RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527118.5

RBBP4-218, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 3

Gene RBBP4, Length 700 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-218ENST00000527118 INSRP06213 1382 aa21.61■■□□□ 1.05
RBBP4-218ENST00000527118 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.6■■□□□ 1.05
RBBP4-218ENST00000527118 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.59■■□□□ 1.05
RBBP4-218ENST00000527118 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
RBBP4-218ENST00000527118 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.58■■□□□ 1.04
RBBP4-218ENST00000527118 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
RBBP4-218ENST00000527118 PAPPAQ13219 1627 aa21.55■■□□□ 1.04
RBBP4-218ENST00000527118 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.55■■□□□ 1.04
RBBP4-218ENST00000527118 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
RBBP4-218ENST00000527118 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
RBBP4-218ENST00000527118 PANK3Q9H999 370 aa21.54■■□□□ 1.04
RBBP4-218ENST00000527118 STK32BQ9NY57 414 aa21.54■■□□□ 1.04
RBBP4-218ENST00000527118 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
RBBP4-218ENST00000527118 SPON1Q9HCB6 807 aa21.53■■□□□ 1.04
RBBP4-218ENST00000527118 LY75O60449 1722 aa21.52■■□□□ 1.04
RBBP4-218ENST00000527118 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
RBBP4-218ENST00000527118 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
RBBP4-218ENST00000527118 SLC15A2Q16348 729 aa21.52■■□□□ 1.04
RBBP4-218ENST00000527118 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.51■■□□□ 1.03
RBBP4-218ENST00000527118 POLKQ9UBT6 870 aa21.5■■□□□ 1.03
RBBP4-218ENST00000527118 NSD2O96028 1365 aa21.49■■□□□ 1.03
RBBP4-218ENST00000527118 ZBTB7AO95365 584 aa21.49■■□□□ 1.03
RBBP4-218ENST00000527118 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.49■■□□□ 1.03
RBBP4-218ENST00000527118 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.49■■□□□ 1.03
RBBP4-218ENST00000527118 ITGB4P16144 1822 aa21.48■■□□□ 1.03
RBBP4-218ENST00000527118 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
RBBP4-218ENST00000527118 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.48■■□□□ 1.03
RBBP4-218ENST00000527118 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.47■■□□□ 1.03
RBBP4-218ENST00000527118 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.47■■□□□ 1.03
RBBP4-218ENST00000527118 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.47■■□□□ 1.03
RBBP4-218ENST00000527118 NCAPD2Q15021 1401 aa21.46■■□□□ 1.03
RBBP4-218ENST00000527118 ZNF827Q17R98 1081 aa21.46■■□□□ 1.03
RBBP4-218ENST00000527118 KCNQ4P56696 695 aa21.45■■□□□ 1.02
RBBP4-218ENST00000527118 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
RBBP4-218ENST00000527118 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.45■■□□□ 1.02
RBBP4-218ENST00000527118 EYA1Q99502 592 aa21.44■■□□□ 1.02
RBBP4-218ENST00000527118 CYP27B1O15528 508 aa21.43■■□□□ 1.02
RBBP4-218ENST00000527118 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.43■■□□□ 1.02
RBBP4-218ENST00000527118 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
RBBP4-218ENST00000527118 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.42■■□□□ 1.02
RBBP4-218ENST00000527118 PTGER2P43116 358 aa21.4■■□□□ 1.02
RBBP4-218ENST00000527118 AKT1S1Q96B36 256 aa21.4■■□□□ 1.02
RBBP4-218ENST00000527118 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.39■■□□□ 1.02
RBBP4-218ENST00000527118 MORC1Q86VD1 984 aa21.39■■□□□ 1.01
RBBP4-218ENST00000527118 MTFR1LQ9H019 292 aa21.39■■□□□ 1.01
RBBP4-218ENST00000527118 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.39■■□□□ 1.01
RBBP4-218ENST00000527118 C5P01031 1676 aa21.39■■□□□ 1.01
RBBP4-218ENST00000527118 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.38■■□□□ 1.01
RBBP4-218ENST00000527118 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
RBBP4-218ENST00000527118 SPG7Q9UQ90 795 aa21.38■■□□□ 1.01
