836	297 aa		33.01	■■■□□ 2.88
PPP1CC-208	ENST00000551676	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		33	■■■□□ 2.87
PPP1CC-208	ENST00000551676	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
PPP1CC-208	ENST00000551676	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
PPP1CC-208	ENST00000551676	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
PPP1CC-208	ENST00000551676	PANK1	Q8TE04	598 aa		33	■■■□□ 2.87
PPP1CC-208	ENST00000551676	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		33	■■■□□ 2.87
PPP1CC-208	ENST00000551676	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
PPP1CC-208	ENST00000551676	TEF	Q10587	303 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PPP1CC-208	ENST00000551676	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PPP1CC-208	ENST00000551676	CYP27B1	O15528	508 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PPP1CC-208	ENST00000551676	IL2RB	P14784	551 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PPP1CC-208	ENST00000551676	TNN	Q9UQP3	1299 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PPP1CC-208	ENST00000551676	RLBP1	P12271	317 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PPP1CC-208	ENST00000551676	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PPP1CC-208	ENST00000551676	TRIM27	P14373	513 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PPP1CC-208	ENST00000551676	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
PPP1CC-208	ENST00000551676	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.86
PPP1CC-208	ENST00000551676	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
PPP1CC-208	ENST00000551676	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PPP1CC-208	ENST00000551676	JCAD	Q9P266	1359 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PPP1CC-208	ENST00000551676	DCAF5	Q96JK2	942 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PPP1CC-208	ENST00000551676	COG6	Q9Y2V7	657 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PPP1CC-208	ENST00000551676	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
PPP1CC-208	ENST00000551676	BTBD11	A6QL63	1104 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PPP1CC-208	ENST00000551676	ADAMTS2	O95450	1211 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PPP1CC-208	ENST00000551676	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
PPP1CC-208	ENST00000551676	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PPP1CC-208	ENST00000551676	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		32.9	■■■□□ 2.86

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