RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534967.1

GOLGA3-204, Transcript of golgin A3, humanhuman

TSL 3

Gene GOLGA3, Length 484 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3-204ENST00000534967 GPR162Q16538 588 aa37.2■■■■□ 3.55
GOLGA3-204ENST00000534967 POLD1P28340 1107 aa37.19■■■■□ 3.54
GOLGA3-204ENST00000534967 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa37.19■■■■□ 3.54
GOLGA3-204ENST00000534967 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa37.18■■■■□ 3.54
GOLGA3-204ENST00000534967 RGPD2P0DJD1 1756 aa37.18■■■■□ 3.54
GOLGA3-204ENST00000534967 NSD2O96028 1365 aa37.17■■■■□ 3.54
GOLGA3-204ENST00000534967 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa37.17■■■■□ 3.54
GOLGA3-204ENST00000534967 SHANK3Q9BYB0 1731 aa37.16■■■■□ 3.54
GOLGA3-204ENST00000534967 MEGF6O75095 1541 aa37.16■■■■□ 3.54
GOLGA3-204ENST00000534967 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
GOLGA3-204ENST00000534967 COL24A1Q17RW2 1714 aa37.15■■■■□ 3.54
GOLGA3-204ENST00000534967 LY75O60449 1722 aa37.13■■■■□ 3.54
GOLGA3-204ENST00000534967 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
GOLGA3-204ENST00000534967 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
GOLGA3-204ENST00000534967 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
GOLGA3-204ENST00000534967 RTL1A6NKG5 1358 aa37.08■■■■□ 3.53
GOLGA3-204ENST00000534967 NBPF6Q5VWK0 638 aa37.08■■■■□ 3.53
GOLGA3-204ENST00000534967 NBPF4Q96M43 638 aa37.08■■■■□ 3.53
GOLGA3-204ENST00000534967 C1QTNF8P60827 252 aa37.07■■■■□ 3.52
GOLGA3-204ENST00000534967 USHBP1Q8N6Y0 703 aa37.07■■■■□ 3.52
GOLGA3-204ENST00000534967 NLGN2Q8NFZ4 835 aa37.07■■■■□ 3.52
GOLGA3-204ENST00000534967 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa37.05■■■■□ 3.52
GOLGA3-204ENST00000534967 GGNBP2Q9H3C7 697 aa37.04■■■■□ 3.52
GOLGA3-204ENST00000534967 USP47Q96K76 1375 aa37.04■■■■□ 3.52
GOLGA3-204ENST00000534967 SLC24A1O60721 1099 aa37.03■■■■□ 3.52
GOLGA3-204ENST00000534967 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
GOLGA3-204ENST00000534967 MSH5O43196 834 aa37.02■■■■□ 3.52
GOLGA3-204ENST00000534967 FYB1O15117 783 aa37.01■■■■□ 3.52
GOLGA3-204ENST00000534967 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
GOLGA3-204ENST00000534967 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa37■■■■□ 3.51
GOLGA3-204ENST00000534967 CGNL1Q0VF96 1302 aa36.99■■■■□ 3.51
GOLGA3-204ENST00000534967 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
GOLGA3-204ENST00000534967 TATP17735 454 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
GOLGA3-204ENST00000534967 MSL1Q68DK7 614 aa36.95■■■■□ 3.51
GOLGA3-204ENST00000534967 TMF1P82094 1093 aa36.93■■■■□ 3.5
GOLGA3-204ENST00000534967 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa36.93■■■■□ 3.5
GOLGA3-204ENST00000534967 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP36.92■■■■□ 3.5
GOLGA3-204ENST00000534967 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
GOLGA3-204ENST00000534967 INSRP06213 1382 aa36.91■■■■□ 3.5
GOLGA3-204ENST00000534967 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa36.9■■■■□ 3.5
GOLGA3-204ENST00000534967 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa36.9■■■■□ 3.5
GOLGA3-204ENST00000534967 C5P01031 1676 aa36.9■■■■□ 3.5
GOLGA3-204ENST00000534967 PALLDQ8WX93 1383 aa36.88■■■■□ 3.49
GOLGA3-204ENST00000534967 FLT4P35916 1363 aa36.87■■■■□ 3.49
GOLGA3-204ENST00000534967 KIF20BQ96Q89 1820 aa36.87■■■■□ 3.49
GOLGA3-204ENST00000534967 GRIN3BO60391 1043 aa36.86■■■■□ 3.49
GOLGA3-204ENST00000534967 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa36.86■■■■□ 3.49
GOLGA3-204ENST00000534967 CYP27B1O15528 508 aa36.84■■■■□ 3.49
GOLGA3-204ENST00000534967 TAF1LQ8IZX4 1826 aa36.82■■■■□ 3.49
GOLGA3-204ENST00000534967 KIF24Q5T7B8 1368 aa36.81■■■■□ 3.48
GOLGA3-204ENST00000534967 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa36.8■■■■□ 3.48
GOLGA3-204ENST00000534967 FLAD1Q8NFF5 587 aa36.8■■■■□ 3.48
GOLGA3-204ENST00000534967 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa36.79■■■■□ 3.48
GOLGA3-204ENST00000534967 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
GOLGA3-204ENST00000534967 CD2APQ9Y5K6 639 aa36.77■■■■□ 3.48
GOLGA3-204ENST00000534967 ITGB4P16144 1822 aa36.77■■■■□ 3.48
GOLGA3-204ENST00000534967 C4BP0C0L5 1744 aa36.76■■■■□ 3.48
GOLGA3-204ENST00000534967 CDCA8Q53HL2 280 aa36.76■■■■□ 3.48
GOLGA3-204ENST00000534967 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
GOLGA3-204ENST00000534967 AK7Q96M32 723 aa36.75■■■■□ 3.47
GOLGA3-204ENST00000534967 CARD14Q9BXL6 1004 aa36.75■■■■□ 3.47
GOLGA3-204ENST00000534967 PKD1L3Q7Z443 1732 aa36.74■■■■□ 3.47
GOLGA3-204ENST00000534967 AMIGO3Q86WK7 504 aa36.74■■■■□ 3.47
GOLGA3-204ENST00000534967 PIGBQ92521 554 aa36.72■■■■□ 3.47
GOLGA3-204ENST00000534967 NSD3Q9BZ95 1437 aa36.72■■■■□ 3.47
GOLGA3-204ENST00000534967 SMIM5Q71RC9 77 aa36.71■■■■□ 3.47
GOLGA3-204ENST00000534967 ATP10DQ9P241 1426 aa36.7■■■■□ 3.47
GOLGA3-204ENST00000534967 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
GOLGA3-204ENST00000534967 PHF14O94880 888 aa36.7■■■■□ 3.47
GOLGA3-204ENST00000534967 NCAPD2Q15021 1401 aa36.68■■■■□ 3.46
GOLGA3-204ENST00000534967 UBR3Q6ZT12 1888 aa36.67■■■■□ 3.46
GOLGA3-204ENST00000534967 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
GOLGA3-204ENST00000534967 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
GOLGA3-204ENST00000534967 SPG7Q9UQ90 795 aa36.66■■■■□ 3.46
GOLGA3-204ENST00000534967 LINC00116Q8NCU8 138 aa36.63■■■■□ 3.45
GOLGA3-204ENST00000534967 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
GOLGA3-204ENST00000534967 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa36.62■■■■□ 3.45
GOLGA3-204ENST00000534967 SIK1P57059 783 aa36.62■■■■□ 3.45
GOLGA3-204ENST00000534967 WWC3Q9ULE0 1092 aa36.62■■■■□ 3.45
GOLGA3-204ENST00000534967 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa36.62■■■■□ 3.45
GOLGA3-204ENST00000534967 EYA1Q99502 592 aa36.61■■■■□ 3.45
GOLGA3-204ENST00000534967 WASHC2AQ641Q2 1341 aa36.6■■■■□ 3.45
GOLGA3-204ENST00000534967 IGSF1Q8N6C5 1336 aa36.6■■■■□ 3.45
GOLGA3-204ENST00000534967 CEP350Q5VT06 3117 aa36.6■■■■□ 3.45
GOLGA3-204ENST00000534967 SSFA2P28290 1259 aa36.6■■■■□ 3.45
GOLGA3-204ENST00000534967 TMOD3Q9NYL9 352 aa36.59■■■■□ 3.45
GOLGA3-204ENST00000534967 ADCY9O60503 1353 aa36.58■■■■□ 3.45
GOLGA3-204ENST00000534967 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
GOLGA3-204ENST00000534967 ASAP1Q9ULH1 1129 aa36.58■■■■□ 3.45
GOLGA3-204ENST00000534967 ITPK1Q13572 414 aa36.56■■■■□ 3.44
GOLGA3-204ENST00000534967 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
GOLGA3-204ENST00000534967 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP36.56■■■■□ 3.44
GOLGA3-204ENST00000534967 PHKG2P15735 406 aa36.54■■■■□ 3.44
GOLGA3-204ENST00000534967 GNPATO15228 680 aa36.53■■■■□ 3.44
GOLGA3-204ENST00000534967 ATP6V1AP38606 617 aa36.53■■■■□ 3.44
GOLGA3-204ENST00000534967 IFNL2Q8IZJ0 200 aa36.53■■■■□ 3.44
GOLGA3-204ENST00000534967 POLKQ9UBT6 870 aa36.53■■■■□ 3.44
GOLGA3-204ENST00000534967 ATG3Q9NT62 314 aa36.49■■■■□ 3.43
GOLGA3-204ENST00000534967 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
GOLGA3-204ENST00000534967 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.4 ms