RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529218.5

NELL1-208, Transcript of neural EGFL like 1, human

TSL 2

Gene NELL1, Length 1,907 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NELL1-208	ENST00000529218	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		13.96	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		13.96	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		13.96	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		13.96	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	VAMP4	O75379	141 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	CHRNA2	Q15822	529 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	BRINP3	Q76B58	766 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	ALS2	Q96Q42	1657 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	CRB1	P82279	1406 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	IGHD	P01880	384 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	KIF16B	Q96L93	1317 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	RGPD5	Q99666	1765 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	PXDN	Q92626	1479 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	MAP3K5	Q99683	1374 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	CHL1	O00533	1208 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	RGS3	P49796	1198 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	SLAIN2	Q9P270	581 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	NECTIN2	Q92692	538 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NELL1-208	ENST00000529218	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NELL1-208	ENST00000529218	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
NELL1-208	ENST00000529218	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
NELL1-208	ENST00000529218	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NELL1-208	ENST00000529218	KIAA0232	Q92628	1395 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NELL1-208	ENST00000529218	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NELL1-208	ENST00000529218	LGR6	Q9HBX8	967 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NELL1-208	ENST00000529218	MS4A1	P11836	297 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NELL1-208	ENST00000529218	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NELL1-208	ENST00000529218	ERBB3	P21860	1342 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NELL1-208	ENST00000529218	LRRC37A3	O60309	1634 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NELL1-208	ENST00000529218	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NELL1-208	ENST00000529218	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
NELL1-208	ENST00000529218	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		13.84	□□□□□ -0.19
NELL1-208	ENST00000529218	ZNF428	Q96B54	188 aa		13.84	□□□□□ -0.19
NELL1-208	ENST00000529218	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	SLC4A2	P04920	1241 aa		13.83	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		13.83	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		13.83	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	KCNQ3	O43525	872 aa		13.82	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	G2E3	Q7L622	706 aa		13.82	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		13.82	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	TEF	Q10587	303 aa		13.82	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	MEGF6	O75095	1541 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	COL18A1	P39060	1754 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	ABCC4	O15439	1325 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218		F6X3S4	739 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	PDE4A	P27815	886 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	STRN4	Q9NRL3	753 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	BTBD11	A6QL63	1104 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	NCAPD2	Q15021	1401 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	STK31	Q9BXU1	1019 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	RGS12	O14924	1447 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NELL1-208	ENST00000529218	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NELL1-208	ENST00000529218	ANXA1	P04083	346 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NELL1-208	ENST00000529218	AAMP	Q13685	434 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NELL1-208	ENST00000529218	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NELL1-208	ENST00000529218	USP35	Q9P2H5	1018 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NELL1-208	ENST00000529218	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NELL1-208	ENST00000529218	ABCA3	Q99758	1704 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NELL1-208	ENST00000529218	CPD	O75976	1380 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NELL1-208	ENST00000529218	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NELL1-208	ENST00000529218	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NELL1-208	ENST00000529218	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21

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