RBBP4-218ENST00000527118 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.35■■□□□ 1.01
RBBP4-218ENST00000527118 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.34■■□□□ 1.01
RBBP4-218ENST00000527118 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.34■■□□□ 1.01
RBBP4-218ENST00000527118 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.34■■□□□ 1.01
RBBP4-218ENST00000527118 PALLDQ8WX93 1383 aa21.34■■□□□ 1.01
RBBP4-218ENST00000527118 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
RBBP4-218ENST00000527118 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
RBBP4-218ENST00000527118 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.014e-9■■■□□ 15.7
RBBP4-218ENST00000527118 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.32■■□□□ 1
RBBP4-218ENST00000527118 PHKG2P15735 406 aa21.31■■□□□ 1
RBBP4-218ENST00000527118 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.31■■□□□ 1
RBBP4-218ENST00000527118 PIGBQ92521 554 aa21.3■■□□□ 1
RBBP4-218ENST00000527118 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
RBBP4-218ENST00000527118 C4BP0C0L5 1744 aa21.29■■□□□ 1
RBBP4-218ENST00000527118 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.28■■□□□ 1
RBBP4-218ENST00000527118 ARXQ96QS3 562 aa21.28■■□□□ 1
RBBP4-218ENST00000527118 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
RBBP4-218ENST00000527118 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.27■■□□□ 1
RBBP4-218ENST00000527118 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
RBBP4-218ENST00000527118 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.27■■□□□ 1
RBBP4-218ENST00000527118 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
RBBP4-218ENST00000527118 MSH5O43196 834 aa21.26■□□□□ 0.99
RBBP4-218ENST00000527118 SYT17Q9BSW7 474 aa21.26■□□□□ 0.99
RBBP4-218ENST00000527118 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.26■□□□□ 0.99
RBBP4-218ENST00000527118 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.25■□□□□ 0.99
RBBP4-218ENST00000527118 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.25■□□□□ 0.99
RBBP4-218ENST00000527118 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
RBBP4-218ENST00000527118 IL13P35225 146 aa21.24■□□□□ 0.99
RBBP4-218ENST00000527118 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
RBBP4-218ENST00000527118 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
RBBP4-218ENST00000527118 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.24■□□□□ 0.99
RBBP4-218ENST00000527118 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.24■□□□□ 0.99
RBBP4-218ENST00000527118 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
RBBP4-218ENST00000527118 POLD1P28340 1107 aa21.23■□□□□ 0.99
RBBP4-218ENST00000527118 MTHFSP49914 203 aa21.23■□□□□ 0.99
RBBP4-218ENST00000527118 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
RBBP4-218ENST00000527118 KLHL34Q8N239 644 aa21.22■□□□□ 0.99
RBBP4-218ENST00000527118 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.21■□□□□ 0.99
RBBP4-218ENST00000527118 SIK1P57059 783 aa21.21■□□□□ 0.99
RBBP4-218ENST00000527118 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
RBBP4-218ENST00000527118 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.2■□□□□ 0.99
RBBP4-218ENST00000527118 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.2■□□□□ 0.98
RBBP4-218ENST00000527118 AK7Q96M32 723 aa21.2■□□□□ 0.98
RBBP4-218ENST00000527118 ATG3Q9NT62 314 aa21.2■□□□□ 0.98
RBBP4-218ENST00000527118 KDRP35968 1356 aa21.2■□□□□ 0.98
RBBP4-218ENST00000527118 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
RBBP4-218ENST00000527118 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
RBBP4-218ENST00000527118 MSL1Q68DK7 614 aa21.19■□□□□ 0.98
RBBP4-218ENST00000527118 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.19■□□□□ 0.98
RBBP4-218ENST00000527118 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.19■□□□□ 0.98
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