RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532389.5

SERGEF-220, Transcript of secretion regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 5

Gene SERGEF, Length 833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEF-220ENST00000532389 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
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SERGEF-220ENST00000532389 SLC15A2Q16348 729 aa28.95■■■□□ 2.22
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SERGEF-220ENST00000532389 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.94■■■□□ 2.22
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SERGEF-220ENST00000532389 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.87■■■□□ 2.21
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SERGEF-220ENST00000532389 ZNF827Q17R98 1081 aa28.76■■■□□ 2.19
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SERGEF-220ENST00000532389 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.191e-6■■□□□ 12.3
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SERGEF-220ENST00000532389 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.72■■■□□ 2.19
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SERGEF-220ENST00000532389 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
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SERGEF-220ENST00000532389 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.69■■■□□ 2.18
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SERGEF-220ENST00000532389 C5P01031 1676 aa28.54■■■□□ 2.16
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SERGEF-220ENST00000532389 MTHFSP49914 203 aa28.48■■■□□ 2.15
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SERGEF-220ENST00000532389 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
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SERGEF-220ENST00000532389 C4BP0C0L5 1744 aa28.46■■■□□ 2.15
SERGEF-220ENST00000532389 ATG3Q9NT62 314 aa28.45■■■□□ 2.14
SERGEF-220ENST00000532389 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.44■■■□□ 2.14
SERGEF-220ENST00000532389 KDRP35968 1356 aa28.44■■■□□ 2.14
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