RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa3.34□□□□□ -1.87
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VSIG10Q8N0Z9 540 aa3.34□□□□□ -1.87
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MBIPQ9NS73 344 aa3.34□□□□□ -1.87
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SHISA8B8ZZ34 492 aa3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BCRP11274 1271 aa3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COL8A1P27658 744 aa3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRIM22Q8IYM9 498 aa3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AK7Q96M32 723 aa3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYLDQ9NQC7 956 aa3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAP3K10Q02779 954 aa3.32□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZBTB33Q86T24 672 aa3.32□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q8N3U1 123 aa3.32□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FURINP09958 794 aa3.31□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BAG6P46379 1132 aa3.31□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP3.31□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OIP5O43482 229 aa3.3□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCTRP47872 440 aa3.3□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POU4F2Q12837 409 aa3.3□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRIM34Q9BYJ4 488 aa3.3□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SUV39H2Q9H5I1 410 aa3.3□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC24A3Q9HC58 644 aa3.3□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPSM3Q9Y4H4 160 aa3.3□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1W2PRU2 124 aa3.29□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PHF20L1A8MW92 1017 aa3.29□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTK2Q05397 1052 aa3.29□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NBPF20Q3BBV1 942 aa3.29□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP2R2DQ66LE6 453 aa3.29□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa3.29□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NEDD1Q8NHV4 660 aa3.29□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa3.29□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GRIP2Q9C0E4 1043 aa3.29□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HCN2Q9UL51 889 aa3.29□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DYRK1BQ9Y463 629 aa3.29□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MEN1O00255 615 aa3.28□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPR37L1O60883 481 aa3.28□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AP1G2O75843 785 aa3.28□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00114Q6XXX2 140 aa3.28□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa3.28□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NBPF15Q8N660 670 aa3.28□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GALNT6Q8NCL4 622 aa3.28□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ENAMQ9NRM1 1142 aa3.28□□□□□ -1.88
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa3.27□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C2CD2LO14523 706 aa3.27□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 USP17L8P0C7I0 530 aa3.27□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MX2P20592 715 aa3.27□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPC1P35052 558 aa3.27□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHRNA4P43681 627 aa3.27□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERVK-9P63128 1117 aa3.27□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SH3D19Q5HYK7 790 aa3.27□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLRG1Q96E93 195 aa3.27□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GMCL1Q96IK5 515 aa3.27□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OSBPL3Q9H4L5 887 aa3.27□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRC4BQ9NT99 713 aa3.27□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa3.26□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FBXO45P0C2W1 286 aa3.26□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLN3Q13286 438 aa3.26□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PODNQ7Z5L7 613 aa3.26□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD163Q86VB7 1156 aa3.26□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.26□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM117AQ9C073 453 aa3.26□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RSPH6AQ9H0K4 717 aa3.26□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa3.26□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPAMQ9HCL2 828 aa3.26□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB6BQ9NRW1 208 aa3.26□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HRH3Q9Y5N1 445 aa3.26□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAK2O60296 914 aa3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL2RAP01589 272 aa3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEPT12Q8IYM1 358 aa3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NDFIP2Q9NV92 336 aa3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WASLO00401 505 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STAU1O95793 577 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 F11P03951 625 aa3.24□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GRIN2CQ14957 1233 aa3.24□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa3.24□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRERF1Q96PN7 1200 aa3.24□□□□□ -1.89
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
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