RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539034.1

CLIP1-AS1-202, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CLIP1-AS1, Length 447 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PRR20EP86478 221 aa9.07□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PRR20CP86479 221 aa9.07□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PRR20DP86480 221 aa9.07□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PRR20BP86481 221 aa9.07□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PRR20AP86496 221 aa9.07□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 LINC01559Q495D7 138 aa9.07□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.07□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 BAP1Q92560 729 aa9.07□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FOXJ1Q92949 421 aa9.07□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ATP2B4P23634 1241 aa9.06□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.06□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SIX5Q8N196 739 aa9.06□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZNF511Q8NB15 262 aa9.06□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.06□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 KIAA1024Q9UPX6 916 aa9.06□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FAM187AA6NFU0 413 aa9.05□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 AGERQ15109 404 aa9.05□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 LARGE2Q8N3Y3 721 aa9.05□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DKK1O94907 266 aa9.04□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GTF2IP78347 998 aa9.04□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PKDCCQ504Y2 493 aa9.04□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa9.04□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RNF20Q5VTR2 975 aa9.03□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CYP4X1Q8N118 509 aa9.03□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.03□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SKOR1P84550 965 aa9.02□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.02□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SOWAHDA6NJG2 315 aa9.01□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ESPNB1AK53 854 aa9.01□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 WNT7AO00755 349 aa9.01□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SERPINB4P48594 390 aa9.01□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SEC13P55735 322 aa9.01□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MRGPRX2Q96LB1 330 aa9.01□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DGAT1O75907 488 aa9□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CCDC102BQ68D86 513 aa9□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TPCN2Q8NHX9 752 aa9□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 C1orf216Q8TAB5 229 aa9□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TOR4AQ9NXH8 423 aa9□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa9□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PRMT3O60678 531 aa8.99□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SCNN1AP37088 669 aa8.99□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SH3BP2P78314 561 aa8.99□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 OCLNQ16625 522 aa8.99□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SEPT12Q8IYM1 358 aa8.99□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SIRT1Q96EB6 747 aa8.99□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SFI1A8K8P3 1242 aa8.98□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 WNT7BP56706 349 aa8.98□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MYT1Q01538 1121 aa8.98□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PSME1Q06323 249 aa8.98□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 E9PSI1 815 aa8.96□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 J3QL48 77 aa8.96□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 USP4Q13107 963 aa8.96□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CCDC125Q86Z20 511 aa8.96□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.96□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ST8SIA5O15466 376 aa8.95□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.95□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.95□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SMPD1P17405 629 aa8.94□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RAB15P59190 212 aa8.94□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ALDH1A1P00352 501 aa8.93□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.93□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 LGR5O75473 907 aa8.92□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ERCC3P19447 782 aa8.92□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.92□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 M0R2N6 131 aa8.91□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ABL1P00519 1130 aa8.91□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SCTRP47872 440 aa8.91□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 HINFPQ9BQA5 517 aa8.91□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 H3BRB1 525 aa8.9□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.9□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 WEE1P30291 646 aa8.9□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZNF787Q6DD87 383 aa8.9□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 AAASQ9NRG9 546 aa8.9□□□□□ -0.98
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 UNCXA6NJT0 531 aa8.89□□□□□ -0.99
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SIAH2O43255 324 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms