RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	APBB1	O00213	710 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	7.65	□□□□□ -1.18
SNHG1-222	ENST00000545308	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SNHG1-222	ENST00000545308	SLURP2	P0DP57	97 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308		A6NJR5	290 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	MCM6	Q14566	821 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM52	Q96A61	297 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	SVOP	Q8N4V2	548 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	CYLD	Q9NQC7	956 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	ZBBX	A8MT70	800 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	TRAK2	O60296	914 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	RASSF7	Q02833	373 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	WHAMM	Q8TF30	809 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGEF15	O94989	841 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	GDF11	O95390	407 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	FBXO45	P0C2W1	286 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC125	Q86Z20	511 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAMTS2	O95450	1211 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	GPC1	P35052	558 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	POM121	Q96HA1	1249 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	RHOQ	P17081	205 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	ERVK-9	P63128	1117 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	GAS6	Q14393	721 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	GMCL1	Q96IK5	515 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PRU2	124 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	MEN1	O00255	615 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF20	Q5VTR2	975 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	IRS1	P35568	1242 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	NR1H3	Q13133	447 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SNHG1-222	ENST00000545308	MAP3K10	Q02779	954 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	DBN1	Q16643	649 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF592	Q92610	1267 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	NLRP3	Q96P20	1036 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	SNRK	Q9NRH2	765 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	MBIP	Q9NS73	344 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	SOCS7	O14512	581 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	SCTR	P47872	440 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	POU4F2	Q12837	409 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	CLN3	Q13286	438 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	KANK3	Q6NY19	840 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	BANK1	Q8NDB2	785 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	COG6	Q9Y2V7	657 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308		H7C1W4	665 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR25	O00155	361 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR37L1	O60883	481 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR44	Q5JSH3	913 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	NBPF15	Q8N660	670 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	IGF1R	P08069	1367 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	RAD21	O60216	631 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHA1	P01876	353 aa		7.46	□□□□□ -1.22

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