RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546560.5

FOXG1-AS1-201, FOXG1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FOXG1-AS1, Length 538 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 NRAPQ86VF7 1730 aa11.44□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PIK3C2AO00443 1686 aa11.44□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP11.44□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 FAM182BQ5T319 152 aa11.44□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa11.44□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 ABCC6O95255 1503 aa11.44□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 BRWD3Q6RI45 1802 aa11.44□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 CD163L1Q9NR16 1453 aa11.44□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 RALBP1Q15311 655 aa11.43□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KIF24Q5T7B8 1368 aa11.42□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 ERBB3P21860 1342 aa11.42□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 HOXC9P31274 260 aa11.42□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 DEFB132Q7Z7B7 95 aa11.42□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PANK3Q9H999 370 aa11.42□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 MAP3K19Q56UN5 1328 aa11.41□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 LMO7Q8WWI1 1683 aa11.41□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 TATP17735 454 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 CCDC184Q52MB2 194 aa11.41□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 MORC1Q86VD1 984 aa11.41□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 CARD14Q9BXL6 1004 aa11.41□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa11.41□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa11.41□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 OVOS2Q6IE36 1432 aa11.41□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PARD3Q8TEW0 1356 aa11.41□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PLSCR1O15162 318 aa11.4□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 NEFLP07196 543 aa11.4□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 RTL1A6NKG5 1358 aa11.4□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 ZBED9Q6R2W3 1325 aa11.39□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 GSE1Q14687 1217 aa11.39□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 NSD3Q9BZ95 1437 aa11.39□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 HS6ST3Q8IZP7 471 aa11.38□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 FAM9BQ8IZU0 186 aa11.38□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 SPG7Q9UQ90 795 aa11.38□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 NFAT5O94916 1531 aa11.38□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 FLT4P35916 1363 aa11.38□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 RGPD1P0DJD0 1748 aa11.38□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa11.37□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 LTN1O94822 1766 aa11.37□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 COL18A1P39060 1754 aa11.37□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 RGPD5Q99666 1765 aa11.37□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 NUBP1P53384 320 aa11.37□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 NSD2O96028 1365 aa11.37□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 INSRP06213 1382 aa11.37□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 USP54Q70EL1 1684 aa11.36□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 CAMKK2Q96RR4 588 aa11.36□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 FBLN1P23142 703 aa11.35□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa11.35□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 NBPF6Q5VWK0 638 aa11.34□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 NBPF4Q96M43 638 aa11.34□□□□□ -0.59
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 STK32BQ9NY57 414 aa11.33□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 POLKQ9UBT6 870 aa11.33□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 DISP2A7MBM2 1401 aa11.33□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 BCL9O00512 1426 aa11.33□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KIF20BQ96Q89 1820 aa11.32□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 KAT6BQ8WYB5 2073 aa11.32□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.32□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 ACSBG1Q96GR2 724 aa11.32□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11.32□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa11.32□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 MYOM1P52179 1685 aa11.32□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa11.32□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa11.32□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.31□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 ERICH6BQ5W0A0 696 aa11.31□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa11.3□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 TNS2Q63HR2 1409 aa11.3□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 AMOTQ4VCS5 1084 aa11.3□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 SLC27A3Q5K4L6 730 aa11.3□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 CFAP53Q96M91 514 aa11.3□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 TXNRD1Q16881 649 aa11.29□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 IFNL2Q8IZJ0 200 aa11.29□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 USHBP1Q8N6Y0 703 aa11.29□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
FOXG1-AS1-201ENST00000546560 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms