RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536388.5

CD27-AS1-206, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CD27-AS1, Length 865 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-206ENST00000536388 AMOTQ4VCS5 1084 aa16.27■□□□□ 0.2
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CD27-AS1-206ENST00000536388 USP35Q9P2H5 1018 aa16.26■□□□□ 0.19
CD27-AS1-206ENST00000536388 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
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CD27-AS1-206ENST00000536388 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
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CD27-AS1-206ENST00000536388 LRRC37A3O60309 1634 aa16.22■□□□□ 0.19
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CD27-AS1-206ENST00000536388 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa16.2■□□□□ 0.18
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CD27-AS1-206ENST00000536388 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.19■□□□□ 0.18
CD27-AS1-206ENST00000536388 DDB1Q16531 1140 aa16.19■□□□□ 0.18
CD27-AS1-206ENST00000536388 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
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CD27-AS1-206ENST00000536388 APAF1O14727 1248 aa16.18■□□□□ 0.18
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CD27-AS1-206ENST00000536388 IFNL2Q8IZJ0 200 aa16.18■□□□□ 0.18
CD27-AS1-206ENST00000536388 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CD27-AS1-206ENST00000536388 C1orf141Q5JVX7 400 aa16.17■□□□□ 0.18
CD27-AS1-206ENST00000536388 MAP3K5Q99683 1374 aa16.16■□□□□ 0.18
CD27-AS1-206ENST00000536388 A0A0G2JS52 829 aa16.16■□□□□ 0.18
CD27-AS1-206ENST00000536388 MYT1Q01538 1121 aa16.16■□□□□ 0.18
CD27-AS1-206ENST00000536388 CCDC27Q2M243 656 aa16.16■□□□□ 0.18
CD27-AS1-206ENST00000536388 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
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CD27-AS1-206ENST00000536388 PHKG2P15735 406 aa16.15■□□□□ 0.18
CD27-AS1-206ENST00000536388 RIPK4P57078 832 aa16.15■□□□□ 0.18
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CD27-AS1-206ENST00000536388 SEPT12Q8IYM1 358 aa16.15■□□□□ 0.18
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CD27-AS1-206ENST00000536388 DCAF5Q96JK2 942 aa16.12■□□□□ 0.17
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CD27-AS1-206ENST00000536388 RGS12O14924 1447 aa16.11■□□□□ 0.17
CD27-AS1-206ENST00000536388 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CD27-AS1-206ENST00000536388 NEUROD2Q15784 382 aa16.11■□□□□ 0.17
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CD27-AS1-206ENST00000536388 ZBED9Q6R2W3 1325 aa16.1■□□□□ 0.17
CD27-AS1-206ENST00000536388 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa16.1■□□□□ 0.17
CD27-AS1-206ENST00000536388 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CD27-AS1-206ENST00000536388 TRIM35Q9UPQ4 493 aa16.09■□□□□ 0.17
CD27-AS1-206ENST00000536388 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CD27-AS1-206ENST00000536388 MRC1P22897 1456 aa16.09■□□□□ 0.17
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CD27-AS1-206ENST00000536388 WDR63Q8IWG1 891 aa16.08■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 WWC1Q8IX03 1113 aa16.08■□□□□ 0.16
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CD27-AS1-206ENST00000536388 ERVV-2B6SEH9 535 aa16.07■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa16.07■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 IL16Q14005 1332 aa16.07■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 ZNF521Q96K83 1311 aa16.07■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 DOT1LQ8TEK3 1739 aa16.07■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa16.07■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 ITGB4P16144 1822 aa16.06■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 IL17REQ8NFR9 667 aa16.06■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 TEFQ10587 303 aa16.05■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 MCM10Q7L590 875 aa16.05■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 BABAM1Q9NWV8 329 aa16.05■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 SBF2Q86WG5 1849 aa16.05■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 FAM196AQ6ZSG2 479 aa16.04■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 SLC52A2Q9HAB3 445 aa16.04■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 LGR6Q9HBX8 967 aa16.04■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 NHSQ6T4R5 1651 aa16.04■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 CABP4P57796 275 aa16.03■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 GNAI1P63096 354 aa16.03■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 GOLGA2Q08379 1002 aa16.03■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 DCTN1Q14203 1278 aa16.03■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CD27-AS1-206ENST00000536388 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
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