RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524555.3

SAA2-SAA4-201, Transcript of SAA2-SAA4 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene SAA2-SAA4, Length 743 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 BAG6P46379 1132 aa16.16■□□□□ 0.18
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.16■□□□□ 0.18
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 DUSP27Q5VZP5 1158 aa16.15■□□□□ 0.18
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PHACTR3Q96KR7 559 aa16.15■□□□□ 0.18
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ABCA3Q99758 1704 aa16.15■□□□□ 0.18
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 MYH16Q9H6N6 1097 aa16.15■□□□□ 0.18
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 AEBP1Q8IUX7 1158 aa16.14■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 GAS2L2Q8NHY3 880 aa16.14■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 TRIM35Q9UPQ4 493 aa16.14■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CHRNA2Q15822 529 aa16.13■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ANKRD24Q8TF21 1146 aa16.13■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa16.13■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 RGPD2P0DJD1 1756 aa16.13■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 RCAN3Q9UKA8 241 aa16.12■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ERBB3P21860 1342 aa16.12■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 KIAA0232Q92628 1395 aa16.12■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa16.12■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 NCAPD2Q15021 1401 aa16.11■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 NWD2Q9ULI1 1742 aa16.11■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 BRWD3Q6RI45 1802 aa16.1■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 FAM83GA6ND36 823 aa16.1■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 NBPF6Q5VWK0 638 aa16.1■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 NBPF4Q96M43 638 aa16.1■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PRDM11Q9NQV5 511 aa16.1■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 AXIN2Q9Y2T1 843 aa16.1■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 RNF123Q5XPI4 1314 aa16.09■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 LMO7Q8WWI1 1683 aa16.08■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa16.08■□□□□ 0.17
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 AMOTQ4VCS5 1084 aa16.08■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 BTG4Q9NY30 223 aa16.08■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 GNAI1P63096 354 aa16.07■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ERICH6BQ5W0A0 696 aa16.07■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 LRP5O75197 1615 aa16.07■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PLCH1Q4KWH8 1693 aa16.07■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 EP400Q96L91 3159 aa16.07■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa16.06■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 IFT57Q9NWB7 429 aa16.06■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 GNAT3A8MTJ3 354 aa16.04■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 USHBP1Q8N6Y0 703 aa16.04■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CFAP44Q96MT7 982 aa16.04■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 NLRP2Q9NX02 1062 aa16.04■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 WDR17Q8IZU2 1322 aa16.03■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 FANCIQ9NVI1 1328 aa16.03■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa16.03■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 MAP3K5Q99683 1374 aa16.02■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ZNF853P0CG23 659 aa16.02■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 EVA1CP58658 441 aa16.02■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 FKBP8Q14318 412 aa16.02■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa16.01■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa16.01■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 TATP17735 454 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 RRP1P56182 461 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ZNF428Q96B54 188 aa16.01■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 STRN4Q9NRL3 753 aa16.01■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 AKAP4Q5JQC9 854 aa16■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 BABAM1Q9NWV8 329 aa16■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 C1orf141Q5JVX7 400 aa15.99■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa15.99■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.99■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SPG7Q9UQ90 795 aa15.99■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 FAM196AQ6ZSG2 479 aa15.98■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 LRRC37A3O60309 1634 aa15.97■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa15.97■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 DISP2A7MBM2 1401 aa15.97■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CRB1P82279 1406 aa15.97■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CHL1O00533 1208 aa15.97■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 DCTN1Q14203 1278 aa15.97■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 FAM182BQ5T319 152 aa15.97■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 MCM10Q7L590 875 aa15.97■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 NRAPQ86VF7 1730 aa15.97■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 MBIPQ9NS73 344 aa15.96■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PKD1L3Q7Z443 1732 aa15.96■□□□□ 0.15
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 RARSP54136 660 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa15.95■□□□□ 0.14
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa15.94■□□□□ 0.14
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 TRIM37O94972 964 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms