RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
PTPRU-211ENST00000531385 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PTPRU-211ENST00000531385 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PTPRU-211ENST00000531385 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRU-211ENST00000531385 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
PTPRU-211ENST00000531385 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PTPRU-211ENST00000531385 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRU-211ENST00000531385 EYA1Q99502 592 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRU-211ENST00000531385 NCAPD2Q15021 1401 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRU-211ENST00000531385 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRU-211ENST00000531385 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRU-211ENST00000531385 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
PTPRU-211ENST00000531385 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
PTPRU-211ENST00000531385 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRU-211ENST00000531385 BTAF1O14981 1849 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRU-211ENST00000531385 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRU-211ENST00000531385 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PTPRU-211ENST00000531385 PLSCR1O15162 318 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRU-211ENST00000531385 PROM2Q8N271 834 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRU-211ENST00000531385 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRU-211ENST00000531385 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PTPRU-211ENST00000531385 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRU-211ENST00000531385 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRU-211ENST00000531385 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRU-211ENST00000531385 CYP27B1O15528 508 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRU-211ENST00000531385 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PTPRU-211ENST00000531385 MTHFSP49914 203 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRU-211ENST00000531385 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRU-211ENST00000531385 TXNRD1Q16881 649 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRU-211ENST00000531385 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRU-211ENST00000531385 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PTPRU-211ENST00000531385 IL13P35225 146 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRU-211ENST00000531385 NBPF14Q5TI25 921 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRU-211ENST00000531385 SPG7Q9UQ90 795 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRU-211ENST00000531385 ITGB4P16144 1822 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRU-211ENST00000531385 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRU-211ENST00000531385 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PTPRU-211ENST00000531385 PAPPAQ13219 1627 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRU-211ENST00000531385 KCNQ4P56696 695 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRU-211ENST00000531385 PHKG2P15735 406 aa25.37■■□□□ 1.65
PTPRU-211ENST00000531385 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.37■■□□□ 1.65
PTPRU-211ENST00000531385 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
PTPRU-211ENST00000531385 LY75O60449 1722 aa25.37■■□□□ 1.65
PTPRU-211ENST00000531385 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRU-211ENST00000531385 KDRP35968 1356 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRU-211ENST00000531385 LRP5O75197 1615 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRU-211ENST00000531385 HMOX1P09601 288 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRU-211ENST00000531385 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PTPRU-211ENST00000531385 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PTPRU-211ENST00000531385 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRU-211ENST00000531385 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
PTPRU-211ENST00000531385 CASZ1Q86V15 1759 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRU-211ENST00000531385 STK32BQ9NY57 414 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRU-211ENST00000531385 PPP2R1AP30153 589 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF827Q17R98 1081 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRU-211ENST00000531385 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PTPRU-211ENST00000531385 PIGBQ92521 554 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRU-211ENST00000531385 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRU-211ENST00000531385 SLC15A2Q16348 729 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRU-211ENST00000531385 PALLDQ8WX93 1383 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRU-211ENST00000531385 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PTPRU-211ENST00000531385 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PTPRU-211ENST00000531385 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PTPRU-211ENST00000531385 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PTPRU-211ENST00000531385 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRU-211ENST00000531385 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRU-211ENST00000531385 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRU-211ENST00000531385 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRU-211ENST00000531385 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRU-211ENST00000531385 C5P01031 1676 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRU-211ENST00000531385 CFAP53Q96M91 514 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRU-211ENST00000531385 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRU-211ENST00000531385 ZBTB7AO95365 584 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRU-211ENST00000531385 AKT1S1Q96B36 256 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRU-211ENST00000531385 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRU-211ENST00000531385 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRU-211ENST00000531385 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRU-211ENST00000531385 DCAF5Q96JK2 942 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRU-211ENST00000531385 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRU-211ENST00000531385 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPRU-211ENST00000531385 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPRU-211ENST00000531385 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPRU-211ENST00000531385 ATG3Q9NT62 314 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRU-211ENST00000531385 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRU-211ENST00000531385 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRU-211ENST00000531385 CABP4P57796 275 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRU-211ENST00000531385 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRU-211ENST00000531385 SPON1Q9HCB6 807 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRU-211ENST00000531385 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRU-211ENST00000531385 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRU-211ENST00000531385 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRU-211ENST00000531385 LGR6Q9HBX8 967 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRU-211ENST00000531385 C4BP0C0L5 1744 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRU-211ENST00000531385 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRU-211ENST00000531385 PRKAR2BP31323 418 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRU-211ENST00000531385 SIK1P57059 783 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRU-211ENST00000531385 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRU-211ENST00000531385 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PTPRU-211ENST00000531385 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms