RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.59
PTPRK-218ENST00000525459 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.59
PTPRK-218ENST00000525459 MRS2Q9HD23 443 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRK-218ENST00000525459 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.587e-19■□□□□ 9.8
PTPRK-218ENST00000525459 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PTPRK-218ENST00000525459 CCER2I3L3R5 266 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRK-218ENST00000525459 EXOC5O00471 708 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRK-218ENST00000525459 FCHSD2O94868 740 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRK-218ENST00000525459 HMOX1P09601 288 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRK-218ENST00000525459 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRK-218ENST00000525459 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRK-218ENST00000525459 SPG7Q9UQ90 795 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRK-218ENST00000525459 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRK-218ENST00000525459 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRK-218ENST00000525459 PDE3BQ13370 1112 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRK-218ENST00000525459 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PTPRK-218ENST00000525459 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRK-218ENST00000525459 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PTPRK-218ENST00000525459 NEFMP07197 916 aa24.89■■□□□ 1.57
PTPRK-218ENST00000525459 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.89■■□□□ 1.57
PTPRK-218ENST00000525459 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PTPRK-218ENST00000525459 SBF2Q86WG5 1849 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRK-218ENST00000525459 PRKAR2BP31323 418 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRK-218ENST00000525459 BCL9O00512 1426 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC184Q52MB2 194 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRK-218ENST00000525459 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRK-218ENST00000525459 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRK-218ENST00000525459 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PTPRK-218ENST00000525459 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRK-218ENST00000525459 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRK-218ENST00000525459 MIER1Q8N108 512 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRK-218ENST00000525459 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRK-218ENST00000525459 NHSQ6T4R5 1651 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRK-218ENST00000525459 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRK-218ENST00000525459 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRK-218ENST00000525459 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRK-218ENST00000525459 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRK-218ENST00000525459 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PTPRK-218ENST00000525459 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRK-218ENST00000525459 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
PTPRK-218ENST00000525459 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRK-218ENST00000525459 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PTPRK-218ENST00000525459 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRK-218ENST00000525459 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRK-218ENST00000525459 ITGB4P16144 1822 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRK-218ENST00000525459 CYP27B1O15528 508 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRK-218ENST00000525459 PHKG2P15735 406 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRK-218ENST00000525459 RUNDC1Q96C34 613 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRK-218ENST00000525459 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRK-218ENST00000525459 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRK-218ENST00000525459 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRK-218ENST00000525459 MAP3K5Q99683 1374 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRK-218ENST00000525459 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRK-218ENST00000525459 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PTPRK-218ENST00000525459 DCAF5Q96JK2 942 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRK-218ENST00000525459 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRK-218ENST00000525459 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRK-218ENST00000525459 BTAF1O14981 1849 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRK-218ENST00000525459 MRC1P22897 1456 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRK-218ENST00000525459 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
PTPRK-218ENST00000525459 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.7■■□□□ 1.55
PTPRK-218ENST00000525459 NFE2L2Q16236 605 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRK-218ENST00000525459 ILDR2Q71H61 639 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRK-218ENST00000525459 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
PTPRK-218ENST00000525459 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PTPRK-218ENST00000525459 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PTPRK-218ENST00000525459 FAM182BQ5T319 152 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRK-218ENST00000525459 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRK-218ENST00000525459 EP400Q96L91 3159 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRK-218ENST00000525459 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PTPRK-218ENST00000525459 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRK-218ENST00000525459 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC125Q86Z20 511 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRK-218ENST00000525459 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
PTPRK-218ENST00000525459 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.64■■□□□ 1.53
PTPRK-218ENST00000525459 NGEFQ8N5V2 710 aa24.64■■□□□ 1.53
PTPRK-218ENST00000525459 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
PTPRK-218ENST00000525459 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRK-218ENST00000525459 PAPPAQ13219 1627 aa24.62■■□□□ 1.53
PTPRK-218ENST00000525459 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PTPRK-218ENST00000525459 RIPK4P57078 832 aa24.62■■□□□ 1.53
PTPRK-218ENST00000525459 APAF1O14727 1248 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRK-218ENST00000525459 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRK-218ENST00000525459 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRK-218ENST00000525459 LY75O60449 1722 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRK-218ENST00000525459 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PTPRK-218ENST00000525459 TRIM37O94972 964 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRK-218ENST00000525459 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
PTPRK-218ENST00000525459 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PTPRK-218ENST00000525459 CABP4P57796 275 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRK-218ENST00000525459 TEFQ10587 303 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRK-218ENST00000525459 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRK-218ENST00000525459 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRK-218ENST00000525459 IL17REQ8NFR9 667 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC27Q2M243 656 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRK-218ENST00000525459 LGR6Q9HBX8 967 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRK-218ENST00000525459 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.56■■□□□ 1.52
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