RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538734.6

MIR9-3HG-202, Transcript of MIR9-3 host gene, humanhuman

TSL 2

Gene MIR9-3HG, Length 1,877 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CFAP44Q96MT7 982 aa26.49■■□□□ 1.83
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.48■■□□□ 1.83
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
MIR9-3HG-202ENST00000538734 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.47■■□□□ 1.83
MIR9-3HG-202ENST00000538734 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.45■■□□□ 1.82
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.45■■□□□ 1.82
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MAP3K5Q99683 1374 aa26.45■■□□□ 1.82
MIR9-3HG-202ENST00000538734 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MBIPQ9NS73 344 aa26.44■■□□□ 1.82
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CRB1P82279 1406 aa26.43■■□□□ 1.82
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.42■■□□□ 1.82
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PLIN1O60240 522 aa26.42■■□□□ 1.82
MIR9-3HG-202ENST00000538734 BCAR3O75815 825 aa26.42■■□□□ 1.82
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CHL1O00533 1208 aa26.41■■□□□ 1.82
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
MIR9-3HG-202ENST00000538734 IL17REQ8NFR9 667 aa26.41■■□□□ 1.82
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EVA1CP58658 441 aa26.4■■□□□ 1.82
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.4■■□□□ 1.82
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
MIR9-3HG-202ENST00000538734 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.39■■□□□ 1.82
MIR9-3HG-202ENST00000538734 BTG4Q9NY30 223 aa26.38■■□□□ 1.81
MIR9-3HG-202ENST00000538734 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
MIR9-3HG-202ENST00000538734 STRN4Q9NRL3 753 aa26.37■■□□□ 1.81
MIR9-3HG-202ENST00000538734 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.37■■□□□ 1.81
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.36■■□□□ 1.81
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.36■■□□□ 1.81
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MEGF6O75095 1541 aa26.36■■□□□ 1.81
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LRRC37A3O60309 1634 aa26.36■■□□□ 1.81
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.35■■□□□ 1.81
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.34■■□□□ 1.81
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LGR6Q9HBX8 967 aa26.34■■□□□ 1.81
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SPG7Q9UQ90 795 aa26.34■■□□□ 1.81
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.33■■□□□ 1.81
MIR9-3HG-202ENST00000538734 VAMP4O75379 141 aa26.32■■□□□ 1.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ADAMTS2O95450 1211 aa26.32■■□□□ 1.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TSPYL6Q8N831 410 aa26.32■■□□□ 1.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.32■■□□□ 1.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZNF428Q96B54 188 aa26.32■■□□□ 1.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.31■■□□□ 1.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.31■■□□□ 1.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.3■■□□□ 1.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.3■■□□□ 1.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.3■■□□□ 1.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.3■■□□□ 1.8
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.28■■□□□ 1.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.28■■□□□ 1.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.28■■□□□ 1.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 JCADQ9P266 1359 aa26.27■■□□□ 1.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PHKG2P15735 406 aa26.27■■□□□ 1.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.27■■□□□ 1.8
MIR9-3HG-202ENST00000538734 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
MIR9-3HG-202ENST00000538734 IL2RBP14784 551 aa26.26■■□□□ 1.79
MIR9-3HG-202ENST00000538734 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.26■■□□□ 1.79
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.26■■□□□ 1.79
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KRT24Q2M2I5 525 aa26.25■■□□□ 1.79
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CYP27B1O15528 508 aa26.24■■□□□ 1.79
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TEFQ10587 303 aa26.24■■□□□ 1.79
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.24■■□□□ 1.79
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PDE3AQ14432 1141 aa26.23■■□□□ 1.79
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CRBNQ96SW2 442 aa26.23■■□□□ 1.79
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.23■■□□□ 1.79
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
MIR9-3HG-202ENST00000538734 USP35Q9P2H5 1018 aa26.23■■□□□ 1.79
MIR9-3HG-202ENST00000538734 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.19■■□□□ 1.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DCAF5Q96JK2 942 aa26.19■■□□□ 1.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.18■■□□□ 1.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.18■■□□□ 1.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 BTBD11A6QL63 1104 aa26.18■■□□□ 1.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HSPA1LP34931 641 aa26.17■■□□□ 1.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NRAPQ86VF7 1730 aa26.17■■□□□ 1.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.17■■□□□ 1.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KIF16BQ96L93 1317 aa26.17■■□□□ 1.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SLIT2O94813 1529 aa26.16■■□□□ 1.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PANK1Q8TE04 598 aa26.16■■□□□ 1.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.16■■□□□ 1.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.16■■□□□ 1.78
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
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