RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522224.3

TBC1D9B-216, Transcript of TBC1 domain family member 9B, humanhuman

TSL 5

Gene TBC1D9B, Length 532 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9B-216ENST00000522224 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TBC1D9B-216ENST00000522224 PANK3Q9H999 370 aa25.18■■□□□ 1.62
TBC1D9B-216ENST00000522224 STK32BQ9NY57 414 aa25.18■■□□□ 1.62
TBC1D9B-216ENST00000522224 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.16■■□□□ 1.62
TBC1D9B-216ENST00000522224 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
TBC1D9B-216ENST00000522224 SPON1Q9HCB6 807 aa25.15■■□□□ 1.62
TBC1D9B-216ENST00000522224 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TBC1D9B-216ENST00000522224 SLC15A2Q16348 729 aa25.13■■□□□ 1.61
TBC1D9B-216ENST00000522224 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TBC1D9B-216ENST00000522224 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.12■■□□□ 1.61
TBC1D9B-216ENST00000522224 POLKQ9UBT6 870 aa25.11■■□□□ 1.61
TBC1D9B-216ENST00000522224 BTAF1O14981 1849 aa25.09■■□□□ 1.61
TBC1D9B-216ENST00000522224 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.09■■□□□ 1.61
TBC1D9B-216ENST00000522224 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.09■■□□□ 1.61
TBC1D9B-216ENST00000522224 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TBC1D9B-216ENST00000522224 ZBTB7AO95365 584 aa25.07■■□□□ 1.6
TBC1D9B-216ENST00000522224 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.06■■□□□ 1.6
TBC1D9B-216ENST00000522224 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.06■■□□□ 1.6
TBC1D9B-216ENST00000522224 NSD2O96028 1365 aa25.05■■□□□ 1.6
TBC1D9B-216ENST00000522224 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.05■■□□□ 1.6
TBC1D9B-216ENST00000522224 MORC1Q86VD1 984 aa25.05■■□□□ 1.6
TBC1D9B-216ENST00000522224 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.05■■□□□ 1.6
TBC1D9B-216ENST00000522224 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.05■■□□□ 1.6
TBC1D9B-216ENST00000522224 EYA1Q99502 592 aa25.04■■□□□ 1.6
TBC1D9B-216ENST00000522224 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.03■■□□□ 1.6
TBC1D9B-216ENST00000522224 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9B-216ENST00000522224 SPG7Q9UQ90 795 aa25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9B-216ENST00000522224 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9B-216ENST00000522224 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.02■■□□□ 1.6
TBC1D9B-216ENST00000522224 CASZ1Q86V15 1759 aa25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9B-216ENST00000522224 CYP27B1O15528 508 aa25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9B-216ENST00000522224 KCNQ4P56696 695 aa25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9B-216ENST00000522224 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.01■■□□□ 1.59
TBC1D9B-216ENST00000522224 ZNF827Q17R98 1081 aa25■■□□□ 1.59
TBC1D9B-216ENST00000522224 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TBC1D9B-216ENST00000522224 NCAPD2Q15021 1401 aa24.99■■□□□ 1.59
TBC1D9B-216ENST00000522224 PAPPAQ13219 1627 aa24.98■■□□□ 1.59
TBC1D9B-216ENST00000522224 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.98■■□□□ 1.59
TBC1D9B-216ENST00000522224 MTFR1LQ9H019 292 aa24.98■■□□□ 1.59
TBC1D9B-216ENST00000522224 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
TBC1D9B-216ENST00000522224 AKT1S1Q96B36 256 aa24.96■■□□□ 1.59
TBC1D9B-216ENST00000522224 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.95■■□□□ 1.58
TBC1D9B-216ENST00000522224 PTGER2P43116 358 aa24.94■■□□□ 1.58
TBC1D9B-216ENST00000522224 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.581e-8■□□□□ 8.1
TBC1D9B-216ENST00000522224 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.92■■□□□ 1.58
TBC1D9B-216ENST00000522224 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.92■■□□□ 1.58
TBC1D9B-216ENST00000522224 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.91■■□□□ 1.58
TBC1D9B-216ENST00000522224 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
TBC1D9B-216ENST00000522224 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
TBC1D9B-216ENST00000522224 PALLDQ8WX93 1383 aa24.91■■□□□ 1.58
TBC1D9B-216ENST00000522224 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.9■■□□□ 1.58
TBC1D9B-216ENST00000522224 PHKG2P15735 406 aa24.89■■□□□ 1.58
TBC1D9B-216ENST00000522224 LY75O60449 1722 aa24.89■■□□□ 1.57
TBC1D9B-216ENST00000522224 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.88■■□□□ 1.57
TBC1D9B-216ENST00000522224 PIGBQ92521 554 aa24.88■■□□□ 1.57
TBC1D9B-216ENST00000522224 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
TBC1D9B-216ENST00000522224 MSH5O43196 834 aa24.87■■□□□ 1.57
TBC1D9B-216ENST00000522224 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.87■■□□□ 1.57
TBC1D9B-216ENST00000522224 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
TBC1D9B-216ENST00000522224 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.86■■□□□ 1.57
TBC1D9B-216ENST00000522224 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
TBC1D9B-216ENST00000522224 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
TBC1D9B-216ENST00000522224 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
TBC1D9B-216ENST00000522224 ARXQ96QS3 562 aa24.85■■□□□ 1.57
TBC1D9B-216ENST00000522224 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.85■■□□□ 1.57
TBC1D9B-216ENST00000522224 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.85■■□□□ 1.57
TBC1D9B-216ENST00000522224 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.84■■□□□ 1.57
TBC1D9B-216ENST00000522224 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
TBC1D9B-216ENST00000522224 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
TBC1D9B-216ENST00000522224 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.83■■□□□ 1.57
TBC1D9B-216ENST00000522224 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.83■■□□□ 1.57
TBC1D9B-216ENST00000522224 POLD1P28340 1107 aa24.82■■□□□ 1.56
TBC1D9B-216ENST00000522224 MTHFSP49914 203 aa24.82■■□□□ 1.56
TBC1D9B-216ENST00000522224 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.82■■□□□ 1.56
TBC1D9B-216ENST00000522224 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
TBC1D9B-216ENST00000522224 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TBC1D9B-216ENST00000522224 IL13P35225 146 aa24.81■■□□□ 1.56
TBC1D9B-216ENST00000522224 SYT17Q9BSW7 474 aa24.81■■□□□ 1.56
TBC1D9B-216ENST00000522224 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TBC1D9B-216ENST00000522224 KLHL34Q8N239 644 aa24.79■■□□□ 1.56
TBC1D9B-216ENST00000522224 AK7Q96M32 723 aa24.79■■□□□ 1.56
TBC1D9B-216ENST00000522224 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.79■■□□□ 1.56
TBC1D9B-216ENST00000522224 ITGB4P16144 1822 aa24.78■■□□□ 1.56
TBC1D9B-216ENST00000522224 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.78■■□□□ 1.56
TBC1D9B-216ENST00000522224 DCAF5Q96JK2 942 aa24.78■■□□□ 1.56
TBC1D9B-216ENST00000522224 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.78■■□□□ 1.56
TBC1D9B-216ENST00000522224 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.77■■□□□ 1.56
TBC1D9B-216ENST00000522224 SIK1P57059 783 aa24.77■■□□□ 1.56
TBC1D9B-216ENST00000522224 C5P01031 1676 aa24.77■■□□□ 1.56
TBC1D9B-216ENST00000522224 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.76■■□□□ 1.55
TBC1D9B-216ENST00000522224 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.76■■□□□ 1.55
TBC1D9B-216ENST00000522224 ATG3Q9NT62 314 aa24.75■■□□□ 1.55
TBC1D9B-216ENST00000522224 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.75■■□□□ 1.55
TBC1D9B-216ENST00000522224 ATP6V1AP38606 617 aa24.74■■□□□ 1.55
TBC1D9B-216ENST00000522224 CABP4P57796 275 aa24.74■■□□□ 1.55
TBC1D9B-216ENST00000522224 KDRP35968 1356 aa24.74■■□□□ 1.55
TBC1D9B-216ENST00000522224 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
TBC1D9B-216ENST00000522224 MSL1Q68DK7 614 aa24.73■■□□□ 1.55
TBC1D9B-216ENST00000522224 PHF14O94880 888 aa24.72■■□□□ 1.55
TBC1D9B-216ENST00000522224 HMOX1P09601 288 aa24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms