RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539613.5

RHBDD1-215, Transcript of rhomboid domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene RHBDD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1-215ENST00000539613 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa29.26■■■□□ 2.27
RHBDD1-215ENST00000539613 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.26■■■□□ 2.27
RHBDD1-215ENST00000539613 MEGF6O75095 1541 aa29.25■■■□□ 2.27
RHBDD1-215ENST00000539613 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa29.24■■■□□ 2.27
RHBDD1-215ENST00000539613 HOXC9P31274 260 aa29.24■■■□□ 2.27
RHBDD1-215ENST00000539613 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
RHBDD1-215ENST00000539613 SLC16A10Q8TF71 515 aa29.23■■■□□ 2.27
RHBDD1-215ENST00000539613 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
RHBDD1-215ENST00000539613 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.2■■■□□ 2.26
RHBDD1-215ENST00000539613 FBLN1P23142 703 aa29.2■■■□□ 2.26
RHBDD1-215ENST00000539613 NSD2O96028 1365 aa29.2■■■□□ 2.26
RHBDD1-215ENST00000539613 KIF20BQ96Q89 1820 aa29.2■■■□□ 2.26
RHBDD1-215ENST00000539613 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
RHBDD1-215ENST00000539613 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
RHBDD1-215ENST00000539613 RTL1A6NKG5 1358 aa29.18■■■□□ 2.26
RHBDD1-215ENST00000539613 MSH5O43196 834 aa29.18■■■□□ 2.26
RHBDD1-215ENST00000539613 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
RHBDD1-215ENST00000539613 C5P01031 1676 aa29.18■■■□□ 2.26
RHBDD1-215ENST00000539613 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.17■■■□□ 2.26
RHBDD1-215ENST00000539613 TESK2Q96S53 571 aa29.16■■■□□ 2.26
RHBDD1-215ENST00000539613 USP47Q96K76 1375 aa29.15■■■□□ 2.26
RHBDD1-215ENST00000539613 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.15■■■□□ 2.26
RHBDD1-215ENST00000539613 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
RHBDD1-215ENST00000539613 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.25
RHBDD1-215ENST00000539613 C1QTNF8P60827 252 aa29.13■■■□□ 2.25
RHBDD1-215ENST00000539613 NLGN2Q8NFZ4 835 aa29.13■■■□□ 2.25
RHBDD1-215ENST00000539613 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa29.12■■■□□ 2.25
RHBDD1-215ENST00000539613 TAF1LQ8IZX4 1826 aa29.1■■■□□ 2.25
RHBDD1-215ENST00000539613 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.1■■■□□ 2.25
RHBDD1-215ENST00000539613 NBPF6Q5VWK0 638 aa29.09■■■□□ 2.25
RHBDD1-215ENST00000539613 NBPF4Q96M43 638 aa29.09■■■□□ 2.25
RHBDD1-215ENST00000539613 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
RHBDD1-215ENST00000539613 MSL1Q68DK7 614 aa29.08■■■□□ 2.25
RHBDD1-215ENST00000539613 SLC24A1O60721 1099 aa29.07■■■□□ 2.24
RHBDD1-215ENST00000539613 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.07■■■□□ 2.24
RHBDD1-215ENST00000539613 TATP17735 454 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
RHBDD1-215ENST00000539613 ITGB4P16144 1822 aa29.06■■■□□ 2.24
RHBDD1-215ENST00000539613 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa29.06■■■□□ 2.24
RHBDD1-215ENST00000539613 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa29.04■■■□□ 2.24
RHBDD1-215ENST00000539613 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.04■■■□□ 2.24
RHBDD1-215ENST00000539613 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
RHBDD1-215ENST00000539613 TMF1P82094 1093 aa29.03■■■□□ 2.24
RHBDD1-215ENST00000539613 FYB1O15117 783 aa29.02■■■□□ 2.24
RHBDD1-215ENST00000539613 FLT4P35916 1363 aa29.01■■■□□ 2.24
RHBDD1-215ENST00000539613 PALLDQ8WX93 1383 aa29.01■■■□□ 2.24
RHBDD1-215ENST00000539613 PKD1L3Q7Z443 1732 aa29.01■■■□□ 2.23
RHBDD1-215ENST00000539613 C4BP0C0L5 1744 aa29■■■□□ 2.23
RHBDD1-215ENST00000539613 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
RHBDD1-215ENST00000539613 INSRP06213 1382 aa29■■■□□ 2.23
RHBDD1-215ENST00000539613 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.99■■■□□ 2.23
RHBDD1-215ENST00000539613 GRIN3BO60391 1043 aa28.98■■■□□ 2.23
RHBDD1-215ENST00000539613 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.98■■■□□ 2.23
RHBDD1-215ENST00000539613 UBR3Q6ZT12 1888 aa28.95■■■□□ 2.23
RHBDD1-215ENST00000539613 FLAD1Q8NFF5 587 aa28.93■■■□□ 2.22
RHBDD1-215ENST00000539613 AK7Q96M32 723 aa28.93■■■□□ 2.22
RHBDD1-215ENST00000539613 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.92■■■□□ 2.22
RHBDD1-215ENST00000539613 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.92■■■□□ 2.22
RHBDD1-215ENST00000539613 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
RHBDD1-215ENST00000539613 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.91■■■□□ 2.22
RHBDD1-215ENST00000539613 CYP27B1O15528 508 aa28.9■■■□□ 2.22
RHBDD1-215ENST00000539613 PHF14O94880 888 aa28.9■■■□□ 2.22
RHBDD1-215ENST00000539613 CDCA8Q53HL2 280 aa28.9■■■□□ 2.22
RHBDD1-215ENST00000539613 ATP10DQ9P241 1426 aa28.9■■■□□ 2.22
RHBDD1-215ENST00000539613 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
RHBDD1-215ENST00000539613 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
RHBDD1-215ENST00000539613 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.89■■■□□ 2.22
RHBDD1-215ENST00000539613 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.88■■■□□ 2.21
RHBDD1-215ENST00000539613 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
RHBDD1-215ENST00000539613 WWC3Q9ULE0 1092 aa28.85■■■□□ 2.21
RHBDD1-215ENST00000539613 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
RHBDD1-215ENST00000539613 SMIM5Q71RC9 77 aa28.82■■■□□ 2.2
RHBDD1-215ENST00000539613 AMIGO3Q86WK7 504 aa28.82■■■□□ 2.2
RHBDD1-215ENST00000539613 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
RHBDD1-215ENST00000539613 PIGBQ92521 554 aa28.82■■■□□ 2.2
RHBDD1-215ENST00000539613 SPG7Q9UQ90 795 aa28.82■■■□□ 2.2
RHBDD1-215ENST00000539613 NCAPD2Q15021 1401 aa28.81■■■□□ 2.2
RHBDD1-215ENST00000539613 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.8■■■□□ 2.2
RHBDD1-215ENST00000539613 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.8■■■□□ 2.2
RHBDD1-215ENST00000539613 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
RHBDD1-215ENST00000539613 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.79■■■□□ 2.2
RHBDD1-215ENST00000539613 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.77■■■□□ 2.2
RHBDD1-215ENST00000539613 SIK1P57059 783 aa28.77■■■□□ 2.2
RHBDD1-215ENST00000539613 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.77■■■□□ 2.2
RHBDD1-215ENST00000539613 SSFA2P28290 1259 aa28.76■■■□□ 2.19
RHBDD1-215ENST00000539613 CEP350Q5VT06 3117 aa28.76■■■□□ 2.19
RHBDD1-215ENST00000539613 GNPATO15228 680 aa28.75■■■□□ 2.19
RHBDD1-215ENST00000539613 ADCY9O60503 1353 aa28.75■■■□□ 2.19
RHBDD1-215ENST00000539613 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
RHBDD1-215ENST00000539613 EYA1Q99502 592 aa28.73■■■□□ 2.19
RHBDD1-215ENST00000539613 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.73■■■□□ 2.19
RHBDD1-215ENST00000539613 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.72■■■□□ 2.19
RHBDD1-215ENST00000539613 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.72■■■□□ 2.19
RHBDD1-215ENST00000539613 ATP6V1AP38606 617 aa28.71■■■□□ 2.19
RHBDD1-215ENST00000539613 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
RHBDD1-215ENST00000539613 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.7■■■□□ 2.18
RHBDD1-215ENST00000539613 PHKG2P15735 406 aa28.69■■■□□ 2.18
RHBDD1-215ENST00000539613 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
RHBDD1-215ENST00000539613 ITPK1Q13572 414 aa28.69■■■□□ 2.18
RHBDD1-215ENST00000539613 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
RHBDD1-215ENST00000539613 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms