RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MADDQ8WXG6 1647 aa7.85□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IFT172Q9UG01 1749 aa7.85□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UGGT1Q9NYU2 1555 aa7.85□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa7.85□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RCCD1A6NED2 376 aa7.85□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZMYND10O75800 440 aa7.85□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.85□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADAMTSL3P82987 1691 aa7.85□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa7.84□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADGRB3O60242 1522 aa7.84□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IRF6O14896 467 aa7.83□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNF40O75150 1001 aa7.83□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BARGINQ6ZT62 677 aa7.83□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.83□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa7.83□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa7.83□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC102AQ96A19 550 aa7.83□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.83□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NLRP1Q9C000 1473 aa7.82□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC4A3P48751 1232 aa7.82□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NBPF8Q3BBV2 869 aa7.82□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLF2Q8IX21 1173 aa7.82□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CARD11Q9BXL7 1154 aa7.82□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa7.82□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRAG1Q86YV5 1406 aa7.82□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.81□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYOM2P54296 1465 aa7.81□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RALGAPBQ86X10 1494 aa7.81□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UBR1Q8IWV7 1749 aa7.81□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRR20EP86478 221 aa7.81□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRR20CP86479 221 aa7.81□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRR20DP86480 221 aa7.81□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRR20BP86481 221 aa7.81□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRR20AP86496 221 aa7.81□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EID1Q9Y6B2 187 aa7.81□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NECTIN2Q92692 538 aa7.8□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PHOX2BQ99453 314 aa7.8□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LAMC1P11047 1609 aa7.79□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa7.79□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYO3AQ8NEV4 1616 aa7.79□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa7.79□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RIMS2Q9UQ26 1411 aa7.78□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM187AA6NFU0 413 aa7.78□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NLRP7Q8WX94 980 aa7.78□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF516Q92618 1163 aa7.78□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A2ML1A8K2U0 1454 aa7.78□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZFYVE9O95405 1425 aa7.78□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa7.77□□□□□ -1.16
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTPRMP28827 1452 aa7.77□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.77□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC19A1P41440 591 aa7.77□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP47Q96K76 1375 aa7.77□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.76□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NRXN1Q9ULB1 1477 aa7.76□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa7.75□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.75□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.75□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPRASP1Q5JY77 1395 aa7.75□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PIK3C2GO75747 1445 aa7.75□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM2Q9UHN6 1383 aa7.74□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IQGAP1P46940 1657 aa7.74□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANKLE2Q86XL3 938 aa7.74□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AAASQ9NRG9 546 aa7.74□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa7.73□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDCA8Q53HL2 280 aa7.73□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SULF1Q8IWU6 871 aa7.73□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.73□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AK7Q96M32 723 aa7.73□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARID3AQ99856 593 aa7.73□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POLR3GLQ9BT43 218 aa7.73□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ALKQ9UM73 1620 aa7.72□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLIT1O75093 1534 aa7.72□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.72□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC10A3P09131 477 aa7.72□□□□□ -1.17
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CLCN1P35523 988 aa7.72□□□□□ -1.17
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