RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542432.5

RECQL-208, Transcript of RecQ like helicase, human

TSL 3

Gene RECQL, Length 600 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RECQL-208	ENST00000542432	ZBTB7A	O95365	584 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RECQL-208	ENST00000542432	INSR	P06213	1382 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RECQL-208	ENST00000542432	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RECQL-208	ENST00000542432	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RECQL-208	ENST00000542432	KCNQ4	P56696	695 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RECQL-208	ENST00000542432	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RECQL-208	ENST00000542432	SPON1	Q9HCB6	807 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RECQL-208	ENST00000542432	SLC15A2	Q16348	729 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RECQL-208	ENST00000542432	PANK3	Q9H999	370 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RECQL-208	ENST00000542432	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RECQL-208	ENST00000542432	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
RECQL-208	ENST00000542432	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
RECQL-208	ENST00000542432	BTAF1	O14981	1849 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RECQL-208	ENST00000542432	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RECQL-208	ENST00000542432	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RECQL-208	ENST00000542432	ZNF827	Q17R98	1081 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RECQL-208	ENST00000542432	POLK	Q9UBT6	870 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RECQL-208	ENST00000542432	NSD2	O96028	1365 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RECQL-208	ENST00000542432	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RECQL-208	ENST00000542432	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RECQL-208	ENST00000542432	CASZ1	Q86V15	1759 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RECQL-208	ENST00000542432	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RECQL-208	ENST00000542432	PAPPA	Q13219	1627 aa		13.9	□□□□□ -0.19
RECQL-208	ENST00000542432	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		13.9	□□□□□ -0.19
RECQL-208	ENST00000542432	CYP27B1	O15528	508 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RECQL-208	ENST00000542432	EYA1	Q99502	592 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RECQL-208	ENST00000542432	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RECQL-208	ENST00000542432	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RECQL-208	ENST00000542432	PTGER2	P43116	358 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RECQL-208	ENST00000542432	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RECQL-208	ENST00000542432	AKT1S1	Q96B36	256 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RECQL-208	ENST00000542432	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RECQL-208	ENST00000542432	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RECQL-208	ENST00000542432	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RECQL-208	ENST00000542432	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RECQL-208	ENST00000542432	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RECQL-208	ENST00000542432	NCAPD2	Q15021	1401 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RECQL-208	ENST00000542432	MORC1	Q86VD1	984 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RECQL-208	ENST00000542432	MTFR1L	Q9H019	292 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RECQL-208	ENST00000542432	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
RECQL-208	ENST00000542432	UTRN	P46939	3433 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RECQL-208	ENST00000542432	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RECQL-208	ENST00000542432	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RECQL-208	ENST00000542432	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	SPG7	Q9UQ90	795 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	PALLD	Q8WX93	1383 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	MSH5	O43196	834 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	PIGB	Q92521	554 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	LY75	O60449	1722 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	PHKG2	P15735	406 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	SMIM5	Q71RC9	77 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	KLHL34	Q8N239	644 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	ARX	Q96QS3	562 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	SYT17	Q9BSW7	474 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	MSL1	Q68DK7	614 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RECQL-208	ENST00000542432	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	ITGB4	P16144	1822 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	PHF14	O94880	888 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	YY1	P25490	414 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	POLD1	P28340	1107 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	IL13	P35225	146 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	C5	P01031	1676 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	MTHFS	P49914	203 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	SIK1	P57059	783 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	AK7	Q96M32	723 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	ATG3	Q9NT62	314 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	ITPK1	Q13572	414 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	HMOX1	P09601	288 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	ATP6V1A	P38606	617 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	C4B	P0C0L5	1744 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RECQL-208	ENST00000542432	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		13.71	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms