RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530520.5

ME3-209, Transcript of malic enzyme 3, human

TSL 5

Gene ME3, Length 1,573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ME3-209	ENST00000530520	DISP2	A7MBM2	1401 aa		32.72	■■■□□ 2.83
ME3-209	ENST00000530520	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		32.72	■■■□□ 2.83
ME3-209	ENST00000530520	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		32.71	■■■□□ 2.83
ME3-209	ENST00000530520	APAF1	O14727	1248 aa		32.71	■■■□□ 2.83
ME3-209	ENST00000530520	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		32.71	■■■□□ 2.83
ME3-209	ENST00000530520	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		32.71	■■■□□ 2.83
ME3-209	ENST00000530520	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
ME3-209	ENST00000530520	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
ME3-209	ENST00000530520	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		32.69	■■■□□ 2.82
ME3-209	ENST00000530520	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
ME3-209	ENST00000530520	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		32.69	■■■□□ 2.82
ME3-209	ENST00000530520	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	32.67	■■■□□ 2.82
ME3-209	ENST00000530520	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
ME3-209	ENST00000530520	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		32.67	■■■□□ 2.82
ME3-209	ENST00000530520	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
ME3-209	ENST00000530520	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
ME3-209	ENST00000530520	NEUROD2	Q15784	382 aa		32.66	■■■□□ 2.82
ME3-209	ENST00000530520	SPG7	Q9UQ90	795 aa		32.66	■■■□□ 2.82
ME3-209	ENST00000530520	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
ME3-209	ENST00000530520	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.66	■■■□□ 2.82
ME3-209	ENST00000530520	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	32.65	■■■□□ 2.82
ME3-209	ENST00000530520	LRRC37A3	O60309	1634 aa		32.64	■■■□□ 2.82
ME3-209	ENST00000530520		A0A0G2JS52	829 aa		32.64	■■■□□ 2.82
ME3-209	ENST00000530520	MYT1	Q01538	1121 aa		32.64	■■■□□ 2.82
ME3-209	ENST00000530520	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
ME3-209	ENST00000530520	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
ME3-209	ENST00000530520	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		32.64	■■■□□ 2.82
ME3-209	ENST00000530520	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
ME3-209	ENST00000530520	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		32.63	■■■□□ 2.81
ME3-209	ENST00000530520	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
ME3-209	ENST00000530520	RIPK4	P57078	832 aa		32.61	■■■□□ 2.81
ME3-209	ENST00000530520	TNS2	Q63HR2	1409 aa		32.6	■■■□□ 2.81
ME3-209	ENST00000530520	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		32.59	■■■□□ 2.81
ME3-209	ENST00000530520	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		32.59	■■■□□ 2.81
ME3-209	ENST00000530520	EXOC5	O00471	708 aa		32.59	■■■□□ 2.81
ME3-209	ENST00000530520	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
ME3-209	ENST00000530520	DDB1	Q16531	1140 aa		32.59	■■■□□ 2.81
ME3-209	ENST00000530520	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		32.59	■■■□□ 2.81
ME3-209	ENST00000530520	MAP3K5	Q99683	1374 aa		32.57	■■■□□ 2.8
ME3-209	ENST00000530520	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		32.56	■■■□□ 2.8
ME3-209	ENST00000530520	NGEF	Q8N5V2	710 aa		32.56	■■■□□ 2.8
ME3-209	ENST00000530520	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		32.55	■■■□□ 2.8
ME3-209	ENST00000530520	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.55	■■■□□ 2.8
ME3-209	ENST00000530520	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
ME3-209	ENST00000530520	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
ME3-209	ENST00000530520	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.54	■■■□□ 2.8
ME3-209	ENST00000530520	CYP27B1	O15528	508 aa		32.53	■■■□□ 2.8
ME3-209	ENST00000530520	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
ME3-209	ENST00000530520	PHKG2	P15735	406 aa		32.53	■■■□□ 2.8
ME3-209	ENST00000530520	RXRB	P28702	533 aa		32.53	■■■□□ 2.8
ME3-209	ENST00000530520	POTEA	Q6S8J7	498 aa		32.53	■■■□□ 2.8
ME3-209	ENST00000530520	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
ME3-209	ENST00000530520	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
ME3-209	ENST00000530520	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		32.51	■■■□□ 2.79
ME3-209	ENST00000530520	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		32.51	■■■□□ 2.79
ME3-209	ENST00000530520	CCDC27	Q2M243	656 aa		32.5	■■■□□ 2.79
ME3-209	ENST00000530520	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
ME3-209	ENST00000530520	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
ME3-209	ENST00000530520	PDE3B	Q13370	1112 aa		32.48	■■■□□ 2.79
ME3-209	ENST00000530520	WWC1	Q8IX03	1113 aa		32.48	■■■□□ 2.79
ME3-209	ENST00000530520	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		32.48	■■■□□ 2.79
ME3-209	ENST00000530520	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		32.48	■■■□□ 2.79
ME3-209	ENST00000530520	DCTN1	Q14203	1278 aa		32.47	■■■□□ 2.79
ME3-209	ENST00000530520	MCM10	Q7L590	875 aa		32.47	■■■□□ 2.79
ME3-209	ENST00000530520	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		32.46	■■■□□ 2.79
ME3-209	ENST00000530520	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.46	■■■□□ 2.79
ME3-209	ENST00000530520	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.78
ME3-209	ENST00000530520	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		32.44	■■■□□ 2.78
ME3-209	ENST00000530520	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
ME3-209	ENST00000530520	DCAF5	Q96JK2	942 aa		32.43	■■■□□ 2.78
ME3-209	ENST00000530520	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
ME3-209	ENST00000530520	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
ME3-209	ENST00000530520	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
ME3-209	ENST00000530520	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		32.41	■■■□□ 2.78
ME3-209	ENST00000530520	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.41	■■■□□ 2.78
ME3-209	ENST00000530520	ZNF521	Q96K83	1311 aa		32.41	■■■□□ 2.78
ME3-209	ENST00000530520	RGS12	O14924	1447 aa		32.41	■■■□□ 2.78
ME3-209	ENST00000530520	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		32.39	■■■□□ 2.78
ME3-209	ENST00000530520	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		32.39	■■■□□ 2.78
ME3-209	ENST00000530520	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		32.38	■■■□□ 2.77
ME3-209	ENST00000530520	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
ME3-209	ENST00000530520	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		32.38	■■■□□ 2.77
ME3-209	ENST00000530520	WDR63	Q8IWG1	891 aa		32.37	■■■□□ 2.77
ME3-209	ENST00000530520	TEF	Q10587	303 aa		32.36	■■■□□ 2.77
ME3-209	ENST00000530520	GOLGA2	Q08379	1002 aa		32.35	■■■□□ 2.77
ME3-209	ENST00000530520	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		32.35	■■■□□ 2.77
ME3-209	ENST00000530520	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
ME3-209	ENST00000530520	MRC1	P22897	1456 aa		32.33	■■■□□ 2.77
ME3-209	ENST00000530520	ITGB4	P16144	1822 aa		32.33	■■■□□ 2.77
ME3-209	ENST00000530520	FAM182B	Q5T319	152 aa		32.32	■■■□□ 2.77
ME3-209	ENST00000530520	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
ME3-209	ENST00000530520	IL16	Q14005	1332 aa		32.31	■■■□□ 2.76
ME3-209	ENST00000530520	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		32.31	■■■□□ 2.76
ME3-209	ENST00000530520	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.3	■■■□□ 2.76
ME3-209	ENST00000530520	CABP4	P57796	275 aa		32.3	■■■□□ 2.76
ME3-209	ENST00000530520	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ME3-209	ENST00000530520	IFT57	Q9NWB7	429 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ME3-209	ENST00000530520	GNAI1	P63096	354 aa		32.27	■■■□□ 2.76
ME3-209	ENST00000530520	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
ME3-209	ENST00000530520	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.27	■■■□□ 2.76

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