RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 CDC14CA4D256 554 aa9.97□□□□□ -0.81
TRDN-204ENST00000542443 MEN1O00255 615 aa9.97□□□□□ -0.81
TRDN-204ENST00000542443 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa9.97□□□□□ -0.81
TRDN-204ENST00000542443 ITGA6P23229 1130 aa9.96□□□□□ -0.82
TRDN-204ENST00000542443 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.96□□□□□ -0.82
TRDN-204ENST00000542443 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.96□□□□□ -0.82
TRDN-204ENST00000542443 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.96□□□□□ -0.82
TRDN-204ENST00000542443 CCDC125Q86Z20 511 aa9.96□□□□□ -0.82
TRDN-204ENST00000542443 VWA5B2Q8N398 1253 aa9.96□□□□□ -0.82
TRDN-204ENST00000542443 ZMYND15Q9H091 742 aa9.96□□□□□ -0.82
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TRDN-204ENST00000542443 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa9.95□□□□□ -0.82
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TRDN-204ENST00000542443 ERVK-9P63128 1117 aa9.94□□□□□ -0.82
TRDN-204ENST00000542443 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
TRDN-204ENST00000542443 A0A1W2PRU2 124 aa9.93□□□□□ -0.82
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TRDN-204ENST00000542443 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
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TRDN-204ENST00000542443 CYP2U1Q7Z449 544 aa9.91□□□□□ -0.82
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TRDN-204ENST00000542443 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.9□□□□□ -0.82
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TRDN-204ENST00000542443 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
TRDN-204ENST00000542443 POM121Q96HA1 1249 aa9.87□□□□□ -0.83
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TRDN-204ENST00000542443 NBPF15Q8N660 670 aa9.82□□□□□ -0.84
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TRDN-204ENST00000542443 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
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TRDN-204ENST00000542443 CNKSR1Q969H4 720 aa9.81□□□□□ -0.84
TRDN-204ENST00000542443 IL2RAP01589 272 aa9.8□□□□□ -0.84
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TRDN-204ENST00000542443 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
TRDN-204ENST00000542443 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.8□□□□□ -0.84
TRDN-204ENST00000542443 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.8□□□□□ -0.84
TRDN-204ENST00000542443 GPR25O00155 361 aa9.79□□□□□ -0.84
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TRDN-204ENST00000542443 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.79□□□□□ -0.84
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TRDN-204ENST00000542443 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa9.79□□□□□ -0.84
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TRDN-204ENST00000542443 GMCL1Q96IK5 515 aa9.77□□□□□ -0.85
TRDN-204ENST00000542443 H7C1W4 665 aa9.76□□□□□ -0.85
TRDN-204ENST00000542443 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TRDN-204ENST00000542443 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
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TRDN-204ENST00000542443 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TRDN-204ENST00000542443 XAGE2Q96GT9 111 aa9.76□□□□□ -0.85
TRDN-204ENST00000542443 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
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