RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536509.5

LMO3-214, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 550 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-214ENST00000536509 QSER1Q2KHR3 1735 aa15.67■□□□□ 0.1
LMO3-214ENST00000536509 SYT17Q9BSW7 474 aa15.66■□□□□ 0.1
LMO3-214ENST00000536509 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.65■□□□□ 0.1
LMO3-214ENST00000536509 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.65■□□□□ 0.1
LMO3-214ENST00000536509 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
LMO3-214ENST00000536509 MAP3K5Q99683 1374 aa15.64■□□□□ 0.09
LMO3-214ENST00000536509 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.64■□□□□ 0.09
LMO3-214ENST00000536509 COG3Q96JB2 828 aa15.63■□□□□ 0.09
LMO3-214ENST00000536509 ARXQ96QS3 562 aa15.62■□□□□ 0.09
LMO3-214ENST00000536509 COL24A1Q17RW2 1714 aa15.61■□□□□ 0.09
LMO3-214ENST00000536509 ABCB7O75027 752 aa15.61■□□□□ 0.09
LMO3-214ENST00000536509 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
LMO3-214ENST00000536509 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
LMO3-214ENST00000536509 LY75O60449 1722 aa15.6■□□□□ 0.09
LMO3-214ENST00000536509 AMPHP49418 695 aa15.6■□□□□ 0.09
LMO3-214ENST00000536509 TESK2Q96S53 571 aa15.6■□□□□ 0.09
LMO3-214ENST00000536509 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.6■□□□□ 0.09
LMO3-214ENST00000536509 CGNL1Q0VF96 1302 aa15.6■□□□□ 0.09
LMO3-214ENST00000536509 RTL1A6NKG5 1358 aa15.6■□□□□ 0.09
LMO3-214ENST00000536509 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa15.6■□□□□ 0.09
LMO3-214ENST00000536509 HOXC9P31274 260 aa15.59■□□□□ 0.09
LMO3-214ENST00000536509 AKT1S1Q96B36 256 aa15.59■□□□□ 0.09
LMO3-214ENST00000536509 MAP3K19Q56UN5 1328 aa15.59■□□□□ 0.09
LMO3-214ENST00000536509 DOT1LQ8TEK3 1739 aa15.59■□□□□ 0.09
LMO3-214ENST00000536509 RGPD2P0DJD1 1756 aa15.59■□□□□ 0.09
LMO3-214ENST00000536509 SHANK3Q9BYB0 1731 aa15.58■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.58■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 POLD1P28340 1107 aa15.58■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 ZNF827Q17R98 1081 aa15.58■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa15.56■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa15.56■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 KIF24Q5T7B8 1368 aa15.54■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.54■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.54■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 TMF1P82094 1093 aa15.54■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 CDCA8Q53HL2 280 aa15.54■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 MEGF6O75095 1541 aa15.53■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 KIF20BQ96Q89 1820 aa15.53■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa15.53■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 NSD2O96028 1365 aa15.52■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 USP47Q96K76 1375 aa15.52■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 FYB1O15117 783 aa15.52■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 GPR162Q16538 588 aa15.52■□□□□ 0.08
LMO3-214ENST00000536509 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
LMO3-214ENST00000536509 INSRP06213 1382 aa15.5■□□□□ 0.07
LMO3-214ENST00000536509 UTRNP46939 3433 aa15.5■□□□□ 0.07
LMO3-214ENST00000536509 TATP17735 454 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
LMO3-214ENST00000536509 NBPF6Q5VWK0 638 aa15.5■□□□□ 0.07
LMO3-214ENST00000536509 NBPF4Q96M43 638 aa15.5■□□□□ 0.07
LMO3-214ENST00000536509 FLT4P35916 1363 aa15.49■□□□□ 0.07
LMO3-214ENST00000536509 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa15.49■□□□□ 0.07
LMO3-214ENST00000536509 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa15.49■□□□□ 0.07
LMO3-214ENST00000536509 C5P01031 1676 aa15.49■□□□□ 0.07
LMO3-214ENST00000536509 FBLN1P23142 703 aa15.49■□□□□ 0.07
LMO3-214ENST00000536509 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
LMO3-214ENST00000536509 TAF1LQ8IZX4 1826 aa15.48■□□□□ 0.07
LMO3-214ENST00000536509 FLAD1Q8NFF5 587 aa15.48■□□□□ 0.07
LMO3-214ENST00000536509 GGNBP2Q9H3C7 697 aa15.48■□□□□ 0.07
LMO3-214ENST00000536509 DSG3P32926 999 aa15.47■□□□□ 0.07
LMO3-214ENST00000536509 KCNQ4P56696 695 aa15.47■□□□□ 0.07
LMO3-214ENST00000536509 KLHL34Q8N239 644 aa15.47■□□□□ 0.07
LMO3-214ENST00000536509 ITGB4P16144 1822 aa15.46■□□□□ 0.07
LMO3-214ENST00000536509 GRIN3BO60391 1043 aa15.46■□□□□ 0.07
LMO3-214ENST00000536509 C1QTNF8P60827 252 aa15.45■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa15.45■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 PKD1L3Q7Z443 1732 aa15.45■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 USHBP1Q8N6Y0 703 aa15.44■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 NSD3Q9BZ95 1437 aa15.43■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa15.43■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 PALLDQ8WX93 1383 aa15.42■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 CD2APQ9Y5K6 639 aa15.42■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 C4BP0C0L5 1744 aa15.41■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa15.41■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 NLGN2Q8NFZ4 835 aa15.41■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.41■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 NCAPD2Q15021 1401 aa15.41■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa15.4■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.4■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 CYP27B1O15528 508 aa15.4■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.4■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 SPG7Q9UQ90 795 aa15.4■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 UBR3Q6ZT12 1888 aa15.4■□□□□ 0.06
LMO3-214ENST00000536509 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa15.39■□□□□ 0.05
LMO3-214ENST00000536509 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
LMO3-214ENST00000536509 AK7Q96M32 723 aa15.38■□□□□ 0.05
LMO3-214ENST00000536509 CARD14Q9BXL6 1004 aa15.38■□□□□ 0.05
LMO3-214ENST00000536509 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms